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DNA序列分析被引量：6: 2001年; 综述了DNA测序技术。对DNA序列分析方法 ,包括 :毛细管电泳、阵列毛细管电泳、芯片毛细管电泳、超薄层毛细管电泳、质谱法、原子探针法、杂交法、流动式单分子荧光检测法 ,作了详细评述。; 郜虹姚成欧阳平凯; 关键词：DNA 测序方法电泳法质谱法杂交法

DNA序列分析电泳仪（20G）: 1.本外观设计产品的名称：DNA序列分析电泳仪（20G）。;2.本外观设计产品的用途：用于生物DNA序列分析的电泳仪。;3.本外观设计产品的设计要点：在于形状与图案的结合。;4.最能表明设计要点的图片或照片：立体图1。; 朱军

DNA序列分析电泳仪（20C）: 1.本外观设计产品的名称：DNA序列分析电泳仪（20C）。;2.本外观设计产品的用途：用于生物DNA序列分析的电泳仪。;3.本外观设计产品的设计要点：在于形状与图案的结合。;4.最能表明设计要点的图片或照片：立体图1。; 朱军

基于DNA序列分析的葡萄茎枯病菌检疫鉴定被引量：5: 2020年; 葡萄茎枯病菌是我国进境植物检疫性有害生物,目前口岸对葡萄茎枯病菌的检疫鉴定主要依靠形态学观察,然而单纯利用形态学难以对其进行准确鉴定,需与分子生物学方法相结合。为找出有效分子标记,本研究以宁波口岸截获鉴定的41株葡萄茎枯病菌分离株和收集自ATCC和CBS的2株葡萄茎枯病菌为研究对象,对上述菌株进行形态学观察,ITS、actin和β-tubulin基因序列测定,同时采用序列分析手段考察上述基因片段在葡萄茎枯病菌鉴定区分上的应用价值。研究结果表明葡萄茎枯病菌形态变异较大,ITS无法有效区分葡萄茎枯病菌,actin和β-tubulin基因片段能够将葡萄茎枯病菌从近似种中准确划分出来,利用3个基因片段联合建树区分能力较强。; 段丽君吕燕张慧丽段维军; 关键词：系统发育

改构溶瘤腺病毒DNA序列分析研究: 2020年; 目的:以改构的溶瘤腺病毒制品为研究对象,探讨DNA测序技术在基因治疗制品质量控制和质量标准制定中的作用。方法:提取并纯化一种改构溶瘤腺病毒制品的基因组DNA,对其基因组关键区段、非关键区段进行测序分析,发现变异体后应用第一代和第二代DNA测序技术进行进一步分析和检测。结果:关键区段DNA序列与理论序列一致;非关键区段DNA序列与理论序列相似度大于99.9%;发现1个高变异区段,进一步分析结果显示:缺失1个胞嘧啶(C)的变异体占比5/9(克隆/克隆);缺失2个胞嘧啶(C)的变异体占比1/9(克隆/克隆);插入1个胞嘧啶(C)的变异体占比1/9(克隆/克隆)。结论:第一代和第二代DNA测序技术虽然各有优缺点,但只要相互组合使用得当,仍然可较好地用于基因治疗制品基因组的分析和质量控制。; 刘兰史新昌黄永兴李永红饶春明

基于数据场与3-D图形表示的DNA序列分析: 2020年; 该文提出了DNA序列的一种3-D图形表示,并且针对此图形表示的非退化性给出了数学证明。然后计算所提3维图形表示的L/L矩阵的ALE指标,并给出了所提3维图形的图半径,从而对DNA序列进行数值刻画。结合物理学中重力场势函数的思想,构造了向量形式的数据对象间的势函数,进而以K-近邻算法为分类器,对208个RIG-I基因进行了分类识别。实验结果证明了该文所提的分类办法是有效的。; 郑卓赵佳玲李春; 关键词：数据场

基于数据场与3-D图形表示的DNA序列分析: 随着生物技术的快速发展，近年来关于生物学的研究逐渐由积累数据向解释数据和分析数据等知识领域偏移，因此生物信息学便应运而生并迅速成为相关交叉学科的前沿。生物信息学，顾名思义即研究生物学数据信息的学科，它是一门新兴交叉学科，...; 郑卓; 关键词：数据场势函数

抗病毒转基因大豆事件外源T-DNA序列分析及定性检测被引量：3: 2020年; 转基因作物的T-DNA插入及其与宿主基因组的连接序列构成的侧翼区域,是转基因事件检测的关键组成部分,也是转基因作物开发、评估和监管所必需的。前期研究得到2个携带大豆花叶病毒P3(soybean mosaic virus P3)基因干扰片段的转基因大豆事件,即L13和L104,可显著提高大豆对大豆花叶病毒、大豆花叶坏死病毒和西瓜花叶病毒的抗性,具有较强的光谱性。为了便于对该转基因事件进行监管以及建立事件特异性检测方法,本研究通过Illumina Xten平台,对L13和L104进行全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),并结合生物信息学分析和PCR技术,对转基因事件L13和L104的旁侧序列进行了分析。通过全基因组测序,每一个事件获得了超过12.13 Gb的原始数据,测序深度为11×,与大豆参考基因组(Wm82.a2.v1)和转化载体序列做比较,初步识别出这两个转化事件T-DNA的边界及其旁侧序列。转化事件L13和L104的T-DNA分别位于Chr04和Chr11染色体上。进一步的PCR检测和序列测定表明转基因事件L13的T-DNA为单位点双拷贝整合到大豆基因组Chr04:46747946位点;转基因事件L104的T-DNA为单拷贝插入,整合位点为Chr11:30461895位点。结果证明了全基因组测序在识别转基因作物T-DNA插入和旁侧序列区域方面的有效性和稳定性。此外,插入位点的鉴定和事件特异性检测的建立将有助于广谱抗病毒转基因大豆品种的应用和发展。; 刘东波邢国杰邢国杰杨静杨静牛陆杨向东; 关键词：插入位点旁侧序列全基因组测序

基于线粒体DNA序列分析金虎尾目在蔷薇亚纲中的地位: 2020年; 【目的】探讨金虎尾目在蔷薇亚纲中的植物学地位。【方法】以金虎尾目,豆类以及锦葵类植物12条线粒体基因作为研究对象,利用最大似然法、最大简约法、近邻法分别构建系统发生树,对金虎尾目的植物学地位进行分析。【结果】最大似然法结果表明12条线粒体基因中,有9条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类,支持率为29%~79%;有3条线粒体基因支持金虎尾目属于豆类,支持率为17%~52%。最大简约法结果表明12条线粒体基因中,有8条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类,支持率为36%~85%;而支持金虎尾目属于豆类的仅有2条基因,支持率为25%和66%;其余的2条基因支持金虎尾目既不属于锦葵类也不属于豆类,支持率为77%和99%。近邻法结果表明12条线粒体基因中,有8条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类,支持率为14%~82%;而只有3条基因表明金虎尾目属于豆类,支持率为36%~66%;其余的1条基因表明金虎尾目属于豆类和锦葵类分支之外,支持率为44%。【结论】上述3种模型分析结果表明,大多数基因的分类支持金虎尾目归属于锦葵类分支,同时具有高支持率。这个结果可为金虎尾目不完全谱系分选提供一定的证据。; 卿华覃佳佳靳燕马政姚慧鹏; 关键词：系统发生树

一种新型无钩豆状囊尾蚴的鉴定和18S DNA序列分析被引量：1: 2019年; 旨在鉴别无钩豆状囊尾蚴与有钩豆状囊尾蚴的区别。用扫描电镜对自然感染的豆状囊尾蚴头节进行超微结构观察,对其18S DNA进行PCR扩增和序列分析,并与其他动物的囊尾蚴作了进化树比较。结果显示:超微结构观察无钩和有钩豆状囊尾蚴的主要区别位于顶突,而吸盘和原始体节的结构是相同的。从囊泡中取出的豆状囊尾蚴多处于相对静止状态。无钩豆状囊尾蚴的顶突如同数层圆饼叠放在一起,表面比较平坦,中央有一个较大的结节,结节的直径约为20μm,周边有数层齿轮状花纹,形成重合式齿轮状构造。有钩豆状囊尾蚴顶突的前端比较钝,通过皮肌柱与形似鸡爪样的小钩相连。小钩表面光滑,富有光泽,具有坚硬的外观,长120~150μm。通过用18S-P1和18S-P2引物对无钩和有钩豆状囊尾蚴的目的基因、感受态细胞的培养液和菌体质粒的PCR检测,均获得相同的目的基因条带。测序结果表明18S-P1引物扩增的无钩豆状囊尾蚴与有钩豆状囊尾蚴750 bp序列的差别比18S-P2引物扩增的666 bp序列的区别明显。与其他动物囊尾蚴相关序列的进化比较显示,无钩豆状囊尾蚴与牛囊尾蚴有亲缘性,而有钩豆状囊尾蚴则与猪囊尾蚴有亲缘关系。总之,无钩和有钩豆状囊尾蚴虽然同属豆状囊尾蚴,但无钩豆状囊尾蚴是一种新发现的豆状囊尾蚴。; 潘耀谦孔令芸李鹏岳峰吴玉平刘兴友; 关键词：进化树

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