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许三岗
作品数:
2
被引量:3
H指数:1
供职机构:
北京协和医学院
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发文基金:
国家科技基础条件平台建设计划
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
庄永龙
中国医学科学院北京协和医学院基...
单广良
中国医学科学院北京协和医学院基...
王恒
中国医学科学院北京协和医学院基...
郝志勇
中国医学科学院北京协和医学院基...
杨啸林
中国医学科学院北京协和医学院基...
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庄永龙
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1篇
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致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建
被引量:1
2012年
为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fisher's精确检验R程序包对Gene Ontology和Pathway的注释结果进行富集效应分析,并调用Graphviz工具对蛋白质相互作用结果进行图形化描述。致病疟原虫分子功能注释二级数据库提供多入口的分子注释类型,使Gene Ontology、Pathway及蛋白质相互作用注释信息以图形化界面直观显示。该数据库为疟原虫致病分子机制研究提供良好的高通量数据分析工具,可有效促进疟原虫基因功能、信号通路及疟疾疫苗抗原筛选等方面的研究。
许三岗
庄永龙
郝志勇
单广良
杨啸林
王恒
关键词:
疟原虫
功能注释
疟原虫分子功能注释二级数据库的构建
疟原虫分子功能注释二级数据库的构建 目的: (1)为了更好地对疟原虫分子机制研究过程中产生的实验数据进行分子功能注释分析,构建疟原虫分子功能注释数据库PlasmoFADB。 (2)开发一个数据注释结果界...
许三岗
关键词:
疟原虫
基因表达谱
蛋白质相互作用
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