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茄子全基因组SNP标记的开发: 2025年; 茄子(Solanum melongena L.)是中国重要的茄科蔬菜之一,其具有十分丰富的遗传多样性,对茄子种质资源进行精准评价是利用茄子种质资源的基础。利用40份茄子(Solanum melongena L.)种质资源的重测序数据,筛选了268个SNP位点用于五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)-SNP标记的开发,成功获得原创性的120个PARMS-SNP标记。利用这些标记对224份茄子高代自交系进行基因分型,并进一步进行群体结构、PCA主成分分析和遗传树分析。结果表明该224份材料可以分为两个组。同时根据多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)值筛选了48个核心PARMS-SNP标记,并且构建了能够将224份材料进行区分的指纹图谱。; 肖熙鸥聂珩林文秋吴彩玉; 关键词：茄子 SNP标记遗传多样性分析指纹图谱

一种提高山羊体重的SNP标记及其应用: 本发明公开一种与山羊体重相关的SNP标记及其应用。该标记位于山羊6号染色体的FAM184B基因的外显子上，具体的SNP标记为序列表中SEQ ID NO:1的第426bp处的T/C碱基突变，TT和TC基因型的体重显著高于C...; 刘桂琼姜勋平陈孟雅帖卓英杨世平王贝贝

利用核心SNP标记构建豆类蔬菜品种指纹图谱: 2025年; 豆类蔬菜是我国重要的蔬菜作物。为促进豆类蔬菜品种权保护,以豇豆和菜用豌豆为研究对象,分别利用物种特异的核心单核苷酸多态性(SNP)标记构建了52份豇豆品种(系)和48份豌豆种质的DNA指纹图谱,并对14份豇豆品种(系)的种子纯度进行了检测。该研究结果表明,基于竞争性等位基因特异性PCR(KASP)技术的SNP标记可以用于豆类蔬菜品种的品种权保护、种子真伪区分以及种子纯度鉴定,建议尽快制订并发布基于SNP标记的豆类蔬菜品种鉴定技术标准,为种业和产业健康发展提供技术支撑。; 吴新义刘娜汪宝根龚亚明李国景; 关键词：豆类蔬菜 SNP标记种子纯度

基于KASP技术的水牛SNP标记开发及其分子身份证构建: 2025年; 旨在利用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应(competitive allele specific PCR,KASP)技术,探讨水牛分子身份证构建的方法,为今后水牛品种精准鉴定及其品种资源的保护等提供技术支撑。基于水牛基因组重测序获得单核苷酸多态性(SNP)位点信息,筛选合适SNP位点,通过转化标记获得可用于分子身份证构建的SNP位点,进行遗传多样性、群体结构分析,并分别使用二进制和十进制构建14个水牛品种的DNA分子身份证。结果:基于前期研究的10头不同水牛品种基因组重测序数据,筛选获得284个在不同种间有差异且品种内一致的SNPs位点,在40个水牛样本中测序并结合桑格(Sanger)测序验证获得的60个SNPs位点,6个位点未能正常分型,转化成功率为90%,有效等位基因(Ne)平均值为1.522,香农信息指数(SHA)平均值为0.503,观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.182和0.328,多态性信息含量值(PIC)平均值为0.269;除去20个在部分水牛品种中位点缺失的SNPs位点,应用34个SNPs位点进行群体遗传结构分析表明14个水牛品种分为2个类群,其中槟榔江水牛、尼里/拉菲水牛和摩拉水牛的遗传距离与其他11种水牛的较远,同为1个类群;最终根据34个SNPs位点构建了14个水牛品种的分子身份证。综上,应用KASP技术并结合遗传多样性和群体结构分析,成功开发出能精准区分全部供试水牛品种的34个SNPs位点,并构建了14个水牛品种具有唯一性的二进制和十进制分子身份证,说明此方法可有效构建水牛分子身份证。; 庞春英梁莎莎文崇利钟华配韦科龙梁淦梁宇辰陈笑寒黄斌冯玲梁贤威; 关键词：水牛 SNP标记分子身份证

一种LAMA5基因SNP标记在山羊体重选择中的应用: 本发明公开一种与山羊体重相关的LAMA5基因外显子的SNP标记的应用。该标记位于山羊13号染色体的LAMA5基因的外显子上，具体的SNP标记为序列表中SEQ ID NO:1的第320bp处的C/T碱基突变，TT基因型的体...; 刘桂琼姜勋平陈孟雅帖卓英杨世平王贝贝

甜玉米自交系SNP标记遗传多样性及群体遗传结构分析: 2025年; 为了解甜玉米的种质遗传基础,提高甜玉米优良品种选育效率,基于重测序手段进行基因型分型,获得20648个高质量SNP位点,并基于SNP位点对167份甜玉米自交系进行了遗传多样性和群体遗传结构分析。结果表明:167份甜玉米自交系的期望杂合度为0.09—0.50,平均值0.23;观测杂合度为0.0133—0.9521,平均值0.2495。主等位基因频率的变化范围为0.50—0.95,平均值0.85。多态性信息含量的变化范围为0.095—0.500,平均值0.228。群体遗传结构分析表明:当K=3时,交叉验证错误率最低,结合系统发育树,将167份甜玉米自交系划分为3个类群,该类群划分结果与基于种质来源(热带、亚热带和温带)划分结果基本一致。供试群体中甜玉米自交系整体上遗传变异较为丰富,部分类群有较好的应用潜力。本研究可为甜玉米新品种选育和杂种优势群构建提供技术依据。; 夏新然况慧云孙萍东卢媛郑洪建郑洪建张中林王慧; 关键词：甜玉米 SNP标记群体遗传结构

一种与大刺鳅快速生长性状相关的SNP标记及其应用: 本发明属于生物遗传基因和水产生物技术领域，公开了一种与大刺鳅快速生长性状相关的SNP标记及其应用，该SNP标记如SEQ ID NO:1所示，位于棕榈酰蛋白硫酯酶1基因序列中第1305位的碱基位是C或G。本发明还提供了引物...; 韩崇舒琥陈楷淳余志德杨金霖

基于高密度SNP标记对玉米株型相关性状的QTL定位: 2025年; 利用玉米温热改良系QB7866和QB5725构建131份F_(2∶3)家系,对其株高、穗位高、全株叶片数、穗上叶片数、雄穗主轴长和雄穗分枝数进行调查,并结合基因数据进行QTL分析。结果表明,共定位到78个与株型性状相关的QTL,其中,株高13个、穗位高6个、全株叶片数15个、穗上叶片数14个、雄穗主轴长16个、雄穗分枝数14个。; 刘鹏飞郭向阳王安贵聂蕾涂亮吴迅祝云芳蒋喻林陈泽辉; 关键词：玉米 SNP标记 QTL

利用SNP标记对100份玉米种质资源的遗传多样性分析: 2025年; 杂种优势是玉米育种的重要理论基础,杂种优势类群和杂种优势模式的深入研究为玉米品种选育和杂交种的组配方式提供了理论指导。为了提高育种效率,使用60KSNP芯片对100份玉米种质资源进行基因型分析。通过对遗传距离进行聚类分析,将100份玉米自交系划分为3个类群,分别为Reid、Non-Reid和Dom群。遗传相似度的主成分分析结果与遗传距离的聚类分析结果一致。; 孙艳杰魏国才吴雨恒石运强邵勇刘英蕊南元涛张维耀; 关键词：杂种优势玉米 SNP 遗传相似度

利用SNP标记解析速生优质杉木群体的遗传多样性与结构被引量：3: 2025年; 对育种群体遗传多样性及遗传结构的了解有助于林木的遗传改良。本研究基于SLAF-seq技术探究杉木[Cunninghamia lanceolata(Lamb.)Hook.]第三轮遗传改良计划所获得的速生优质(生长和木材基本密度皆优)杉木种质群体的遗传多样性与遗传结构,并捕获核心种质。利用SLAF-seq技术共获得949997个SLAF标签,其中238459个(25.10%)具有多态性。基于上述多态性SLAF标签开发出1408468个SNP标记,筛选143871个SNP位点用于速生优质杉木群体遗传多样性参数进行估算,结果显示群体的He、Ho和I分别为0.2095、0.2731和0.4320,表明群体具有较高的遗传多样性。无性系间遗传距离范围从0.0005至0.2415,平均为0.1531。最大似然法聚类和基于Admixture软件进行的遗传结构分析结果显示,110个无性系可分成3个聚类分支。最后确定了核心子集core 0.5为关键的核心种质群体,该群体涵盖55个无性系,涵盖3个遗传分组,且几乎保留全部的遗传多样性,表明捕获的核心种质遗传基础较宽泛,可作为下一轮杉木速生优质品系杂交组合的亲本。本研究结果为杉木种质资源的有效保存和亲本选配制种提供了重要依据。; 黄荣胡德活邓厚银王润辉韦如萍晏姝郑会全; 关键词：杉木 SNP标记核心种质

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