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大麦HvMBF1c基因启动子及其应用: 本发明公开了大麦HvMBF1c基因全长启动子序列及其应用。以HvMBF1c基因编码区5’端上游2000 bp左右核苷酸序列作为全长启动子，设计特异性上游及下游引物，通过PCR扩增目标启动子片段，该序列除了具备核心启动子元...; 汪军成王化俊姚立蓉冯举伶孟亚雄李葆春马小乐司二静杨轲陈一酉边秀秀

家蝇Actin-5 C基因启动子的生物信息学分析及载体构建: 2021年; 目的运用生物信息学分析家蝇(Musca domestica L.)肌动蛋白5 C(Actin-5 C)基因,构建Actin-5 C启动子双荧光素酶报告基因表达载体。方法使用伯克利果蝇基因组计划(BDGP)在线分析软件、Promoter 2.0和在线比对启动子网站(FPROM)等多种启动子预测工具,分析、预测家蝇肌动蛋白Actin-5 C基因5′端上游非编码区,根据预测结果构建截短式启动子萤火虫荧光素酶报告基因重组质粒,转染草地贪夜蛾卵巢细胞系sf9细胞,并使用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)进行萤火虫荧光素酶报告基因的检测。结果Actin-5 C基因5′端上游的-2609~-94 bp,预测有启动活性,且分值达0.8分以上,其中-2198~-2148 bp分值最高、达0.98分;在-220 bp和-1444 bp处分别检测到CAAT和TATA盒信号,经比较取最有可能的1156 bp(-1236~-80 bp)、1745 bp(-1825~-80 bp)及2059 bp(-2139~-80 bp)截断启动子片段,构建pGL 3-1156、pGL 3-1745及pGL 3-2059质粒,RT-PCR检测到3种重组质粒中的萤火虫荧光素酶报告基因转录成功。结论生物信息学预测工具研究家蝇Actin-5 C基因启动子可以简化认知基因的过程,根据预测结果构建了家蝇Actin-5 C基因萤火虫荧光素酶报告基因表达载体。; 王蓝晨王昱王颖杨仕赛朱贵明; 关键词：家蝇计算生物学逆转录聚合酶链反应

PCR检测HBV前C/C基因启动子区变异与肝细胞癌的关系被引量：3: 2020年; 目的研究聚合酶链反应(PCR)检测乙型肝炎病毒(HBV)前C/C基因启动子区变异与肝细胞癌(HCC)的关系。方法纳入2016年3月至2018年9月本院35例HCC患者(观察组)与35例HBV感染者(对照组),所有患者均提取血清DNA,采用PCR扩增对HBV前C/C基因启动子区进行测序,对比两组患者基因变异位点和基因型分布。结果观察组HBV前C/C子区24例发生变异,其中G189617例,G18997例,对照组HBV前C/C子区7例变异,其中G18962例,G18995例,两组HBV前C/C子区变异率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。HCC患者基因亚型Ba型7例,C1亚型16例,C2型12例,对照组分别为4例,17例及14例。两组基因分型比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论HBV前C/C基因启动子区变异与HCC发生密切相关,其中HBV前C/C子区G1896变异可增加癌变风险。; 李彦伟; 关键词：PCR 原发性肝癌

小麦和大麦GER4c基因启动子的分离及其锈菌诱导特性分析被引量：1: 2019年; 病原菌诱导型启动子在植物-病原菌互作研究及基因工程育种中具有重要的利用价值,可根据抗病性的需求调控目的基因的表达。为挖掘小麦来源的锈菌诱导型启动子,为小麦抗条锈病的理论研究及育种应用提供基础,本研究分离了大麦类萌发素蛋白GER4c基因及其小麦同源基因的启动子,利用报告基因GFP表达载体在二穗短柄草中的异源表达,分析了启动子功能。发现小麦及大麦GER4c基因启动子表达模式相同,驱动报告基因在叶片中的表达量最高,在叶鞘、茎秆和小穗中显著降低。两个启动子均表现为锈菌诱导型启动子,转基因短柄草在接种锈菌小种F-Fl后,RT-PCR检测GFP在叶片中的表达量显著上调,显微镜下绿色荧光蛋白信号明显增强。研究结果为开展麦类作物抗条锈病相关研究提供了作物自身来源的诱导型启动子。; 黄德华张会飞刘强陈凤娟姜婷婷付道林吴佳洁; 关键词：诱导型启动子锈菌二穗短柄草小麦大麦

兴义鸭MEF2C基因启动子区序列克隆与分析被引量：1: 2019年; 为研究MEF2C基因启动子区SNPs对屠宰性状的影响,本实验运用直接测序法筛选兴义鸭MEF2C基因启动子区的SNP位点,并分析其与屠宰性状的相关性。结果表明:在兴义鸭MEF2C基因启动子上存在8个SNPs位点,分别为T-190A、A-232G、A-285G、A-617T、G-1420A、A-1437C、T-1504G、A-1524G;生物信息学分析发现T-190A、A-232G、G-1420A突变位点周围HOXA4、GCN4、Pit-1a、IRF-1等重要转录因子结合位点消失,继而生成Oct-1、ICSBP 2个新的转录因子结合位点;关联分析结果表明,T-190A不同基因型个体的兴义鸭活重存在显著差异,G-1420A不同基因型个体的兴义鸭腿肌率具有显著差异。由此推断,T-190A、G-1420A位点可能对调控兴义鸭MEF2C基因启动子区功能元件有重要影响,且2个多态性位点可能为影响兴义鸭屠宰性状的重要功能性SNP。本研究结果将为进一步确定MEF2C基因功能提供试验基础。; 杨华婷李辉李兴才赵忠海师新彩; 关键词：启动子 SNP 屠宰性状生物信息学

NAFLD患者外周血Srebp1c基因启动子甲基化表达水平被引量：3: 2018年; 目的探讨非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者血浆固醇调节元件结合蛋白1c(Srebp1c)基因启动子甲基化状态。方法选择56名在西南医科大学附属医院消化内科确诊为NAFLD的患者,另选50名健康人群作为对照组。收集一般资料(年龄、性别、身高、体重)。收集两组人群静脉血,血脂和肝功能采用全自动血生化分析仪检测,qPCR检测基因水平表达,Srebp1c启动子甲基化水平采用甲基化特异性PCR检测。结果两组人群的年龄和性别差异均无统计学意义(P>0.05)。观察组体重、体重指数、总胆固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白和谷丙转氨酶均高于对照组(t=9.103、3.749、4.550、5.363、2.889、9.783,P均<0.05);相对于对照组,观察组的Srebp1c表达上调(t=46.09,P<0.000 1);对照组和观察组的Srebp1c甲基化率分别为76.00%和19.64%,差异有统计学意义(χ~2=33.751,P<0.000 1)。结论 Srebp1c低甲基化可能在NAFLD患者的发病过程中扮演了重要角色。; 周自忠徐海荣陈红虹周小平唐世孝; 关键词：非酒精性脂肪肝病低甲基化

HBV前C/C基因启动子区变异与HBeAg阳性慢性乙型肝炎肝纤维化程度的关系被引量：5: 2018年; 目的探讨HBV前C/C基因启动子区变异与HBe Ag阳性慢性乙型肝炎(CHB)患者肝组织病理变化的关系。方法将2012年4月-2013年12月在广州市第八人民医院住院诊治,且伴有肝活组织检查与相应冻存血清标本的HBe Ag阳性CHB患者148例纳入本研究,提取血清DNA后通过巢式PCR扩增HBV前C/C基因启动子区并测序分析。计量资料方差不齐时2组间比较采用非参数Mann-Whitney U检验,计数资料2组间比较采用χ2检验,logistic回归分析与显著肝纤维化相关的参数。结果共116例(78.4%)患者肝活组织检查提示存在显著肝纤维化(≥S2)。ALT≤正常值上限患者组中,10例(58.8%)伴有显著肝纤维化,并发生T1753V(11.8%)、A1762T/G1764A(35.3%)和G1896A变异(5.9%)。单因素logistic回归分析显示,HBV基因A1762T/G1764A变异和G1896A变异与显著肝纤维化相关并具有统计学意义(P值均<0.05),而年龄、性别、基因型和其他变异位点与显著肝纤维不存在相关性。进一步多因素logistic回归分析显示,HBV基因的A1762T/G1764A变异(比值比7.098,P<0.001)和G1896A变异(比值比16.816,P=0.007)均与显著肝纤维化独立相关。结论 HBV前C/C基因启动子区变异可作为评估HBe Ag阳性CHB患者显著肝纤维化发生的危险因素。; 施海燕李丽雅何浩岚刘惠媛陈志敏陈伟烈廖宝林

MEF2C基因启动子区碱基突变对转录活性的影响被引量：6: 2017年; 目的研究MEF2C基因启动子突变对其转录活性的影响及其突变可能的致病机制。方法采用聚合酶链式反应,以对照组基因组DNA为模板,获得野生型MEF2C基因启动子区DNA片段(-939^+531bp)(1 470bp);利用分子克隆技术将目的片段连接到含有荧光素酶报告基因的pGL3-Basic载体上,构建野生型MEF2C启动子报告基因载体pGL3-Basic-MEF2C-WT;利用点突变技术,构建突变型MEF2C启动子报告基因载体pGL3-Basic-MEF2C-M1(M1点突变类型:-293插入G突变)、pGL3-Basic-MEF2C-M2(M2点突变类型:-160插入G,C>T突变);采用琼脂糖凝胶电泳、双酶切、基因测序方法验证上述3种载体是否构建成功;利用脂质体瞬时转染技术将pGL3-Basic-MEF2C-WT、pGL3-Basic-MEF2C-M1、pGL3-Basic-MEF2C-M2载体分别体外转染HEK-293T细胞,标记为WT组、M1组、M2组,将pGL3-Basic空载体转染HEK-293T细胞标记为对照组、将相同条件下培养未转染载体的细胞标记为空白组,采用双荧光素酶报告基因检测系统检测各组相对荧光素酶活性(relative luciferase activity RLA),比较各组载体的转录活性。数据用SPSS18.0软件进行单因素方差分析(ANOVA)处理,运用启动子区生物信息预测软件对各组启动子区序列可能的转录因子结合位点及CpG岛进行预测,并分析比较。结果成功构建了含野生型、M1型、M2型的MEF2C基因启动子区的荧光素酶报告基因载体pGL3-Basic-MEF2C-WT、pGL3-Basic-MEF2C-M1、pGL3-Basic-MEF2C-M2;空白组、对照组、WT组、M1组、M2组的RLA分别为(0.83±0.35)、(2.28±0.36)、(24.17±0.50)、(29.65±2.40);M1组和M2组的RLA水平高于WT组,分别是野生型的10.6倍、13倍,差异具有统计学意义(P<0.05);转录因子结合位点预测发现正常MEF2C基因启动子片段上-356^-108bp存在13个可能的位点,M1突变导致1个新的转录因子结合位点JCV-repeated-sequence生成,M2突变导致1个新的转录因子结合位点Sp1生成;预测发现正常MEF2C基因启动子片段上�; 邱进刘辉热孜宛古丽.伊敏袁芳许瑞马玲霍强周勇; 关键词：启动子突变单纯性先天性心脏病维吾尔族人群

HBV前C/C基因启动子区变异与HBeAg阴性CHB患者肝组织病理变化的关系被引量：7: 2016年; 目的：探讨乙型肝炎病毒（HBV）前C/C基因启动子区变异与HBe Ag阴性慢性乙型肝炎（CHB）患者肝组织病理变化的关系。方法：将2012年4月至2013年12月在广州市第八人民医院住院诊治所有伴肝活检的HBeAg阴性CHB患者71例纳入本项研究,提取血清DNA后通过巢式PCR扩增HBV的S基因区与前C/C基因启动子区并测序分析,Logistic回归分析与显著性肝脏组织学异常相关的病毒性因素指标。结果：基因型B患者组与基因型C患者组比较,显著性肝脏炎症发生率（15.8%vs.27.3%,χ^2=1.398,P=0.237）及显著性肝纤维化发生率（71.1%vs.84.4%,χ^2=1.926,P=0.165）均无显著差异。纳入年龄、性别、HBV基因型以及变异位点（T1753V、A1762T/G1764A、A1846T和G1896A）进行Logistic回归分析,HBV基因的A1762T/G1764A变异与显著性肝脏炎症相关（OR=4.296,P=0.037）,而年龄、性别、基因型和其他位点变异与显著性肝组织病理学改变无显著相关性（均P〉0.05）。结论：HBV前C/C基因区变异可能可作为评估肝组织病理变化的生化指标。; 廖宝林林思炜陈伟烈刘惠媛陈铿刘丽儿施海燕; 关键词：HBV 肝纤维化

乙肝病毒感染孕妇病毒前C/C基因启动子区变异与肝脏炎症被引量：1: 2015年; 目的:调查孕妇所感染乙肝病毒(HBV)基因型及前C/C基因启动子区变异发生情况,以及变异与肝脏炎症的相关性。方法:PCR扩增111例HBV感染孕妇HBV S基因和前C/C基因启动子区序列,PCR产物经测序后与参考序列进行分析比对。结果 :111例孕妇中B基因型占54.1%(60/111),其余51例(45.9%)为C基因型。基因亚型中除B2、C1和C2外还存在C5和B4两种基因亚型。前C/C基因启动子区变异分析发现,该区段多个位点的变异均有发生,以A1762T/G1764A变异发生率最高。ALT大于正常上限者该区变异总体发生率高于ALT小于正常上限者,且A1846T和G1896A变异与HBe Ag阴性HBV感染相关。结论:感染HBV的孕妇其前C/C基因启动子区存在不同程度变异,且这些变异与HBe Ag的水平及肝脏的炎症活动相关。; 肖蕾刘惠媛杨湛李晶应若素张复春肖服兴许敏; 关键词：基因型

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