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- 一种蛋白质互作网络功能模块挖掘方法及系统
- 本发明涉及生物组织蛋白质功能模块研究技术领域,提出了一种蛋白质互作网络功能模块挖掘方法及系统。所述方法包括蛋白质互作网络数据预处理环节、蛋白质互作网络功能模块挖掘模型构建及优化环节、蛋白质互作网络功能模块挖掘结果输出环节...
- 杜航原郝思聪王文剑
- 一种基于多通道图卷积神经网络的蛋白质互作网络节点分类方法
- 一种基于多通道图卷积神经网络的蛋白质互作网络节点分类方法,通过组合高阶信息来提高分类效果,根据蛋白质相互作用数据构建一个蛋白质互作网络,构建多通道图卷积神经网络模型,该模型包含两层结构,使用不同的图卷积核组合,在少数有标...
- 杨旭华马钢峰徐新黎
- 蛋白质互作网络进化启发的靶标药理动物模型预测研究
- 何洋
- 探究先天性小耳畸形潜在基因蛋白质互作网络机制
- 目的: 先天性小耳畸形作为一种常见的耳郭出生缺陷,与遗传因素关系密切,利用GeneORGANizer工具、DisGeNET和HPO数据库,汇总相关综合征及候选基因库,构建基因蛋白质互作网络,筛选和分析其重点基因,以期为...
- 唐宏涛
- 关键词:先天性小耳畸形致病基因分子机制
- 基于孟德尔随机化方法的膀胱癌常见危险因素与蛋白质互作网络构建
- 目的: 本研究拟通过孟德尔随机化(Mendelian Randomization,MR)方法分析三种危险因素与BLCA的因果关联,并构建危险因素与蛋白质互作网络,从而为研究危险因素与BLCA的关系和分析导致BLCA的可...
- 刘金婵
- 关键词:膀胱癌蛋白质互作网络
- 一种基于蛋白质互作网络的功能模块检测方法
- 本发明公开一种基于蛋白质互作网络的功能模块检测方法,在蛋白质互作网络中,使用LAR机制表示全部的解集,加快了算法的收敛速度。然后使用多目标粒子群优化算法在解空间搜索最优解。本发明基于粒子群算法使用帕雷托支配概念解决了多目...
- 黄艳泽 林丽美 李金娥 余辉
- 一种蛋白质互作网络功能模块挖掘方法及系统
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- 疾病蛋白质互作网络整合及挖掘跨疾病作用模块的方法
- 本发明公开了一种疾病蛋白质互作网络整合及挖掘跨疾病作用模块的方法,包括以下步骤:(1)人类蛋白质组注释的获取,注释内容包括;(2)从蛋白质相互作用公共数据集收集整理可信的蛋白质互作数据,并对蛋白质互作数据进行整合、重打分...
- 陈铭陈宏俊周业凯
- 一种利用蛋白质互作网络构建自闭症动物模型的方法
- 本发明公开了一种利用蛋白质互作网络构建自闭症动物模型的方法,包括以下步骤:构建自闭症蛋白相互作用网络;从上述网络中筛选与自闭症相关的网络模块;从筛选得到的网络模块中找到与自闭症相关的关键节点;利用基因编辑技术获得关键节点...
- 杨新平 范翠霞 高玥 梁关梅 黄浪王静 杨小雪 迟雅丽
- 绵羊睾丸差异基因及蛋白质互作网络关系研究被引量:2
- 2022年
- 【目的】整合分析多个绵羊睾丸转录组数据集,揭示绵羊睾丸差异基因及蛋白质互作网络关系,以期探索影响绵羊精子生成的关键基因,为绵羊的繁殖提供理论参考。【方法】对74个绵羊睾丸转录组进行生物信息学分析,通过limma软件包进行差异基因分析,使用WGCNA构建加权绵羊睾丸差异基因共表达网络,并通过MCODE计算网络中重要基因;利用Metascape进行功能富集分析,利用Cytoscape插件AutoAnnotate识别基因集簇。【结果】最终筛选到11884个基因,构建237366对蛋白质互作关系;对2058个差异基因构建蛋白质互作网络,产生46169对蛋白质互作关系,确定了4个得分最高的基因集合。对2058个差异基因构建加权共表达网络,共获得7个模块,其中Blue模块内有929个基因,功能富集分析发现显著富集于雄性配子产生、繁殖、精子发生、鞭毛运动和AMPK信号通路等,且富集结果高度连接并聚成一个完整的网络,最终确定了25个参与精子发生和精子细胞发育过程的关键基因。【结论】本研究揭示了绵羊睾丸表达基因的蛋白质互作网络和多维差异基因的蛋白质互作网络,最终找到与睾丸精子发生相关且有互作关系的25个基因,为绵羊繁殖研究提供理论依据。
- 刘在霞段仕孙燕勇吕琦付绍印何小龙张文广张文广
- 关键词:绵羊蛋白质互作网络精子发生
相关作者
- 王靖

- 作品数:40被引量:17H指数:2
- 供职机构:电子科技大学
- 研究主题:GENE ONTOLOGY 运算放大器 蛋白质互作网络 服务器
- 郭政

- 作品数:143被引量:278H指数:8
- 供职机构:哈尔滨工业大学
- 研究主题:基因表达谱 基因功能 ONTOLOGY 基因表达 基因芯片
- 李霞

- 作品数:368被引量:1,308H指数:16
- 供职机构:清华大学
- 研究主题:基因表达谱 基因芯片 护理 基因功能 基因表达
- 陈铭

- 作品数:66被引量:60H指数:4
- 供职机构:浙江大学生命科学学院
- 研究主题:生物信息学 基因芯片 水稻 蛋白质互作网络 靶位
- 马文财

- 作品数:6被引量:4H指数:2
- 供职机构:北京理工大学机械与车辆学院
- 研究主题:蛋白质互作网络 蛋白质功能 GENE ONTOLOGY 相关蛋白质