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中国云南省瑞丽等地艾滋病病毒I型C亚型的分布研究被引量：10: 1996年; 1994年中国预防医学科学院艾滋病监测中心与美国CDC合作,首次发现在中国云南省存在HIV-1C亚型病毒的流行,为了解该省C亚型流行的地理分布及流行时间,取"八五"国家科技攻关项目采集的静脉吸毒者HIV-1抗体阳性血清共192份,用特异肽ELISA进行测定,结果表明1992年C亚型在瑞丽开始出现5.1%;1993年C型在瑞丽达12.9%,陇川达30.4%;1994年C亚型在瑞丽达31.9%,陇川达33.3%。吸毒者中C型流行正逐年上升,C亚型是否可能成为该地区主要的流行亚型有待继续观察。; 李大勤郑锡文张桂云田春桥曲书泉; 关键词：艾滋病毒 C亚型 IDU

深度测序用于分析抗病毒治疗急性期感染者的HIV-1准种群变化被引量：8: 2017年; 目的建立针对艾滋病病毒I型(HIV-1)三个基因区片段的Illumina Hiseq深度测序(简称Hiseq测序)方法,并尝试用于分析抗病毒治疗急性期感染者的HIV-1准种群变化规律。方法对2例在急性期启动抗病毒治疗的HIV-1感染者进行随访检测,直至第96周。提取外周血单个核细胞(PBMC)中的脱氧核糖核酸(DNA),对基线血液样本进行HIV-1基因亚型分析。分别以gag、pol和env基因区为目的片段,对基线及随访样本进行巢式聚合酶链反应(PCR),扩增产物经一代测序确认无误后纯化、混合构建DNA文库,进行Hiseq测序。分析HIV-1准种群分布,计算基因离散率,并做系统进化树分析。结果接受抗病毒治疗后,2例感染者体内的HIV-1病毒载量下降,到第12周后无法检出;CD4+T淋巴细胞数在治疗第2、4周时有所下降,随后回升。2例感染的HIV-1毒株分别为CRF01_AE亚型和CRF07_BC亚型。核酸扩增成功的样本全部成功进行了Hiseq测序,每个目的基因区片段都获得了十万级的序列数。在基线点,频数最高的第一个准种群序列的频数占全部序列总频数的比例均超过50%。抗病毒治疗后,准种群的分布发生不同程度的变化,其中频数第一准种群频数所占比例先减小,从第12周起多数增大,第72周再减小。样本内平均基因离散率整体稳定,小范围波动。每个样本3个基因区各随访时间点与基线点之间的平均基因离散率在治疗第2周增大,随后保持稳定。系统进化树显示,不同时间的准种群序列散在分布且距离接近。结论针对HIV-1 gag、pol和env基因区的Hiseq测序方法可有效用于分析HIV-1准种群的变化规律,早期抗病毒治疗可降低病毒载量调定点且延长准种群分散时间。; 冯凯迪张志敏张秋月宋爱心蒋岩于凤娇马仲慧潘品良张彤吴昊粟斌邱茂锋; 关键词：艾滋病病毒I型抗病毒治疗准种进化

一例HIV-1急性感染者奠基病毒的gp160基因序列特征及其假病毒构建: 2014年; 目的观察急性感染期艾滋病病毒I型（HIV-1）gp160的全长基因序列及感染特征。方法从一例处于Feibig I期HIV-1感染者血浆中提取RNA,扩增gp160全长基因并测序,分析其生物学信息;将gp160全长基因与pcDNA3.1His/V5真核表达载体连接,构建Env-pcDNA3.1真核表达质粒,与骨架质粒pNL4-3.Luc.R-E-共转染293细胞,包装出假病毒。用包装的假病毒感染ghost细胞,测定感染细胞的荧光素酶活性（RLU）,鉴定假病毒的感染活性。结果成功扩增出gp160全长基因,嗜性预测为CCR5,N-糖基化位点数与标准株HXB2相同,但gp120糖基化程度更高,氨基酸变异主要集中在V1-V5区。假病毒感染试验显示,RLU值达到7log。结论获得了处于急性感染期的HIV-1gp160基因序列和高感染活性的假病毒。; 刘志英李甜寇卜心徐萌徐树莹陆小凡焦艳梅张彤陈德喜吴昊; 关键词：艾滋病病毒I型假病毒

针对MSM人群的HIV-1早期感染检测策略研究被引量：2: 2014年; 目的建立针对男男性行为人群(MSM)艾滋病病毒(HIV)感染的高敏感检测策略,减少窗口期漏检。方法收集来自黑龙江、辽宁、内蒙古、宁夏和青海省(自治区)的MSM人群专项调查样本,分别用中国现行的HIV抗体常规检测策略、新检测策略一、新检测策略二和新检测策略三进行检测,对常规策略与3种新策略的检测结果进行对比、分析。结果 11 023份调查样本中,常规策略[三代酶联免疫吸附试验(ELISA)+蛋白免疫印迹试验(WB)]检出的抗体阳性、阴性和不确定标本分别为282份、10 716份和25份;新策略一(四代ELISA+WB)检出的抗体阳性、阴性和不确定标本分别为282份、10 676份和65份;新策略二(三代ELISA+WB+集合核酸)检出的核酸阳性,抗体阳性、阴性和不确定标本分别为28份、282份、10 688份和25份;新策略三(四代ELISA+WB+集合核酸)检出的核酸阳性,抗体阳性、阴性、不确定标本分别为13份、282份、10 663份和65份。常规策略、新策略一至三的检测敏感性分别为90.96%、90.96%、100%和95.16%,新策略二和新策略三的检测敏感性显著高于常规策略(P<0.05),且新策略对早期及急性HIV感染者的检测能力优于常规策略。结论针对MSM人群的HIV新检测策略,可以减少早期及急性HIV感染者的漏检,应根据实验室检测能力和样本量尽快在该人群中推广使用。; 张娜江华洲于海英颜浩张洁吴少慧杨景元杨东志马韶辉蒋岩; 关键词：男男性行为人群艾滋病病毒I型

云南省临沧市2012年HIV-1基因型和耐药传播警戒线调查被引量：2: 2013年; 目的了解2012年临沧市未经抗病毒治疗的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者中,病毒的基因型分布和耐药株传播水平。方法根据HIV-1耐药警戒线调查实施方案,对2012年2-7月,临沧市符合方案要求的50份年龄在18-25岁的、新发现的HIV-1感染者的血浆样本,进行耐药基因型检测和耐药株传播水平分析。结果 50份血浆样本中,36份完成了基因型及耐药鉴定。通过进化分析对pol区进行分型,75.0%(27/36)的样本为CRF08_BC,其他依次为URF_BC(8.3%,3/36)、CRF07_BC(5.6%,2/36)、CRF01_AE(5.6%,2/36)和C亚型(5.6%,2/36)。URF_BC重组中有两例重组模式相同。获得的序列中未检测到监测相关的耐药突变(Surveillance drug resistance mutations,SDRM),按照耐药警戒线的统计方法估算,耐药株流行率<5%。结论临沧市目前主要流行的HIV-1亚型为CRF08_BC,HIV-1耐药株处于低度流行水平。为控制耐药传播水平的上升,在加强重点人群艾滋病防治的基础上,应加强规范艾滋病抗病毒治疗及科学管理,同时有计划地开展相关的耐药监测。; 陈敏苏莹珍杨朝军董莉娟杨莉施玉华陈会超罗红兵贾曼红马艳玲; 关键词：艾滋病病毒I型基因型抗病毒治疗

用分子对接技术预测HIV-1整合酶抑制剂药物雷特格韦的耐药机制被引量：2: 2013年; 目的探究整合酶的分子耐药机制。方法研究采用Discovery Studio 2.5软件模块的分子对接程序,构建整合酶药物雷特格韦(Raltegravir,RAL)与整合酶核心区蛋白晶体结构(1BL3)的复合物模型,并结合已知的整合酶耐药突变位点Q148H、N155H、Y143C和其他野生型残基突变(T97A、A128T、E138K、E157Q、G163R),构建一系列整合酶蛋白耐药基因突变体。以此进一步计算艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)整合酶蛋白发生氨基酸残基突变后,与雷特格韦之间分子自由能的改变,并分析雷特格韦与不同整合酶蛋白耐药基因突变体之间的结合自由能。结果主要突变Q148H、N155H、Y143C均位于RAL与整合酶的活性中心,均可明显改变雷特格韦与核心区晶体之间的结合自由能,以N155H改变最为明显,其次为Q148H、Y143C。此外,野生型基因突变也造成一定程度的自由能改变,具有一定的耐药性意义。结论证实耐药位点突变导致整合酶蛋白与雷特格韦之间结合自由能增大,影响药物与整合酶的结合。; 程绍辉马晓慧; 关键词：艾滋病病毒I型整合酶分子对接耐药机制

四川省77名男男性行为人群HIV-1分子流行病学研究被引量：10: 2011年; 目的了解四川省男男性行为人群(MSM)中感染艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)各亚型的流行情况,探索HIV-1感染规律。方法采集近年来MSM人群中HIV感染者的样本,进行核酸提取、聚合酶链反应(PCR)及基因测序,对所得结果进行pol基因初步鉴定,同时用软件MEGA 4.1进行系统发生分析。结果在HIV感染者较多的成都、绵阳和达州三个地区采集的234份样本中,基因测序成功77份,其中CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型分别为42份、24份和11份,各组群内基因离散率分别为(1.56%±1.10%)、(2.56%±0.82%)和(5.63%±2.02%)。结论各亚型组群内的部分感染者来自该亚型同一种毒株感染,CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型毒株是当前四川省MSM人群HIV-1的主要流行毒株。; 袁丹冯燎奚竞婧罗德维贾蜀光赖文红李恬余佳梁姝魏东兵周更生秦光明于飞刘红露; 关键词：艾滋病病毒I型男男性行为人群流行病学

HIV-1感染者CD_4^+T淋巴细胞及其各亚群细胞增殖和消亡情况的观察被引量：7: 2009年; 目的探讨艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者CD4+T淋巴细胞(CD4细胞)及其各细胞亚群:纯真细胞(TN)、中心记忆细胞(TCM)和效应记忆细胞(TEM)的增殖和消亡情况。方法观察23例未经抗病毒治疗、感染时间大于12个月的HIV-1感染者,以16例健康者为对照,通过流式细胞仪分析CD4+T淋巴细胞CD45RO和CD27的表达情况,把CD4细胞分为TN(CD45RO-CD2+7)、TCM(CD45RO+CD2+7)和TEM(CD45RO+CD2-7)三个亚群。以Ki-67抗原的表达代表细胞的增殖,AnnexinV检测阳性代表细胞的消亡,比较HIV-1感染组和健康组CD4细胞及其各个亚群增殖和消亡的情况。结果健康组(n=16例)CD4细胞增殖率为(0.36±0.24)%,各亚群增殖率分别为TN(0.07±0.05)%,TCM(0.57±0.52)%和TEM(0.40±0.39)%;CD4细胞消亡率为(6.30±2.41)%,各亚群消亡率分别为TN(4.43±2.21)%,TCM(6.58±2.50)%和TEM(12.47±8.98)%;与之相比,HIV-1感染组(n=23例):CD4细胞增殖率为(2.93±2.72)%(z=-4.511,P=0.000),各亚群增殖率:TN(0.52±0.42)%(z=-4.785,P=0.000),TCM(5.55±5.07)%(z=-4.241,P=0.000)和TEM(4.53±5.20)%(z=-3.884,P=0.000);CD4细胞消亡率为(23.59±16.27)%(z=-3.883,P=0.000),各亚群消亡率:TN(17.25±15.80)%(z=-2.227,P=0.026),TCM(25.16±16.55)%(z=-3.940,P=0.000),TEM(29.56±16.77)%(z=-3.626,P=0.000)。与健康组相比,HIV-1感染组CD4及其各细胞亚群增殖率和消亡率明显增加,差异有统计学意义。结论与健康组相比,HIV-1感染者CD4细胞及其各个亚群细胞消亡和增殖有明显增加,细胞进入高速更新的状态,纯真细胞亚群和记忆细胞亚群组成比没有明显变化。; 任翊刘意黄晓婕陈新月吴昊李海英; 关键词：艾滋病病毒I型消亡

河南省HIV-1新近感染者耐药基因研究被引量：7: 2009年; 目的了解河南省艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)新近感染者的耐药情况。方法2006年8月-2007年6月,在河南省艾滋病自愿咨询(VCT)检测点发现的未进行抗病毒治疗的HIV-1感染者,以酶联免疫吸附试验初筛、蛋白印迹试验确认HIV-1感染,BED-CEIA方法检测新近感染。检出的新近感染样品进行基因型耐药检测,提取血浆中RNA,套式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增HIV-1pol基因区,PCR产物双脱氧法测序,所得序列与LosAlamos HIV标准株序列比对,构建系统进化树分析亚型;利用Stanford HIVdb Drug Resistance Database分析耐药相关突变(DRM)和耐药情况。结果共检出HIV-1新近感染39例,扩增测序有34例新近感染样品分析成功。亚型分析结果为B′亚型32例(94.1%),CRF01_AE重组亚型1例(2.9%),C亚型1例(2.9%)。未发现蛋白酶抑制剂(PI)主要DRM,检测到10例(29.4%)存在PI次要DRM;未发现核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)的DRM;3例(8.8%)存在非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)的DRM。耐药分析显示,有2例(5.9%)对NNRTI类药物耐药。结论目前河南省HIV-1新近感染人群中耐药状况处于中等水平,有必要加强HIV-1的耐药监测。; 涂源泉田飞姚均孙国清杨荣阁郑永唐蒋岩; 关键词：艾滋病病毒I型耐药基因

云南省昆明地区高危人群HIV-1二重感染的研究被引量：1: 2009年; 目的了解云南省昆明地区高危人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)二重感染的发生情况与特征。方法筛选昆明地区高危人群出现HIV-1二重感染的病例。通过不同的PCR/测序引物得到不同的测序结果,或直接测序时碱基模糊不清而确定的可疑二重感染病例,然后采用TA克隆的方法对单个PCR克隆进行测序,找到血浆标本中的HIV-1准种,并分析其系统发生和重组结构。结果昆明地区的高危人群中,HIV-1二重感染的发生率为7.7%(2/26)。2名具有高危异性性接触史的HIV-1感染者,分别为CRF01_AE和CRF08_BC或CRF07_BC的二重感染。结论昆明地区高危人群HIV-1的二重感染较为常见,这为快速产生新的重组病毒株提供了基础。该研究提示,该地区高危人群经常暴露于新的病毒株,将加速基因型内重组的发生。; 李晓杰夏雪山杨荣阁武部豊草川茂; 关键词：艾滋病病毒I型高危人群二重感染

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