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利用人工构建RNA编辑酶进行RNA定点编辑及相关应用
提供了利用人工构建RNA编辑酶进行RNA定点编辑及相关应用。提供了将用于结合RNARNA识别结构域(RNA recognition domain)和发挥功能的效用结构域(effector domain)融合,组成新的功...
王泽峰韩文建
一种定量计算RNA编辑差异的方法
本发明涉及分子生物学技术领域,公开了一种定量计算RNA编辑差异的方法,包括高通量测序生成初始数据后,进行质量过滤以去除低质量读数;过滤后的数据与参考基因组比对,产生比对结果;利用GATK进行碱基质量校正和变异位点鉴定,以...
赵宇翔杭雨晴刘浩黎旺长
一种RNA编辑综合量化方法
本发明涉及分子生物学技术领域,公开了一种RNA编辑综合量化方法,包括高通量测序生成初始数据后,首先进行质量过滤以去除低质量读数。过滤后的数据与参考基因组进行比对,产生比对结果。接着,利用GATK对这些比对结果进行碱基质量...
赵宇翔杭雨晴刘浩黎旺长
RNA编辑的方法与试剂
本发明涉及核酸编辑技术领域,尤其涉及RNA编辑的方法与试剂。本发明提供的方法用III型CRISPR复合物和在gRNA上引入至少一个碱基的凸起环结构对靶标RNA分子进行编辑。该方法可以绕过基于6个核苷酸的切割规则的特性,从...
张锐何梓华王燚莹孙远帆吴英尹侯文豪
包括胞苷类似物的反义RNA编辑寡核苷酸
本发明涉及单链RNA编辑反义寡核苷酸(AON),其用于与靶RNA分子结合,使靶RNA分子中存在的至少一个靶腺苷脱氨基并在细胞、优选人细胞中募集ADAR2酶,以使靶RNA分子中的至少一个靶腺苷脱氨基。根据本发明的AON在与...
J·J·图鲁宁L·范辛特菲特C·P·克梅尔P·比尔E·E·多尔蒂
一种优化的NlovFz2-ωRNA编辑系统
本发明公开了一种优化的NlovFz2‑ωRNA编辑系统,通过对NlovFz2蛋白及ωRNA骨架的改造,获得最优NlovFz2系统enNlovFz2,在相比于亲本NlovFz2系统显著提升编辑效率基础上,通过将NlovFz...
魏迎辉徐坤王小龙郑文新高鹏飞李尚朴吴伟伟姜鹤楠岳阳伍振旻杨冲任宇佳
一种新型RNA编辑组合物及其应用
本发明公开了一种新型RNA编辑组合物及其应用。该组合物包含:TaqTth蛋白或者编码该蛋白质的多核苷酸;至少一个寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针由两部分组成,一部分为能够与靶标基因互补的引导序列;另一部分具有核酸二级结构;...
徐澍司马健徐翀强焕然曹吉娅诺
用于研究NDV RNA编辑特性的微型基因组系统及差异性表达两种外源基因的方法
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及用于研究NDVRNA编辑特性的微型基因组系统及差异性表达两种外源基因的方法。本发明提供的重组基因在NDV中可产生多个转录本,并且使两种目标基因的表达产生恒定比例的差异,编辑位点上游目标...
萧飒孟繁星田健霞杨增岐刘海金党如意
基于大规模RNA-seq数据绘制猪RNA编辑图谱的研究
2024年
【目的】A-to-I RNA编辑是一种由ADAR酶家族介导的共转录/转录后修饰,系统绘制猪的RNA编辑图谱,为猪的分子育种提供候选靶标。【方法】收集16种猪组织的3461个RNA-seq数据,采用生物信息学方法检测猪RNA编辑位点。【结果】共检测到130989个RNA编辑位点,其中,A-to-I RNA编辑位点有124208个。A-to-I RNA编辑位点特征分析表明,98.2%的位点位于重复区域,且主要位于猪特异性的SINE反转录转座子区域的PRE-1/Pre0_SS元件内。只有12.3%的A-to-I RNA编辑位点具有编码意功能。最后,本研究分析了7种组织(脂肪、大脑、大肠、小肠、骨骼肌、肝和肺)的特异性A-to-I RNA编辑位点,脂肪组织特异性位点宿主基因的功能富集分析表明,这些基因在与细胞脂质代谢过程、脂质代谢过程、硫酯代谢过程等相关的信号通路中富集。在这些通路中,与脂肪沉积相关的基因有PDK1、ACSL1和PDE3B等。【结论】绘制了猪的RNA编辑位点图谱,为猪的分子育种提供了候选靶点。
龙佳佳刘玮玮范新浩黎旺长杨小淦唐中林
关键词:脂肪沉积
RNA编辑
本发明涉及一种在多聚谷氨酰胺(polyQ)疾病的治疗和/或预防中供使用的反义寡核苷酸,其中所述反义寡核苷酸能够与编码polyQ疾病相关蛋白质的mRNA的CAG重复区域特异性结合,使得形成双链RNA,所述双链RNA能够吸引...
L·约森T·默克尔A·莫埃哈特霍格J·维克萨

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罗晓星
作品数:177被引量:639H指数:11
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田宇
作品数:160被引量:530H指数:11
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聂小军
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