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磁珠富集法提高外周血HIV DNA检测灵敏度的研究: 2023年; 目的建立外周血人免疫缺陷病毒脱氧核糖核酸(HIV DNA)磁珠富集检测方法,并评估该方法在提高HIV感染患者早期抗病毒治疗(early antiretrovital treatment,ART)后外周血中HIV DNA检测灵敏度中的应用价值。方法采集1位HIV感染窗口期(window period,WP)即开展ART患者4个不同时间点的外周全血,Ficoll法分离外周全血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC),阴性分选富集PBMC中CD4^(+)T淋巴细胞,应用HIV DNA检测试剂盒检测磁珠富集组和全血组HIV DNA浓度。结果采用免疫磁珠富集法从PBMC中分离纯化CD4^(+)T细胞,经流式细胞仪测定纯度达到(96.4±2.6)%,0.4%台盼兰染色细胞活力为(95.9±2.9)%。治疗后,在追踪的不同时间点,发现患者血浆中HIV RNA载量逐渐下降,至第4个追踪时间点,血浆中不再检出HIV RNA。全血组4个时间点,HIV DNA定量结果均未检出;磁珠富集组CD4^(+)T淋巴细胞HIV DNA定量结果分别为:73.4、429.3、137.1、449.9 copies/106个CD4^(+)T细胞。结论磁珠富集法更加灵敏高效检出血液标本中极限低拷贝HIV DNA,为HIV WP感染、ART治疗后突破感染提供早期确证依据。; 王立林邬林枫赵方李然李彤刘衡朱蕊曾劲峰; 关键词：人类免疫缺陷病毒

基于磁珠富集法开发的15个三角鲂多态性微卫星标记的特性分析: 2020年; 利用磁珠富集法分离微卫星序列,以开发三角鲂(Megalobrama terminalis)微卫星分子标记。将三角鲂基因组DNA经限制性内切酶RsaⅠ酶切、回收后构建三角鲂基因组PCR文库。用生物素标记的微卫星探针(CA)10与PCR文库杂交,通过磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段,将洗脱所得片段进行PCR扩增、克隆及筛选后,共获得15对有效引物。利用获得的15对引物对36尾三角鲂进行多态性分析,15个微卫星标记的观测杂合度范围为0.0000~0.8182,期望杂合度范围为0.0818~0.9226,多态信息含量范围为0.0789~0.8999。其中,6个微卫星标记达到Hardy-Weinberg平衡。本研究制备的15对微卫星标记可用于评估三角鲂种群的遗传参数,为三角鲂种质资源的开发、保护提供有用的遗传标记。; 刘凯谢楠冯晓宇马恒甲; 关键词：微卫星多态性三角鲂

磁珠富集法开发蕨麻SSR标记引物被引量：8: 2018年; 微卫星序列(SSR)因具有分布广、共显性遗传、稳定、多态性丰富等优点而被广泛应用于动植物遗传研究中。利用EcoRⅠ,MseⅠ2种内切酶酶切蕨麻基因组,酶切片段与用生物素标记的探针(AG)15、(GT)15杂交,然后通过链霉亲和素磁珠富集、含有SSR片段的基因组片段被吸附,再经洗脱、PCR扩增、克隆和测序,完成微卫星序列的收集。共获得有效克隆236个,随机挑选其中80个进行测序,结果显示68条序列(85%)为唯一序列,挑选出其中40条含有SSR位点的序列,用引物设计软件Primer 5成功设计出40对引物,经初步筛选,最终获得多态性丰富,可稳定扩增的SSR引物20对,扩增成功率达50%。对20对引物扩增结果做了初步分析,扩增出多态性位点共338个,平均每对引物扩增出17个,平均有效等位基因数(Ne)、多态性信息含量(PIC)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)平均值分别为1.2440、0.8996、0.1768和0.3078。20对SSR引物为蕨麻遗传变异研究提供了新的分子标记工具。; 富贵李军乔李军乔白世俊包锦渊; 关键词：微卫星磁珠富集分子标记

基于磁珠富集法开发并筛选西川红景天的微卫星标记被引量：3: 2017年; 利用FIASCO磁珠富集法,开发和筛选青藏高原特有珍贵植物西川红景天(Rhodiola alsia)多态性微卫星标记。结果表明:用(AG)15和(AC)15两种微卫星标记探针构建富集文库,共获得阳性克隆约2500个;从中随机挑取1200检测,发现具有多态性的阳性克隆达400个;随机挑取200多态性的阳性克隆进行测序,从中获得105个SSR位点,用在线软件primer3-2.3.4成功设计得SSR引物105对;其中45对可以成功扩增,而13对所扩增的片段在相距较远的4个自然居群的24个个体中显示较高的遗传多态性。用4个居群的80个个体检测这13对引物发现,平均等位基因数(A)约为9.192,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)均值分别约为0.712和0.734,如此高的多态性已经满足后期研究的需要;数个位点在某些居群中显著偏离哈迪温伯格平衡(P<0.01),这可能是实际研究的居群并不能达到哈迪—温伯格定律所假设的无限大等理想状态所致。结合此前基于表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)序列开发的SSR多态性位点,该研究结果为今后利用SSR位点开展西川红景天的居群遗传结构分析和其他研究提供了一组有效工具。; 王久利雷淑芸陈世龙张发起; 关键词：微卫星引物磁珠富集法

阴性免疫磁珠富集法富集非小细胞肺癌患者循环肿瘤细胞及相关性研究被引量：2: 2017年; 目的对非小细胞肺癌患者进行CTC检测,探讨CTC检测结果与非小细胞肺癌患者临床特征的相关性,评价其临床意义。方法采用免疫磁珠阴性富集法和FISH技术检测循环肿瘤细胞。取CTC≥4为临界值,通过卡方检验与Fisher确切概率法分析CTC水平与临床特征的关系。结果 85例非小细胞肺癌患者CTC阳性率62.4%,Ⅰ期阳性率37.5%,Ⅱ期阳性率75%,Ⅲ期阳性率48.4%,Ⅳ期阳性率76.2%,Ⅰ-Ⅳ期阳性率差异有统计学意义(P=0.016);与相关肿瘤标志物CEA、CYFRA-21、CA125等是否升高无明显相关性(P=1,1,0.405,Fisher确切概率法)。结论 CTC与肿瘤分期密切相关,分期越晚的患者CTC阳性率越高,肿瘤标志物是否升高对CTC阳性率没有影响。; 汤井娇刘清菁刘亮胡晨曦惠开元蒋晓东; 关键词：非小细胞肺癌循环肿瘤细胞 TNM分期肿瘤标志物

免疫磁珠富集法对牛源大肠杆菌O157∶H7分离鉴定的影响被引量：8: 2017年; 为证明免疫磁珠吸附技术对牛源大肠杆菌O157∶H7分离效率的影响,从新疆五家渠市、伊宁县、昌吉市3个牛场的采集18份粪样、162份肛拭子、10份饲料样、17份水样和36份胴体表面棉拭子样本,经EC肉汤增菌后,分别采用免疫磁珠富集后和直接进行SMAC和MUG试验进行选择性培养,然后对菌体rfbE基因和鞭毛fliC基因进行PCR检测,最后对疑似大肠杆菌O157∶H7菌用生化试验进行符合性检测。结果2种方法分别从243份样品中分离到8株和4株大肠杆菌O157∶H7,统计学分析该差异不显著。本试验结果表明,在实践中免疫磁珠吸附技术和普通方法相比虽然在统计学上差异不显著,但确实能够增加大肠杆菌O157∶H7的分离数量,这与以前的相关研究结果基本一致。; 丁浩苏战强夏利宁王雨朦王栋张瑾瑜张桃况玲姚刚; 关键词：免疫磁珠

一种基于磁珠富集法高通量开发基因组SSR标记的方法: 本发明公开了一种基于磁珠富集法高通量开发基因组SSR标记的方法，包括下列步骤：（1）提取目标基因组DNA；（2）将所得基因组DNA随机片段化；（3）构建基因组随机片段化DNA文库；（4）对DNA文库进行扩增；（5）利用生...; 孙子奎陈永灿

磁珠富集法开发长臀鮠微卫星分子标记被引量：5: 2016年; 为长臀鮠遗传育种、种质鉴定和种苗流放等提供理论依据,采用磁珠富集法开发长臀鮠(Cranoglanis bouderius)微卫星分子标记,筛选获得阳性克隆进行分析,选取侧翼较长的序列,用Primer Premier 5.0设计合成引物。结果表明:从596个白斑中筛选获得80个阳性克隆,测序获得微卫星序列47个,其中完美型31个(66%),非完美型14个(30%),复合型2个(4%)。设计合成32对引物,通过优化反应条件,得到27对引物能扩增特异条带,其中多态性引物24对。; 孔杰蒋晓红周洲张竹青周路李道友; 关键词：磁珠富集长臀鮠微卫星标记

密度梯度离心联合上皮细胞黏附分子免疫磁珠富集法检测卵巢癌循环肿瘤细胞及其与肿瘤复发转移的相关性被引量：7: 2016年; 目的检测卵巢癌患者外周血中循环肿瘤细胞(CTCs)与肿瘤复发转移的相关性。方法采集50例卵巢癌患者的外周血,应用密度梯度离心联合上皮细胞黏附分子免疫磁珠富集法检测外周血中的CTCs的数目,并比较其与患者临床特征之间的关系。结果 50例卵巢癌患者中32例为CTCs阳性,CTCs阳性与远处转移(P<0.05)和复发密切相关(P<0.05),而与性别、年龄、肿瘤部位、TNM分期、肿瘤分化程度及淋巴转移无关(P>0.05)。结论 CTCs可以预测卵巢癌远处转移和复发。; 韩晓芳王晓成王蔼明; 关键词：卵巢肿瘤密度梯度离心

一种基于磁珠富集法高通量开发基因组SSR标记的方法: 本发明公开了一种基于磁珠富集法高通量开发基因组SSR标记的方法，包括下列步骤：（1）提取目标基因组DNA；（2）将所得基因组DNA随机片段化；（3）构建基因组随机片段化DNA文库；（4）对DNA文库进行扩增；（5）利用生...; 孙子奎陈永灿

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