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一种利用电压寻址控制DNA微阵列合成RNA的方法: 本发明公开了一种电压寻址控制DNA微阵列合成RNA的方法。该方法利用电压寻址控制与体外转录相结合以实现多次选择性合成RNA。首先设计的DNA序列，借助手臂分子于电极微阵列上原位合成DNA或固定已经合成的DNA，通过电控寻...; 刘全俊余浩天韩业敏林玮明陆祖宏

面向DNA微阵列数据分类的混合基因选择算法研究: DNA微阵列技术是生物信息学领域的重要研究工具,在基因诊断和疾病研究中发挥着关键作用。然而,该技术所生成的基因表达谱数据往往呈现高维度、小样本量的特点,对数据分析和处理带来了巨大挑战。为此,高效的基因选择算法应运而生,其...; 曹入屯; 关键词：多目标优化

DNA微阵列芯片法在非结核分枝杆菌菌种鉴定的应用探讨: 2024年; 目的为临床工作中非结核分枝杆菌(NTM)的感染和防治提供科学依据。方法收集疑似结核分枝杆菌感染患者标本(包括呼吸道标本痰液、灌洗液以及非呼吸道标本无菌体液)共1089例,采用DNA微阵列芯片法进行检测,分析分枝杆菌菌种的分布特点。结果1089份标本中检出结核分枝杆菌878份(80.62%),NTM211份(19.38%)。其中非结核分枝杆菌菌种分布有5种,胞内分枝杆菌153例(72.51%),鸟分枝杆菌28例(13.27%),龟脓分枝杆菌复合群19例(9%),堪萨斯分枝杆菌10例(4.74%),耻垢分枝杆菌1例(0.48%)。非结核分枝杆菌感染人员分布男性127例(60.19%),女性84例(39.81%),年龄分布以老年为主,60岁以上103例(48.82%),男性71例(68.93%),女性32例(31.07%)。结论疑似结核分枝杆菌患者检出NTM共有5种,排名前三的NTM种类是胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌和龟脓分枝杆菌复合群,感染人群以老年男性为主。; 谭蛟王亚春王亚丽夏爽程美锦王伟; 关键词：非结核分枝杆菌菌种鉴定

基于指数扩增技术的DNA微阵列快速高通量检测miRNA: 作为恶性肿瘤的标志物,miRNA与肿瘤的发生和转移密切相关。由于miRNA本身长度短、丰度低,常见的聚合酶链式反应以及等温核酸扩增技术难以实现miRNA特异性的定量检测,特别是难以区分具有单碱基差异的miRNA。而且研究...; 郝爽; 关键词：DNA微阵列 MIRNA

应用DNA微阵列芯片检测青年肺结核患者结核菌耐药性的研究: 2023年; 目的:以结核菌比例法药敏试验为标准,分析DNA微阵列芯片(以下简称DNA微阵列)在聊城市青年肺结核患者痰标本中进行结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药性检测的效能。方法:选取聊城市2019年10月-2021年9月确诊的18~45岁的青年肺结核患者,对其中痰涂片抗酸杆菌阳性的215例患者,通过DNA微阵列和比例法药敏对痰标本进行异烟肼和利福平的耐药性检测,分析DNA微阵列对异烟肼、利福平、耐多药结核诊断的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值,并与比例法进行一致性比较。结果:DNA微阵列检测耐多药结核的敏感度和特异度分别为71.4%和99.0%,阳性预测值和阴性预测值分别为83.3%和98.0%,Kappa=0.75,说明两种方法在耐多药结核检测中有高度一致性。DNA微阵列检测异烟肼耐药性的敏感度和特异度分别为76.5%和97.2%,阳性预测值和阴性预测值分别为83.9%和95.7%,Kappa=0.76,说明两种方法在异烟肼耐药性检测中有高度一致性。DNA微阵列检测利福平耐药性的敏感度和特异度为82.1%和98.9%,阳性预测值和阴性预测值分别为92.0%和97.4%,Kappa=0.85,说明两种方法在利福平耐药性检测中基本一致。结论:DNA微阵列适用于青年结核患者快速筛查和耐药性检测,为聊城青年结核病的防控能提供有力支持。; 刘亚芹张法国陈焕民; 关键词：DNA微阵列结核分枝杆菌耐药性杂交

基于DNA微阵列数据的肿瘤基因选择技术研究: 统计数据表明，癌症是导致人类寿命缩短的主要原因。随着DNA微阵列技术的不断发展，越来越多的微阵列数据在不同领域的应用进入了快速发展阶段。利用机器学习技术处理微阵列基因表达谱数据对癌症的分型诊断和治疗体现出越来越重要的价值...; 吴邦语

一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法: 本发明公开了一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法，包括：得到整数序列集；构建概率数据库，构建概率索引数据库；进入迭代过程，扩增结点中的序列，更新扩增后结点的匹配位置，更新迭代结点集；计算迭代结点集中所有结点的指...; 李森森吴灵赟陈鹭剑胡学佳张惠敏杨朝勇

基于SCFSO-MD算法的DNA微阵列数据分类方法: 2022年; 针对DNA微阵列数据高维、类别不平衡的特点,为提高分类准确性,提出一种基于谱聚类特征选择与闵可夫斯基度量相结合的过采样算法SCFSO-MD。该算法使用谱聚类对特征进行聚类,分别定义特征区分度和特征独立性,并将二者的乘积作为特征子簇中代表性特征的选择依据以构造特征子集,特征区分度使用特征标准差度量,特征独立性使用斯皮尔曼系数度量,同时在SMOTE过采样中分别使用不同阶数下的闵可夫斯基距离度量方法计算K近邻样本。实验结果表明,SCFSO-MD-S算法在SRBCT、Leukemia、Colon Tumor和Ovarian Cancer数据集上的F-value值分别最高可达0.99、0.95、0.90和0.97。当最优特征子集数量仍旧较大时,基于曼哈顿距离度量的SMOTE算法效果比使用欧氏距离所获得的分类效果鲁棒性更强。; 陈俊丰郑中团; 关键词：高维数据谱聚类

DNA微阵列芯片与质谱技术快速鉴定非结核分枝杆菌的差异性分析被引量：6: 2022年; 目的比较基因芯片技术与基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定上的差异,为临床快速诊断NTM病提供帮助。方法应用BACTECMGIT 960仪器对保存的NTM菌株进行液体培养法复苏;分别使用基因芯片法、质谱法与16s rRNA测序对74株NTM进行菌种鉴定;以16s rRNA测序作为参考方法分析比较基因芯片法与质谱法两种方法鉴定结果的差异与优劣势。结果通过测序,74株NTM鉴定结果为胞内分枝杆菌37株,脓肿分枝杆菌19株,M.marseillense/M.yongonense 7株,鸟分枝杆菌5株,堪萨斯/胃分枝杆菌2株,M.chimaera、哥伦比亚分枝杆菌、海分枝杆菌、猪分枝杆菌均1株。基因芯片法与测序法相比有12株结果不同,准确率为83.8%,鉴定到复合群准确率为95.9%;MALDI-TOF MS有2株无结果,与测序相比有7株结果不同,准确率为87.8%,鉴定到复合群准确率为97.3%。检测时间上,基因芯片法鉴定1个样本需要6 h,质谱法则仅需1 h。结论与16s rRNA测序金标准相比,两种鉴定方法鉴定到菌种复合群的准确率均在95%以上,展现两种方法在NTM菌种鉴定上优异的性能,两种方法均能为临床更快速准确鉴定NTM提供支持。质谱法在NTM鉴定的菌种谱、菌种分辨能力、时间和经济成本上均要优于基因芯片法,更适合实验室常规开展。; 吴祥兵吴联朋项领陈秀平唐少华; 关键词：非结核分枝杆菌菌种鉴定

间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型在结核分枝杆菌检测中的应用被引量：2: 2021年; 目的探讨间隔区寡核苷酸DNA微阵列法在结核分枝杆菌基因分型检测中的应用价值。方法将结核分枝杆菌标准菌株(H37Rv)、卡介苗(BCG)菌株和97株临床结核分枝杆菌株的聚合酶链反应产物分别进行传统Spoligotyping和间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型,比较2种方法的一致性,并用H37Rv菌株检测间隔区寡核苷酸DNA微阵列法的灵敏度。结果结核分枝杆菌标准菌株、BCG菌株和97株临床结核分枝杆菌菌株的间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型结果与传统Spoligotyping完全一致,符合率为100%;且间隔区寡核苷酸DNA微阵列法有较好的检测效能。结论间隔区寡核苷酸DNA微阵列法用于结核分枝杆菌分型具有操作简便、快速等特点,适于结核病的溯源和分子流行病学调查。; 杨建伟李辉王少华杨卫华杨俊梅; 关键词：结核分枝杆菌 DNA微阵列间隔区寡核苷酸分型

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