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辣椒炭疽病菌效应因子NIS1-PCR-RFLP标记系统的建立被引量：3: 2021年; 【目的】基于辣椒炭疽病菌种群复杂、田间复合侵染种群组成不清,导致防控相对困难的问题,建立一种快速直观的辣椒炭疽病菌区分标记系统,为其病害田间防控提供科学依据。【方法】利用r DNA-ITS通用引物克隆田间分离的22株辣椒炭疽病菌rDNA-ITS,通过其序列比对分析构建系统发育进化树,初步确定22株供试菌株的种类和分类地位;选用效应因子NIS1基因为靶标,根据辣椒胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)和黄瓜炭疽菌(C.orbiculare)NIS1基因比对分析,设计NIS1基因简并引物,克隆22株辣椒炭疽病菌的NIS1基因,利用其序列比对分析构建系统发育进化树,分析比较rDNA-ITS和NIS1基因区分供试菌株的差异,进而对22株不同辣椒炭疽病菌NIS1基因进行分析,选择限制性内切酶,分析NIS1基因的PCR产物限制性片段多态性(RFLP)差异,建立NIS1-PCR-RFLP标记系统。【结果】rDNA-ITS序列系统进化分析表明22株辣椒炭疽病菌属于5种炭疽病菌,即胶孢炭疽菌(C.gloeosporioides)、短孢炭疽菌(C.brevisporum)、尖孢炭疽菌(C.acutatum)、平头炭疽菌(C.truncatum)和黑点炭疽菌(C.capsici),其序列同源性为85.6%~99.8%,但C.capsici和C.truncatum处于同一混合组群;22株辣椒炭疽病菌的NIS1基因两端序列较保守,中间存在可变区,与已报道的C.orbiculare的NIS1基因同源性在34.6%~78.9%;NIS1基因系统发育进化树能将22株辣椒炭疽病菌分成5个组群,C.capsici和C.truncatum处于不同组群,表明其区分度优于rDNA-ITS;NIS1-PCRRFLP主要差异片段显示C.gloeosporioides和C.brevisporum的最大片段均为210 bp,但片段数目不同,而C.acutatum为292 bp,C.capsici为685 bp,C.truncatum为345 bp,参照菌株C.orbiculare为497 bp,能够直观观察区分。【结论】研究建立的NIS1-PCR-RFLP标记系统可简便、直观地区分不同辣椒炭疽病菌的差异,有望发展成为真菌新的分子标记应用于田间辣椒炭疽病菌种群的快速鉴定�; 欧阳超刘思珍满益龙盛家伟陈岳张鑫刘勇刘勇谭新球; 关键词：辣椒炭疽病菌 PCR-RFLP

利用ITS-RFLP标记辅助筛选白灵侧耳与杏鲍菇杂交菌株被引量：3: 2017年; 为提高白灵侧耳菌株、杏鲍菇菌株及其杂交菌株筛选效率及鉴定的准确性,利用ITS-RFLP标记辅助单核杂交技术对白灵侧耳与杏鲍菇的杂交菌株进行了筛选.对5份白灵菇菌株和4份杏鲍菇菌株进行了种间配对杂交,根据亲本菌株交配型将其分成7个组合进行杂交.结果表明:9份亲本材料共具有6个A因子和7个B因子.利用该技术对杂交处理后的菌株样品进行筛选,获得了3份杂交菌株11D、53D、70D,其中杂交菌株11D与53D的菌丝生长速度与亲本菌株相比较差异显著;杂交菌株70D的菌丝生长速度与亲本菌株XB130DB相比较差异显著,而与亲本菌株BL130DB在菌丝生长速度上差异不显著.; 谭笑滕立平滕星凤鹏杨大海李启云温嘉伟; 关键词：分子标记杂交菌株交配型

利用RFLP标记检测德肉美羊多胎(FecB)基因型的研究被引量：3: 2016年; 繁殖力是动物生产的重要经济指标,提高繁殖力可以降低生产成本。目前,肉羊一般都产单羔并季节性繁殖,因此肉羊生产效率低[1-2]。小尾寒羊产羔率相对较高,但是小尾寒羊肉质相对较差;德肉美羊肉质好,但产羔率低,用德肉美羊和东北细毛羊互相杂交,可以提高肉羊的产羔率,增加优质羊产肉量。; 郭立宏; 关键词：东北细毛羊寒羊 RFLP标记 FECB 季节性繁殖多胎性

他留乌骨鸡SLC24A5基因Nhe I mismatch PCR-RFLP标记与羽色及肤色相关性研究被引量：5: 2014年; 采用PCR测序与PCR-RFLP技术,研究了SLC24A5基因变异与他留乌骨鸡羽色及肤色的关系。通过对他留乌骨鸡麻羽、白羽和黑羽3个品系以及乌骨与非乌骨2个类型的SLC24A5基因个体测序,共检测到19个SNP位点,其中3个位点引起氨基酸变异。采用每个品系或类型PCR扩增池测序技术,确定了每个SNP位点在不同品系或类型的基因频率,在分析基因频率差异及SNP变异特性的基础上,针对G482C位点,建立了Nhe I mismatch PCR-RFLP分子标记。利用该遗传标记对所有受试个体进行基因分型,并分析其与羽色肤色性状的相关性。结果表明,SLC24A5基因Nhe I mismatch PCR-RFLP分子标记与肤色性状显著相关。; 滕召纯孙利民陆晓屏李庆华王玉祥黄英张斌史宪伟; 关键词：RFLP 羽色

MC1R基因TaqⅠPCR-RFLP标记与他留乌骨鸡羽色性状的相关性研究被引量：7: 2013年; 采用PCR测序与PCR-RFLP技术,研究了MC1R基因变异与他留乌骨鸡羽毛颜色的关系。通过对他留乌骨鸡麻羽、白羽和黑羽3个品系的MC1R基因PCR扩增与测序,检测到6个SNP位点,其中5个位点引起氨基酸变异。在分析以上SNP在不同羽色品系等位基因频率差异及SNP变异特性的基础上,在A356G(D119G)位点建立了TaqⅠPCR-RFLP分子标记,对所有受试个体进行基因分型,并对A356G变异与羽色性状相关性进行了相关分析。结果表明,MC1R基因是影响他留乌骨鸡羽色的一个主效基因,A356G SNP是控制鸡羽色的一个关键变异位点。; 滕召纯陆哓屏王玉祥金德平杨开梅宋敏艳史宪伟; 关键词：MC1R 羽色

鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用被引量：2: 2011年; 基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。; 张鹏杨官品张立楠危起伟邹桂伟; 关键词：限制性片段长度多态性

鲢InDel-RFLP标记开发及其在遗传多样性分析、连锁图谱构建中的应用: 鲢/(Hypophthalmichthys molitrix/)是中国最大的池塘养殖的四大家鱼之一。四大家鱼的养殖可追溯到1000多年前的唐朝,是中国大陆居民最重要的蛋白质来源之一。四大家鱼已经引入到世界20多个国家和地...; 张鹏; 关键词：限制性片段长度多态性

与鸡产蛋量相关的MHC B－LB基因PCR－RFLP标记: 本发明属于动物基因工程技术领域，涉及一种利用分子生物学技术检测鸡的产蛋量的方法。更具体地说，本发明建立了一种利用鸡MHC B-LB基因的PCR-RFLP多态性对鸡的产蛋性能进行检测技术及其应用。本发明还涉及到一种用于检测...; 刘榜徐日福李奎强巴央宗陈国宏莫德林余梅樊斌王克华熊统安朱猛进李长春

东亚七筋姑分子系统发育地理学研究—基于cpDNA PCR-RFLP标记及序列分析: 东亚七筋姑(Clintonia udensis Trautv.et Mey.)隶属于百合科七筋姑属，为多年生森林草本植物。七筋姑属包括五个种，其中四个种分布在北美，一个种分布在东亚，是典型的东亚一北美间断分布。东亚七筋姑...; 李欣; 关键词：东亚七筋姑分子系统

RFLP和PCR-RFLP标记与牦牛遗传育种研究被引量：6: 2006年; 在归纳总结RFLP和PCR-RFLP标记技术的原理、优缺点的基础上,系统论述了其在牦牛遗传育种研究中的应用现状,并提出了个人的建议和看法。; 马玉红马志杰; 关键词：RFLP 育种

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