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- 基于生物信息学分析的细胞周期相关基因CTSV鉴定、机制探索及临床相关性研究
- 研究背景及目的肝癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）是全世界病死率第三的恶性肿瘤,其异质性高、预后极差,大多数患者检出时已发展为肿瘤晚期。对于早期肝癌患者,肝切除术仍是目前最有效的手段,然而术后...
- 张文
- 关键词：细胞周期肿瘤微环境肝癌
- 软骨细胞中生物钟基因Bmal1对细胞周期相关基因表达的影响
- 2024年
- 目的 探讨生物钟和细胞周期在骨关节炎(OA)软骨细胞中内在的关系,主要是时钟基因Bmal1对细胞周期相关基因的调控。方法 将胰岛素-转铁蛋白-硒(ITS)诱导后的软骨样ATDC5细胞分为normal组、OA组、LV-Bmal1组。采用CCK8法检测各组细胞活力;RT-qPCR法检测Bmal1、Per1、Wee1、Cdk1、Ccnb1和Mmp13 mRNA在各组中的表达;Western blot检测BMAL1、PER1、WEE1、CDK1、CCNB1和MMP13蛋白在各组中的表达水平;流式细胞测量术分析Bmal1对细胞周期中不同分期及细胞凋亡的影响;分析Bmal1对Per1、Wee1、Cdk1、Ccnb1和Mmp13的调控和它们在OA中发挥的作用。结果 与normal组相比,OA组细胞活力提高,Bmal1、Wee1的mRNA相对表达量下降,Per1、Cdk1、Ccnb1、Mmp13的mRNA相对表达量明显增加;LV-Bmal1组细胞活力下降,Bmal1、Wee1的mRNA相对表达量上升,Per1、Cdk1、Ccnb1、Mmp13的mRNA相对表达量下降(P<0.05);相关性分析显示,Bmal1与Wee1呈正相关,二者与Per1、Cdk1、Ccnb1或Mmp13存在负相关;Western blot结果显示,不同组别中蛋白表达水平的结果与PCR趋势一致;细胞周期和细胞凋亡检测结果显示,和normal组相比,OA组S期、G2/M期缩短,细胞比例明显下降,细胞早期和晚期凋亡比例增加,LV-Bmal1组S期、G2/M期延长,细胞比例增加,早期和晚期凋亡比例下降。结论 炎性软骨细胞中生物钟基因Bmal1可能参与调节细胞周期相关基因的表达。
- 杨春生王添兴张铁成武恒敏王宝兰
- 关键词：生物钟细胞周期软骨细胞
- 细胞周期相关基因的胶质母细胞瘤预后模型构建及RFC2的细胞增殖效应研究
- 2024年
- 目的研究复制因子C亚基2(RFC2)与胶质母细胞瘤(GBM)患者预后和肿瘤细胞增殖之间的关系,并探索其在GBM发展中的潜在分子通路。方法利用生物信息学方法,筛选出可作为GBM独立预后因素的细胞周期基因,结合临床指标,构建GBM患者风险评分模型并验证其预测能力,对目标基因RFC2进行GO、KEGG和GSEA分析。取对数生长期的U87 GBM细胞进行慢病毒转染后分组(空白对照组、shRFC2#1、shRFC2#2),通过qRT-PCR、Western blotting、Edu染色、克隆形成实验检测mRNA表达、蛋白表达和细胞增殖。结果RFC2在GBM中表达上调,并随着胶质瘤病理级别升高,呈明显上升趋势。基因功能与通路分析结果提示,RFC2在姐妹染色体分离、染色体分离、细胞器裂变、核分裂、核有丝分裂等进程中,促进细胞周期过程中G1向S期转变。qRT-PCR和Western blotting结果显示,相较空白对照组,慢病毒敲低组中转录mRNA减少(P<0.0001)、翻译蛋白量减少;同样,与空白对照组相比,慢病毒敲低组Edu染色阳性率降低(P<0.0001),集落形成能力相应降低(P<0.001)。结论RFC2在GBM中高表达,且与胶质瘤分级和患者不良预后相关,促进GBM细胞增殖;RFC2有可能成为GBM潜在的生物标志物和治疗靶标。
- 王二静吴伟周浩宇王乙錩项健阳王佳王茂德
- 关键词：预后
- ID1通过调控细胞周期相关基因SPC25促进结肠癌细胞增殖
- 梁润华
- 基于细胞周期相关基因的胶质瘤患者预后模型构建与验证
- 2023年
- 目的探讨细胞周期相关基因在胶质瘤患者中的表达及预后价值。方法利用CGGA数据库筛选与胶质瘤患者预后相关的细胞周期基因,并基于CGGA与TCGA中胶质瘤患者的临床数据,通过LASSO回归分析,构建预测患者生存情况的预后模型。根据计算公式,区分高低风险组患者,组间进行GSEA富集分析与ssGSEA免疫微环境分析。结果筛选到10个与患者预后密切相关的细胞周期基因,LASSO回归分析纳入4个基因[细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2C(CDKN2C)、姐妹染色单体分离的PTTG1调控因子(PTTG1)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、WEE1 G2检查点激酶(WEE1)]构建预后模型,计算公式为:风险值(risk socre)=(0.008)×CDKN2C表达量+(0.022)×PTTG1表达量+(0.031)×CDK2表达量+(0.127)×WEE1表达量。生存分析显示,高风险组患者生存率低于低风险组,ROC曲线表明,模型在CGGA与TCGA队列中,均具有较好的预测能力。GSEA富集分析显示,高风险组富集到多个细胞周期进程相关的信号通路,提示可能参与胶质瘤的恶性进程。免疫微环境分析表明,高风险组患者的免疫细胞浸润与免疫反应激活程度均高于低风险组。结论基于细胞周期相关基因的预后模型可较好地应用于胶质瘤患者的预后预测,纳入的关键基因可能是胶质瘤治疗的可靠靶点。
- 牛晓辰李响张学敏王春红成睿王勇琦桂子玮吉宏明
- 关键词：胶质瘤细胞周期预后模型生物信息学
- EGFR-ERK介导的GRHL1活化通过上调细胞周期相关基因促进肺癌细胞周期的进程
- 目的：Grainyhead-like1（GRHL1）是一种参与胚胎发育的转录因子。然而，对GRHL1在癌症中的生物学功能知之甚少。本研究旨在探索GRHL1在非小细胞肺癌（NSCLC）中的作用及其分子机制。 研究方法：通...
- 何一铭
- 关键词：细胞周期生物学功能
- 基于转录组测序研究细胞周期相关基因在红系发育的阶段特异性变化
- 目的: 红系发育是造血干细胞分化为早期红系祖细胞、终末有核红细胞最终脱核成熟为红细胞的过程。红系祖细胞进行自我更新和增殖，随着发育过程自我更新能力减弱。红系终末发育分裂伴随分化，并最终退出细胞周期脱核成熟为功能性红细胞...
- 张颖
- 关键词：细胞周期相关基因造血干细胞细胞分化
- 质子泵抑制剂通过下调细胞周期相关基因诱导胃癌细胞周期阻滞并促进化疗增敏被引量：1
- 2021年
- 背景:研究发现质子泵抑制剂(PPI)可增强胃癌细胞的化疗敏感性,抑制胃癌细胞增殖和侵袭。目的:探讨PPI是否系通过影响细胞周期相关基因表达对胃癌细胞发挥化疗增敏作用。方法:以不同浓度泮托拉唑处理人胃癌细胞株AGS和HGC27,CCK-8实验检测细胞活力,转录组测序结合KEGG富集分析明确PPI对胃癌细胞周期的影响,流式细胞分析、real-time PCR和蛋白质印迹法验证细胞周期及其相关基因表达变化。利用生物信息学网站分析主要细胞周期相关差异表达基因在胃癌组织中的表达及其与患者预后的关系。CCK-8实验检测PPI联合顺铂对转染FOXM1过表达质粒或空载质粒的胃癌细胞的增殖抑制效果。结果:PPI可有效抑制胃癌细胞体外增殖。转录组测序和KEGG富集分析显示经PPI处理的胃癌细胞G2/M期相关基因FOXM1、PLK1、AURKB等表达下调,并出现G2/M期阻滞,上述发现经流式细胞分析以及real-time PCR和蛋白质印迹法证实。生物信息学分析显示上述G2/M期相关基因在胃癌组织中的表达显著上调,并与预后不良相关。PPI联合顺铂对胃癌细胞的增殖抑制作用显著强于顺铂单药处理,但可被过表达FOXM1部分逆转。结论:PPI可通过下调细胞周期相关基因表达诱导G2/M期阻滞,从而增强胃癌细胞的化疗敏感性。
- 苏萌张斌陈敏王雷徐桂芳吕瑛邹晓平
- 关键词：质子泵抑制剂细胞周期G2/M期阻滞化疗敏感性
- 小鼠肌肉损伤修复过程中CTPS及细胞周期相关基因表达变化
- 2021年
- 为研究小鼠肌肉损伤修复过程中CTPS基因及细胞周期相关基因CCND1的变化规律,以8周龄雄性昆明小鼠为实验材料,采用注射盐酸布比卡因制备肌肉损伤及修复模型,通过qRT-PCR,Western Blot检测CTPS和CCND1基因的表达变化.结果表明,与对照组相比,注射盐酸布比卡因2~8 h小鼠肌肉组织中CTPS和CCND1基因表达快速增高,且CTPS表达升高早于CCND1;在修复24~72 h过程中,随着时间的延长CTPS和CCND1基因表达量逐渐增高,CTPS基因48 h后增加变缓,CCND1基因在48 h时达到最高.综上所述,在小鼠肌肉修复72 h时间范围内,CTPS和CCND1基因表达升高以满足细胞增殖的需要.研究结果为明确CTPS在肌肉损伤修复中的作用提供实验基础.
- 梁卫祺陈雯叶钊颖张美晶苗长久张伟伟邵淑丽
- 关键词：细胞周期
- 簇生稻穗发育及细胞周期相关基因的表达分析
- 2021年
- 【目的】穗粒数的增加可以直接提高水稻的产量,簇生穗能增加穗粒数和着穗密度。为考察簇生稻品种内江P164与对照单粒稻品种9311中OsCl-6等穗发育及细胞周期相关基因的表达是否存在显著差异,探索通过调控品种中特定基因的表达量来指导水稻生产,为高产水稻品种选育提供理论依据。【方法】分别取种植于网室大田的簇生稻品种内江P164和对照单粒稻品种9311的幼穗进行RNA提取、qRT-PCR分析及相关数据分析。【结果】qRTPCR结果显示,对于所选取的几个幼穗发育时期,OsCl-6的表达量在内江P164的幼穗中的表达量均高于9311。细胞周期依赖激酶类基因在9311中的表达高于内江P164,而B类细胞周期蛋白则在内江P164中的表达高于9311。Lax1、OsWOX3、RFL等穗发育相关基因在内江P164中的表达低于9311,而MFS1和CL-4的在内江P164中的表达则高于9311。【结论】簇生穗基因OsCl-6等穗发育相关基因及B类细胞周期蛋白在簇生稻品种内江P164与对照单粒稻品种9311中的表达存在显著差异,OsCl-6或通过表达量上调来抑制二次枝梗的发育等,将为深入挖掘穗发育相关基因之间的关系及簇生穗基因OsCl-6的分子机理研究提供参考。
- 陈丽萍蒋家焕蒋家焕朱永生郑燕梅林强朱永生罗曦王颖姮谢华安林强
- 关键词：水稻穗发育基因表达分析
