胡健
- 作品数:4 被引量:4H指数:1
- 供职机构:中国药科大学生命科学与技术学院更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 生物信息学方法在判断DNA结合蛋白质和预测结合位点中的应用被引量:3
- 2009年
- 综述生物信息学方法在判断DNA结合蛋白质和预测结合位点中的应用研究进展。蛋白质与DNA间的相互作用是基因表达调控的分子生物学基础,因此DNA结合蛋白的判断以及DNA与蛋白质间作用位点的预测一直以来都是分子生物学和生物信息学的前沿领域。采用生物信息学方法进行这类判断和预测,具有省时、省力的特点,近年来吸引了众多科学家的关注。
- 刘子朋章宏九李雅晴朱云蛟胡健方慧生
- 关键词:生物信息学DNA结合蛋白
- 蛋白质结构比较模建的研究进展
- 2009年
- 比较模建也叫同源模建,其原理是蛋白质三级结构远比一级结构保守,因此即使蛋白质序列有明显差别,它们的功能仍然可能非常相似。由于实验方法得到目的蛋白的结构困难较多而且需要较长时间,比较模建可构建实验需要的结构模型用于提出关于一种蛋白质功能的假设并指导进一步的实验工作。比较模建一般分为四步,构建产生的结构模型常用于蛋白质与蛋白质相互作用预测,蛋白质之间的对接,分子对接以及有机体基因组中已鉴定基因的功能注解。
- 胡健方慧生陈凯先
- 一种孕激素受体拮抗剂先导化合物的分子对接研究
- 2015年
- 双酚A(bisphenol A,BPA)是一种常见的内分泌干扰物,对人类具有多重影响。其代谢产物具有更强的受体结合能力,如4-甲基-2,4-二(4-羟苯基)-戊-1-烯(MBP)对雌激素受体的结合能力比双酚A高3~4个数量级。某些芳香族β-氨基酮衍生物的结构与MBP类似,并且对孕激素受体具有程度不等的竞争性抑制作用。该课题采用分子对接方法计算了MBP与孕激素受体的结合自由能并与芳香族β-氨基酮衍生物相对照,结果表明MBP具有与芳香族β-氨基酮衍生物类似的结合能力,有必要在后续的研究中探索其竞争性抑制的作用机理并考虑其作为新型非甾体类孕激素抑制剂先导化合物的可能性。
- 胡健刘嘉茵
- 关键词:孕激素受体分子对接
- 基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法被引量:1
- 2009年
- 目的:建立蛋白质多重序列的质量评估法。方法:假定在多重序列比对中的一条序列是未知的,以其他序列作为模板,通过将模板蛋白质的三维结构作为未知蛋白质的预测模型,进而比较预测与实际结构的相似性,将它们的平均值作为多重序列比对的质量。结果:通过SCOP数据库的检验,所得的质量标准与专家分类的标准基本一致。结论:本方法是一种有效的蛋白质多重序列比对的质量评估法。
- 康勍胡健戚兴保方慧生陈凯先
- 关键词:蛋白质结构