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蛋白质折叠被引量:2
1995年
蛋白质折叠冯佑民(中国科学院上海生物化学研究所,上海200031)由20种氨基酸组成的多种多样蛋白质,具有形形色色的功能,几乎参与了生命活动的所有方面并起着关键作用。那末,蛋白质是怎样生成的?其功能是怎样被赋予的呢?遗传信息从DNA转录到mRNA再经...
冯佑民
关键词:蛋白折叠
mRNA三级结构局部碱基对螺旋参量对蛋白质折叠速率的影响
2025年
为研究局部碱基对螺旋参量对蛋白质折叠速率的作用机制,收集了100个具有实验折叠速率的蛋白质,通过计算获得各个蛋白质相对应的mRNA三级结构数据,筛选出其中的局部碱基对螺旋参量,深入研究这些参量与蛋白质折叠速率之间的相关性;将所选蛋白质按照折叠类型和二级结构进行分组,进而分析这些参量对不同类蛋白质折叠速率影响的差异。研究结果表明,蛋白质折叠速率与X-disp、Y-disp、h-Rise、Incl(η)、Tip(θ)和h-Twist六个参量存在不同程度的相关性,说明mRNA三级结构的局部碱基对螺旋参量在调控蛋白质折叠速率方面发挥了重要作用。
彭诗雅李瑞芳宋鑫伟高姗田旭邓俊超
一种细胞内蛋白质折叠状态的测定方法
本发明提供了一种细胞内蛋白质折叠状态的测定方法,属于定量蛋白质组学测定技术领域。本发明先在收集细胞后加入非特异性蛋白酶,然后冷冻研磨,离心过滤后收集滤液和蛋白质蛋白质进一步使用特异性酶胰蛋白酶进行酶解,接着使用质谱分析...
赵樑赵婷孙振兴马拯
基于云计算的蛋白质折叠空间结构预测
2024年
构建基于云计算的蛋白质折叠空间结构预测框架,通过数据云存储设备获取蛋白质序列原始数据,采用HDFS(Hadoop Distributed File System)分布式存储方式保存于云端。资源和队列管理器RQM(Resource Queue Man‐agement)开启云端虚拟机后,以之作为扫描节点(Sensor Node,SN),SN基于二维AB非格点模型建立最小蛋白质分子能量优化函数,采用局部搜索机制改进的量子遗传算法对其作优化求解。利用云端GPU设备处理模型训练数据,即可实现蛋白质折叠空间结构的自动化预测。实验结果表明:蛋白质序列能量势函数计算结果更小、执行效率更高、GDT-TS(Geothermal Development and Testing Tool Suite)评价指标值更大。
徐胜超杨波王宏杰毛明扬蒋金陵蒋大锐
关键词:云计算蛋白质折叠量子遗传算法
基于蛋白质折叠的机器人集群可编程控制方法研究
顾玉平
“后AlphaFold时代”的蛋白质折叠问题被引量:1
2023年
以AlphaFold为代表的使用深度学习人工智能的蛋白质结构预测方法改变了结构生物学乃至整个生命科学领域.生命科学的研究已进入“后AlphaFold时代”,但我们对细胞环境内的蛋白质折叠过程还知之甚少.在本文中,我们回顾了蛋白质折叠早期的研究历史.
胡昕炜王志珍王磊
关键词:蛋白质折叠结构生物学人工智能生命科学蛋白质结构预测ALPHA
邹承鲁先生与中国蛋白质折叠研究被引量:1
2023年
邹承鲁先生是近代中国生物化学的奠基人之一,一生致力于蛋白质结构与功能关系的研究,在细胞色素与呼吸链酶系、人工合成胰岛素、酶活性不可逆抑制动力学、酶活性部位的柔性以及蛋白质折叠和分子伴侣等不同领域都做出了重大贡献。1964年我从中国科学技术大学生物物理系毕业,被分配到中国科学院生物物理研究所。
王志珍
关键词:蛋白质折叠细胞色素蛋白质结构与功能
基于深度中心点模型的蛋白质折叠识别方法及系统
本发明属于计算生物学技术领域,公开一种基于深度中心点模型的蛋白质折叠识别方法及系统,该方法的目标是学习一个将每个蛋白质链映射为单位向量的深度嵌入网络,使得在嵌入空间中折叠类型相同的蛋白质链距离较近,折叠类型不同的蛋白质链...
杨伟张蕾郭悰
蛋白质折叠与力学传感的单分子磁镊操纵研究进展
2023年
蛋白质折叠与相互作用是物理、生物等多学科交叉领域关注的基本问题.力生物学的前沿研究表明,一系列对力敏感的蛋白质在机械力作用下的去折叠与复折叠动力学及相互作用调控,是实现其力感知的物理机制.前沿单分子操纵技术的发展使得在单分子水平定量探究蛋白质折叠与细胞力学传感的分子机制成为可能.本文重点介绍近年来蛋白质折叠与力学传感的单分子磁镊操纵研究进展,包括单结构域蛋白质折叠-去折叠动力学、自由能曲面的构造,及细胞黏着斑与胞间连接的力敏感蛋白行使生物功能的分子机制.
乐世敏陈虎
关键词:蛋白质折叠蛋白质相互作用单分子操纵
蛋白质折叠方式的确定方法、装置、电子设备和存储介质
本公开涉及计算机和生物学领域,尤其涉及一种蛋白质折叠方式的确定方法、装置、电子设备和存储介质,确定目标蛋白质对应的氨基酸序列以及电子密度图,氨基酸序列中包括至少两个氨基酸。根据电子密度图确定至少一个支撑点,根据每两个支撑...
郭良越刘海宾李盼刘丙华贺俊宏郭春龙

相关作者

李晓琴
作品数:68被引量:55H指数:5
供职机构:北京工业大学
研究主题:折叠类型 蛋白质折叠 蛋白质结构 隐马尔科夫模型 肺结节
王炜
作品数:153被引量:212H指数:8
供职机构:南京大学
研究主题:蛋白质 蛋白 蛋白质折叠 粉煤灰漂珠 漂珠
王志珍
作品数:51被引量:82H指数:4
供职机构:中国科学院生物物理研究所
研究主题:分子伴侣 蛋白质 蛋白质折叠 蛋白质二硫键异构酶 胰岛素
张慧玲
作品数:23被引量:0H指数:0
供职机构:深圳先进技术研究院
研究主题:蛋白质折叠 蛋白质 热力学过程 折叠 热力学分析
黄文奇
作品数:108被引量:500H指数:13
供职机构:华中科技大学计算机科学与技术学院
研究主题:启发式算法 NP难度 穴度 PACKING问题 蛋白质结构预测