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橡胶草乳管特异性高表达基因TkREF的启动子区段鉴定: 2025年; 橡胶草(Taraxacum kok-saghyz Rodin,TKS)根部天然橡胶含量可达干重的20%以上,且橡胶的质量和特性与橡胶树相似,因此被认为是理想的产胶替代植物。橡胶延伸因子(rubber elongation factor,REF)是胶乳中特异高表达且对橡胶生物合成具有重要作用的一类蛋白,然而调控其乳管特异性高表达的启动子区段尚未被鉴定。本研究利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析了TkREF的时空表达特性,结果发现该基因在橡胶草生长的不同阶段均表现为胶乳特异性高表达,且表达水平呈现逐渐增加的趋势。启动子顺式作用元件预测分析发现,TkREF的启动子区主要包含环境响应元件(17%)、功能未知元件(44%)和启动子基本元件(36%)。对TkREF不同长度启动子区段驱动GUS报告基因的转基因橡胶草进行GUS染色和GUS酶活性分析,结果表明在TkREF启动子-1088 bp至-759 bp之间存在调控该基因在胶乳中高表达的顺式作用元件,而在-1980 bp和-1088 bp之间以及-759 bp和-359 bp之间可能存在抑制该基因胶乳表达的顺式作用元件。本研究为阐明TkREF参与产胶调控的机制及其在橡胶草高产分子育种中的应用提供了理论依据。; 刘星杨雪张芳唐朝荣刘开业; 关键词：GUS染色

一种大豆根瘤高表达基因及其应用: 本发明公开了一种大豆根瘤高表达基因及其应用。具体地公开了蛋白质GmbHLH93(SEQ ID No.1)及其编码基因在调控植物根瘤形成和/或生长、调控植物根瘤固氮效率和/或培育高效结瘤固氮植物中的应用。实验证明，将大豆中...; 任勃孙宝成王青高晗牛海雨李岩松马群

骨转移肝细胞瘤差异高表达基因HDGF的筛选及细胞生物学效应的初步研究: 2024年; 目的探究肝癌衍生生长因子(hepatoma-derived growth factor,HDGF)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达,以及其对DNA损伤、增殖、迁移、上皮-间质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)以及骨保护素(osteoprotegerin,OPG)的表达影响作用。方法分析GEO数据库中HCC骨转移患者与HCC非转移患者的肝脏肿瘤中mRNA的差异表达特征,筛选出差异最显著基因HDGF。利用qRT-PCR技术验证HDGF mRNA在转移能力不同的HCC细胞中的表达情况。分别通过γ-H2AX免疫荧光实验,分析不同组肝癌细胞的DNA损伤程度。采取Cell counting Kit-8试剂盒、集落形成实验和Transwell迁移实验检测HDGF对细胞增殖、迁移能力的影响。通过蛋白质印迹法,检测EMT相关蛋白Vimentin、E-cadherin在不同程度骨转移组HCC细胞中的表达差异。运用qRT-PCR技术和蛋白质印记法(western blot,WB)检测各组肝癌细胞中OPG的差异表达。结果 HDGF在骨转移的HCC组织和高转移性HCC细胞系中高表达;HDGF高表达能够抑制细胞DNA损伤修复;HDGF能够促进HCC细胞系增殖、迁移;HDGF上调Vimentin的蛋白表达水平,同时下调E-cadherin的蛋白表达水平(P均<0.05),且HDGF过表达下调了OPG的表达。结论 HDGF在骨转移肝细胞瘤中高表达,并可能通过促进EMT、迁移和增殖而促进骨转移。; 张希何永鹏邵高海; 关键词：肝癌衍生生长因子

玉米幼胚特异高表达基因ZmOLE40的筛选与高效荧光诱导系的构建: 陈涵宇

‘84K’杨内生菌脱菌体系及PagTMK家族部分形成层高表达基因功能研究: 张琦琦

原发性胆汁性肝硬化高表达基因TPSAB1与CD4+T细胞增殖的相关性研究: 2024年; 目的本研究分析PBC患者与健康对照者血浆基因表达谱差异,以及差异基因类胰蛋白酶Alpha/Beta 1(tryptase Alpha/Beta 1,TPSAB1)对PBC患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)来源的幼稚CD4+T细胞增殖的影响。方法使用3名PBC患者和3名健康对照者的血浆进行微阵列分析;通过免疫细胞分离试剂盒从PBMC中分离自然杀伤细胞(natural killer,NK)细胞、B细胞、幼稚CD4+T和幼稚CD8+T细胞;通过q RT-PCR分析NK细胞、B细胞、幼稚CD4+T和幼稚CD8+T细胞中TPSAB1的表达水平;采用蛋白免疫印迹分析靶向TPSAB1基因的短发夹RNA(short hairpin RNA,sh RNA)干扰后CD4+T细胞中TPSAB1的蛋白表达水平;采用WST-1增殖试剂盒和5-乙炔基-2′-脱氧尿苷(5-Ethynyl-2’-deoxyuridine,Ed U)染色法检测幼稚CD4+T细胞在体外CD3/CD28刺激后的增殖情况;流式细胞仪测定幼稚CD4+T细胞的凋亡;通过酶联免疫吸附(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)实验测定在体外刺激后敲低TPSAB1对幼稚CD4+T细胞干扰素-γ(interferon-γ,IFN-γ)、白介素-22(interleukin-4,IL-22)和IL-17分泌的影响。结果PBC患者NK细胞和幼稚CD4+T细胞TPSAB1表达水平显著高于健康对照者;与对照组比较,PBC患者的幼稚CD4+T细胞在CD3/CD28刺激后,显示出更强的增殖能力。然而,2组间细胞凋亡无差异。PBC患者的IL-22、IL-17和IFN-γ分泌水平明显升高。与对照组比较,敲低TPSAB1可抑制幼稚CD4+T细胞在CD3/CD28刺激下的增殖能力,同时降低IL-22、IL-17和IFN-γ分泌水平。结论抑制TPSAB1蛋白表达水平可阻断CD4+T细胞的增殖,提示其可能成为治疗PBC的新靶点。; 程亮张葆康曹佳伟; 关键词：原发性胆汁性肝硬化 IFN-Γ IL-22

胶质母细胞瘤中免疫和小胶质/巨噬细胞的特异性高表达基因具有间充质亚型的特性被引量：1: 2024年; 目的研究胶质母细胞瘤(GBM)中免疫细胞,特别是小胶质细胞/巨噬细胞中高表达的特异性基因集合,从而加深对胶质瘤中免疫微环境结构和功能的认识.方法在正常和GBM组织中,分析不同类型细胞中的分子表达情况,并得到免疫细胞和/或小胶质细胞/巨噬细胞(MM-Cells)中,特异性高表达的基因(MM-Genes).进一步研究MM-Genes在胶质瘤不同级别、不同分子亚型中的表达情况及对患者预后的影响.结果我们获得了一系列高度可靠的MM-Genes,包括CD74、HLA-DRB5、CCL3、NFAM1、DOCK8、LTC4S、GPR183、CCL4、SLAMF8、NCKAP1L、CD14、CD68、PLCB2.大部分MM-Genes在胶质瘤高表达,且随着级别而增加.另外,MM-Genes在GBM的间质亚型中高表达.其次,多数MM-Genes单个基因,以及MM-Genes的综合评分,均与患者预后相关,且高表达者预后差.结论MM-Genes与胶质瘤级别及GBM的间质亚型高度相关,且MM-Genes高表达者预后差,揭示了免疫调控与胶质瘤级别和分子亚型之间的关系.; 吕瑞姬昂薛小燕章翔毛星刚; 关键词：胶质母细胞瘤巨噬细胞免疫调控

一种烟草生殖细胞特异高表达基因及应用: 本发明涉及一种烟草生殖细胞特异高表达基因及应用，核苷酸序列如SEQ I D NO.1所示。本发明通过基因组信息学分析，鉴定获得栽培烟草该基因的编码序列及其启动子序列。通过候选启动子序列元件分析及基因表达谱分析，证实该基因...; 曾婉俐高茜向海英米其利朱玲超许力蒋佳芮张建铎黄海涛孔维松王根洪贾凌刘赫李雪梅

金针菇高表达基因的密码子偏好性及特征分析被引量：4: 2022年; 为探究金针菇的密码子偏好性,挖掘高表达基因的特征信息,以金针菇基因组及转录组数据为材料,分析金针菇的密码子偏好性及其影响因素,并对发育阶段高表达基因进行功能注释和顺式元件分析。分析表明,金针菇高表达基因表现出较强的密码子偏好性,且其偏好密码子多以胞嘧啶(C)结尾,此外在高表达基因中存在6种氨基酸的最优密码子较为保守。在进化过程中,金针菇高表达基因密码子偏好性受到自然选择压力的影响较大。功能注释分类表明,高表达基因多为核糖体通路相关的基因,与蛋白质翻译和生物合成相关。顺式元件分析表明,高表达基因启动子区域大多存在MeJA响应元件、ABA响应元件、光响应元件及MYB转录因子结合元件。研究结果可为提高金针菇异源表达效率和挖掘强启动子提供理论基础和思路。; 陈奕钊李晓宇吴家来胡佳刘媛媛叶新怡李慧陶永新; 关键词：金针菇密码子偏好性高表达基因

斑马鱼肌肉高表达基因近端非编码元件分析及功能检测: 2022年; 为鉴定鱼类肌肉组织特异性顺式调控元件,通过分析斑马鱼多个组织的转录组数据,筛选出肌肉高表达基因及低表达基因。通过MEME对肌肉高表达基因和低表达基因非编码区序列特征进行分析,在5个肌肉高表达基因的转录起始位点上游发现了序列保守的DNA区域,包含6个排列顺序一致的DNA基序。将其中一段目标片段插入具有Tol2转座子元件的基础启动子驱动的eGFP编码基因的上游,构建表达载体。注射载体至斑马鱼受精卵获得转基因胚胎,分析胚胎中eGFP荧光的表达模式,发现该DNA片段具有增强基因在肌肉特异性表达的功能。Tomtom预测该DNA区域可能作为Myod等多个转录因子的结合位点。研究结果有助于理解鱼类肌肉基因表达的遗传基础,并为利用生物信息学方法预测组织特异性转录调控元件提供新思路。; 鲁程成赵一凡范纯新王建; 关键词：顺式调控元件斑马鱼

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