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- 蛋白质组学被引量:6
- 2000年
- 陈龙
- 关键词:蛋白质组学研究功能蛋白质组学生命科学双向凝胶电泳生物功能
- 一种血浆蛋白质组学前处理方法
- 本发明涉及一种血浆蛋白质组学前处理方法,涉及蛋白质组学检测领域。本发明的技术方案对血清白蛋白的去除效率达到50%以上,同时对其他蛋白的检出影响较小,性能与去除试剂盒相当甚至更优。
- 邵阳王婷婷彭佳喜刘思思陈露贤丽曼
- 一种无扰动血浆蛋白质组学深度覆盖分析方法
- 本发明公开了一种无扰动血浆蛋白质组学深度覆盖分析方法。本申请通过混合血浆中的并行深度覆盖参比谱图库引入可以显著增加无扰动样本的覆盖深度;还可以作为大队列实验过程中批次效应评估监测与校正的有效手段。相对于direct DI...
- 秦伟捷张万军陈红杰赵川平
- 基于凝胶与非凝胶蛋白质组学技术的枣花蜜蛋白质鉴定分析
- 2025年
- 蛋白质是一种相对稳定存在于蜂蜜中的大分子物质,研究蜂蜜蛋白对探究蜂蜜生物活性,筛选溯源标志成分具有重要意义。该文针对中国特色单花种蜂蜜——枣花蜜,基于凝胶和非凝胶2种蛋白质组学技术鉴定分析采集枣花蜜样品中的蛋白质组成,共发现216个蜂源蛋白和595个植物源蛋白,其中24种蜂源蛋白首次在枣花蜜中鉴定到,包括MAGUK p55亚族成员6 X1亚型、几丁质结合2型结构域蛋白、肽酶S1结构域蛋白等;利用BLAST工具筛选了11个潜在的枣花蜜特征蛋白标志物,包括金属内切蛋白酶2-MMP样、FAS1结构域蛋白、解毒蛋白质等。GO功能注释分析发现枣花蜜中鉴定到的蜂源和植物源蛋白主要参与碳水化合物代谢、蛋白质水解等生物学过程,涉及ATP结合、三磷酸鸟苷结合等分子功能。该文基于2种蛋白组学分析方法探究了枣花蜜蛋白质组成,为研究枣花蜜蛋白生物活性成分及筛选特征蛋白标志物提供理论参考。
- 邓景升曾晓君张颖曹炜赵浩安程妮
- 关键词:蛋白质鉴定
- 一种基于蛋白质组学和代谢组学的活动性肺结核诊断方法
- 本发明公开了一种基于蛋白质组学和代谢组学的活动性肺结核诊断方法,包括以下步骤:收集疑似活动性肺结核患者的血清样本;使用蛋白质组学技术,检测血清样本中的特定蛋白质;使用代谢组学技术,检测血清样本中的特定氨基酸;将获得的蛋白...
- 唐骏张舒林
- 绝经后骨质疏松患者骨代谢与脂代谢的关系及血清蛋白质组学研究
- 2025年
- 目的探讨绝经后骨质疏松(PMOP)患者脂代谢与骨代谢的关系,并通过血清蛋白质组学分析筛选相关标志物,为PMOP的诊断和治疗提供新思路。方法收集125例绝经后患者资料,按骨密度分为骨质疏松组(75例)和非骨质疏松组(50例)。采集两组各5例患者的血清进行定量蛋白质组学分析。通过质谱和生物信息学分析,筛选差异表达蛋白,并进行GO富集分析和PPI蛋白互作网络分析。结果骨质疏松组的甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白(LDL)水平和颈动脉硬化斑块数量高于非骨质疏松组,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析显示,腰椎、股骨颈和髋部骨密度(BMD)与TG、LDL和β-Ⅰ型胶原交联C末端肽(β-CTX)呈负相关(P<0.05),颈动脉硬化斑块数量越多,BMD越低(P<0.05)。蛋白质组学分析筛选出30个差异表达蛋白,其中脂联素和磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶在骨质疏松组中表达上调。GO富集分析显示,差异蛋白主要富集在细胞过程、抗氧化活动、生物调节和信号传导等。PPI网络分析筛选出4个Hub基因:ADIPOQ、PCK2、CA3和CLIC1。结论骨质疏松组的TG、LDL和颈动脉硬化斑块数量升高,TG、LDL与BMD呈负相关。差异蛋白Q15848和Q16882可能通过腺苷单磷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路影响骨代谢和脂质代谢,该发现为PMOP的诊断和治疗提供了潜在生物标志物。未来研究将进一步探讨其具体机制,为临床干预提供新靶点。
- 林建立林移婷陈耀琦胡张洁蔡敏
- 关键词:绝经后骨质疏松症骨代谢脂代谢血清蛋白质组学
- 一种基于蛋白质组学诊断结直肠癌的产品及应用
- 本发明公开了一种基于蛋白质组学诊断结直肠癌的产品及应用。检测CLU、CFI、PON1、IGLC2、C8B、SERPINC1、ORM2和APOA4蛋白中至少一种的产品在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。本发明的蛋白质标志物C...
- 李秀玲陈锦飞王美林熊芳芳董雪芳陈成
- 基于TMT标记的定量蛋白质组学分析超低温冷冻对小黄鱼肌肉差异蛋白质的影响
- 2025年
- 采用串联质谱标签(TMT)标记的定量蛋白质组学技术,研究了-45℃超低温冻藏时间(0,3和6个月)对小黄鱼(Larimichthys polyactis)肌肉差异蛋白表达的影响。结果表明,与新鲜小黄鱼相比,在-45℃超低温冻藏3个月和6个月的小黄鱼肌肉中差异蛋白分别有71和104种,其中上调蛋白分别有13和40种,下调蛋白分别有58和64种。在冻藏6个月的小黄鱼肌肉中发生变化的蛋白质更多。此外,共筛选出15种差异蛋白,与小黄鱼的pH、持水力、挥发性盐基氮(TVBN)、硬度、弹性、羰基、巯基和Ca^(2+)-ATPase活性中的至少一个品质指标呈显著相关性,有望成为与冷冻小黄鱼品质相关的指示蛋白标志物。
- 许丹马新悦郑斌邓尚贵张小军
- 关键词:超低温冷冻蛋白质组学差异蛋白小黄鱼
- 基于蛋白质组学联合转录组学的肺腺癌预后模型和标志物研究
- 2025年
- 目的基于蛋白质组学和转录组学筛选肺腺癌预后生物标志物并构建预后模型。方法从TCGA公共数据库下载肺腺癌的蛋白质组学、转录组学及患者临床特征数据。按照7∶3比例将数据集分成训练组和验证组。根据患者临床生存时间、生存状态和蛋白表达数据,在训练集中进行蛋白表达单因素预后分析。采用Lasso-step Cox方法,构建肺腺癌患者预后模型,并计算风险分数。根据风险分数中位数将患者分为高风险组和低风险组,并分析2组预后情况。构建预后列线图模型和校准曲线,对该模型进行临床分组验证和相关性分析。基于HPA数据库分析模型蛋白表达情况,并对风险蛋白进行富集分析。选取20例初诊肺腺癌患者进行免疫组化和临床特征分析。结果本研究筛选出5个与预后相关的蛋白,构建了风险蛋白模型。风险分数对肺腺癌患者的预后具有预测作用。该风险模型展现出较强且独立的预后预测能力。列线图模型在预测个体预后方面表现出较高的准确性。此外,风险模型及其计算出的风险分数与临床分期特征之间存在内在联系。HPA数据库分析表明,CD38、CD49B、ADAR1和cdc25C4在肺腺癌组织中显著高表达。20例临床标本验证了初诊肺腺癌远处转移患者的CD49B呈高表达,且对治疗较敏感。结论蛋白质组学和转录组学联合分析肺腺癌预后标志物的结果较可靠。CD49B在肺腺癌中发挥重要作用,基于该基因构建的预后预测模型有望为临床治疗肺腺癌提供重要参考。
- 严循东张先稳
- 关键词:蛋白质组学转录组学肺腺癌
- 一种蛋白质组学标准品及其制备方法
- 本发明公开了一种蛋白质组学标准品及其制备方法,具体还公开了相应的试剂盒和蛋白质组学标准品细胞株筛选的方法。本发明所提供的标准品具有代次间稳定,多次传代后,蛋白质组的定量稳健,应用本发明的标准品能够有效的提高蛋白质组学定量...
- 卢少华陈洋张弓
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- 梁清华

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- 供职机构:中南大学湘雅医院
- 研究主题:痹肿消汤 脑出血 胶原诱导性关节炎大鼠 蛋白质组学研究 肝阳化风证
- 张玉奎

- 作品数:1,071被引量:2,253H指数:22
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- 肖志强

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- 供职机构:中南大学湘雅医院
- 研究主题:鼻咽癌 蛋白质组学 双向凝胶电泳 蛋白质组 蛋白质组学研究
- 陈主初

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- 供职机构:中南大学湘雅医院
- 研究主题:鼻咽癌 蛋白质组学 鼻咽肿瘤 蛋白质组学研究 蛋白质组
- 张丽华

- 作品数:717被引量:819H指数:13
- 供职机构:中国科学院大连化学物理研究所
- 研究主题:蛋白质 蛋白质组 肽段 整体柱 蛋白质组学