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基于SSR标记的白榆资源遗传多样性分析: 2025年; 为明确白榆种质资源的亲缘关系,了解种质的遗传基础,为资源保护和品种选育提供依据,采用SSR分子标记对河北省邓栅子林场白榆国家林木种质资源库中的83份白榆种质资源进行了遗传多样性与聚类分析。结果表明:(1)11对引物共扩增出59条多态性条带,多态性比率达98.33%。平均多态性信息含量(PIC)为0.6980。(2)平均等位基因数(Na)为1.9833,平均有效等位基因数(Ne)为1.3011,平均Nei’s基因多样性指数(H)为0.2040,平均Shannon多样性指数(I)为0.3387,白榆种质资源在DNA水平上存在丰富的遗传变异。(3)群体间的遗传分化系数(Gst)为0.1238,白榆群体内部遗传变异显著高于群体间变异。遗传距离和遗传相似性分析发现,参试3个群体的亲缘关系较近,遗传背景相似。(4)83份白榆种质平均遗传距离为0.6201,经UPMGA聚类分析,可将白榆种质分为6个类群,聚类结果分析和主成分分析结果一致性较强。研究发现邓栅子林场来自不同地区的白榆种质资源遗传多样性较为丰富,亲缘关系较近。; 王琦崔宏新武立东张子杰; 关键词：SSR分子标记白榆种质资源

基于SSR标记的海南油茶DNA指纹图谱构建: 2025年; 为有效对海南油茶优良无性系品种进行鉴别,使之更有效、长期地应用于市场,推动海南油茶产业发展,本研究基于已开发的16对SSR引物对20个海南省林木品种审定委员会认定的油茶良种进行PCR扩增及指纹图谱构建,PCR产物经毛细管电泳得到等位基因分型峰图,显示引物SJMCoa003的多态性最为丰富,可以同时鉴定出4个油茶品种。由基因座信息做出的SSR指纹图谱显示除品种‘海林1号’、‘琼东2号’、‘琼东8号’、‘侯臣3号’、‘万海1号’无法由单一引物对扩增鉴别出外,其余品种均具有多个专一引物,这五个品种还可经由2~3个引物对联合鉴别即可区分。由基因座信息计算得出的遗传距离及相应进化树显示当遗传距离小于0.05时各个供试品种均可明显被区分出来。根据创建的指纹图谱和聚类树,20个油茶品种可被简单高效区分出来,这为油茶良种投入市场后的规范使用提供了理论支持。同时聚类结果还表明海南油茶品种遗传变异丰富,为油茶品种选育打下基础,SSR指纹图谱亦可为新品种鉴定提供支撑,推动海南油茶产业科学研究进一步发展。; 赵欣宋家明张敬涛黄东益胡海燕吴文嫱刘进平赖杭桂; 关键词：SSR标记指纹图谱

雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异: 2025年; 【目的】探究不同种群雌性榧树Torreya grandis种实性状,基于简单重复序列标记(SSR)引物对榧树的种群遗传变异进行分析,比较榧树种群间、种群内种实表型、品质及遗传多样性的差异。【方法】以浙江富阳、嵊州、临安、建德及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过方差分析、主成分分析对榧树叶片及种实表型进行比较;以浙江富阳、嵊州、临安、淳安及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过SSR分子标记对榧树遗传多样性进行比较。【结果】榧树种实分析发现:叶质量、叶形指数、种实质量、种形指数、种核质量、核形指数、假种皮厚、种壳厚等8个指标在种群间和种群内个体差异极显著(P<0.01);脂肪相对含量及可溶性糖质量分数在种群间差异极显著(P<0.01),脂肪相对含量为29.36%~42.35%,榧树种实外观和种仁品质变异丰富。SSR引物分析发现:榧树种群的Nei’s遗传多样性指数(H)均值为0.400,Shannon’s信息指数(I)均值为0.650,多态性信息含量(P_(IC))均值为0.400。淳安种群的遗传多样性(H=0.410,I=0.658)最高,嵊州种群(H=0.369,I=0.565)最低。92%总遗传变异存在于种群内。【结论】榧树种实的表型、品质在种群间和种群内存在遗传变异,淳安种群遗传多样性最高,且种群内遗传变异大于种群间。; 李柯豫陈荣刘琏蔡晓郡姜郑楚谢前丹俞晨良喻卫武; 关键词：榧树不饱和脂肪酸可溶性糖 SSR标记

椰子种质资源脂肪酸性状与SSR标记关联分析: 2025年; 椰子是热带重要的果树和木本油料作物。椰子是中链脂肪酸的主要来源,但椰子脂肪酸积累的机制尚不清楚,制约了椰子脂肪酸品质的改良。为了发掘我国椰子种质资源脂肪酸性状相关分子标记,开展150份椰子种质资源的脂肪酸性状变异分析和SSR标记的关联分析。结果表明,供试种质椰肉脂肪酸组分包含己酸、辛酸、癸酸、月桂酸、肉豆蔻酸、棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸;其中,己酸的变异系数最大,为33.00%。与含油量相关联的分子标记WC3271,与月桂酸含量相关联的分子标记WC1028,可以作为椰子脂肪酸改良的候选分子标记。; 张照华李和帅周德弓淑芳刘蕊; 关键词：椰子脂肪酸 SSR

基于SSR标记的牡丹品种鉴定技术标准体系的构建: 2025年; 【目的】建立牡丹品种鉴定的简单重复序列(SSR)标记标准技术体系,筛选出多态性高、重复性好的牡丹SSR核心引物和参照品种,并确定品种差异判定标准,为牡丹品种的精准快速鉴定及新品种权审查提供技术支持。【方法】以9个野生牡丹种和5个具有代表性品种群、9种花型及11种花色的48个常见栽培品种为试验材料,通过收集引物信息、核对DNA序列信息、重新设计引物、分析位点多态性,筛选出SSR核心引物和参照品种,并对SSR位点组合的品种鉴别力进行分析与评价。【结果】在10个SSR位点中,9个野生种和48个品种共检测到84个等位基因。等位基因数为4~12个;多态性信息含量为0.572~0.837,均值为0.712。SSR位点组合的品种鉴别能力分析结果显示:当差异位点为1个时,至少需要5对引物才可完全区分48个品种;而当差异位点为2个时,至少需要8对引物才能完全区分48个品种。【结论】筛选出的17个参照品种和10个SSR位点在所有牡丹品种群中均表现出良好的鉴别能力。最终确定了以1个差异位点为鉴定标准的牡丹品种SSR标记技术体系。; 张雨婷于雪丹郑勇奇郑勇奇张川红赵国栋李伟李丰钰; 关键词：SSR标记分子身份证

中国水稻品种鉴定标准SSR标记的基因组特征研究: 2025年; 在我国各级水稻新品种区域试验和审定流程中,主要依据《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法》判别参试品种在试验周期内的一致性及其与已审定品种的差异性。鉴于SSR(简单重复序列)标记开发初期,水稻基因组学研究尚处于起步阶段,这些标记主要基于有限品种的SSR多态性分析结果来确定,因此对于采用该48个SSR作为品种区分依据的有效性和科学性,实际上缺乏足够的认识。本研究通过引物序列比对分析,精确定位了这48个SSR标记在水稻基因组中的具体位置,旨在探讨这些SSR标记在水稻基因组上的分布特征,并评估其变异可能引发的生物学效应。我们利用SSR标记引物对公共基因组组装数据进行扩增,并分析扩增序列标记,测定了这些标记在籼、粳亚种群体中的多态性。结果表明,这48个标记在水稻的12条染色体上呈不均匀分布。其中,35个标记位于基因内部或上下游2.0 kb内,3个标记位于基因的外显子区,但SSR重复单元的增减并未导致移码突变的发生。在分析的193份亚洲代表性栽培稻品种中,有3个标记在粳稻群体(58个品种)中未表现出多态性,多态性信息含量(PIC)为0,另有8个标记在粳稻群体中的多态性低(PIC<0.25);同样,在籼稻群体(135个品种)中,也有5个标记多态性低(PIC<0.25)。此外,在扩增区段内,除重复单元外,还观察到了单核苷酸变异以及插入、缺失变异。本研究不仅揭示了这48个SSR标记的基因组学特征,还明确指出,在代表性群体中,少数SSR标记仍缺乏足够的品种鉴别能力,同时,我们还发现了SSR标记内部重复序列外的核苷酸变异,这为优化现有SSR标记开发新的水稻品种鉴定SSR标记,以及科学认识现有SSR标记在品种鉴别中的局限性提供了重要方向和启示。; 何雨欣于清涛谭瑗瑗舒庆尧刘乃新刘振; 关键词：水稻 SSR标记多态性品种区试品种审定

杏与扁桃属间远缘杂交后代的SSR标记亲子鉴定: 2025年; 杏(Armeniaca vulgaris)与扁桃(Amygdalus communis)进行远缘杂交育种,开放式授粉获得的杂种纯度较低,为了提高育种效率,需要在苗期对杂交子代进行鉴定。以母本为龙王帽、父本不完全确定的3个疑似来源于杏与扁桃远缘杂交的子代个体为对象,选用了15个多态性和扩增效率较高的SSR(Simple Sequence Repeat)位点,通过荧光修饰引物结合毛细管电泳分型技术,对3个亲本和3个子代进行基因分型,并计算了等位基因频率、亲权指数和亲子关系概率(RCP)。结果发现,15个SSR位点在6份材料中共检测到78个等位基因,各位点的等位基因数介于4~7个之间。子代A1和B1与其疑似亲本间的累积RCP值均高于99.99%,并由此断定远缘杂交后代A1是来源于父本蒙特瑞(Monterey)扁桃,而辛普森(Thompson)是子代B1的真实父本。15个位点中子代B2均未出现其假定父本扁桃2号的等位基因,从而排除它们之间有亲缘关系。亲子鉴定结果与聚类分析显示的亲缘关系相符合。另外,通过分析SSR位点的数量与累积RCP值之间的关系发现,基于这些SSR位点对杏与扁桃远缘杂交后代进行亲子鉴定时,需要选用9个以上的位点。此方法可用来鉴定杏与扁桃属间远缘杂交后代的所有个体。; 张俊环张美玲杨丽姜凤超王玉柱于文剑孙浩元; 关键词：扁桃远缘杂交 SSR标记亲子鉴定

一种基于EST-SSR标记的新疆沙冬青种质资源鉴定方法: 本发明公开了一种基于EST‑SSR标记的新疆沙冬青种质资源鉴定方法，属于分子遗传学技术领域。本发明使用生物信息学方法，筛选出适宜新疆沙冬青种质资源鉴定的EST‑SSR分子标记组合，所述EST‑SSR分子标记组合包括分子标...; 师玮王建成刘忠军王少杰刘京典马灵灵路中臣李雪溶魏萌萌

新疆主要酿酒葡萄种质资源的SSR标记分析及数字指纹构建: 2025年; 新疆酿酒葡萄种质资源丰富,存在遗传背景复杂及品种混杂等问题,为有效区分和合理利用新疆主栽酿酒葡萄种质资源,汇集新疆110份种质为试材,利用筛选出多态性好的SSR引物进行PCR扩增,对多态性、遗传多样性和遗传距离进行分析,并构建种质数字指纹。结果表明:从76对SSR引物中筛选出30对多态性丰富的引物,共扩增出等位基因位点391个,多态率高达97.164%,其中引物VVIV67条带数最多,为22条。各位点平均观测杂合度(Ho)为0.671,期望杂合度(He)为0.790,Shannon多样性指数(I)在1.142~2.627,PIC平均值为0.766。遗传距离变化主要在0.500~1.000,占整体的92.399%。聚类树将供试材料分为6组,其中第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组多来源于由法国、苏联、美国、意大利等国家引进的酿酒葡萄品种,第Ⅳ、Ⅴ组多来源于中国山葡萄品种种间和种内杂交种;第Ⅵ组基本为中国自主选育的山葡萄品种。数字指纹能够将各种质进行准确鉴定,其中‘11-22-16’和‘12-10-60’‘克里木波西’和‘赤霞珠170’‘盖吾沙’和‘塔夫里斯’‘紫晶梦露’和‘1-5-7’可能存在同物异名。新疆主栽酿酒葡萄SSR位点丰富,可用性较强,试材具有丰富的遗传多样性,可为酿酒葡萄种质资源利用和品种选育提供参考依据。; 王季姣王世伟李亚兰杨涛李树德王宝庆潘越; 关键词：酿酒葡萄 SSR标记种质资源数字指纹

基于SSR标记对69份玉米种质资源的遗传多样性分析: 2025年; 为了拓宽河北省玉米自交系的遗传基础,加快优异种质的开发与利用,利用SSR标记对39个自交系和30个品种进行遗传多样性分析。结果表明,32个多态性SSR标记共扩增出97个等位基因,平均每对引物扩增3个等位基因,多态性位点百分率为68.75%。引物的平均有效等位基因数、香农信息指数、期望杂合度和PIC值分别为1.40、0.31、0.20和0.27。玉米群体的遗传距离介于0.103~0.844,自交系与河北省及北京市的品种基因交流最为密切,亲缘关系较近,遗传距离较小,分别为0.140和0.155,一定程度上呈现出遗传距离和地理距离的相关性。聚类分析将参试材料划为5个类群,自交系被明显区分开;东北三省、甘肃省及部分河北省与北京市的品种被聚为一类,且大部分品种育成地农作物为一年一熟,8个早熟品种紧密接近,说明SSR标记可以一定程度上区分出种质类型。自交系的遗传多样性最高且纯度较高,可以进一步选育利用。; 常宏兵王晨何美敬曹熙敏俞凤芳曹晓良宋炜吕爱枝; 关键词：SSR标记玉米种质资源

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