搜索到1466篇“ 疾病基因“的相关文章
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- 一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,它涉及一种内分泌疾病基因特征融合方法。本发明为了解决现有细胞异质性基因特征提取方法存在局限性的问题。本发明的步骤包括步骤1、获取细胞基因关联数据;步骤2、细胞关联基因特...
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- 基于内质网应激相关的类风湿性关节炎疾病基因筛选
- 2025年
- 目的探索类风湿性关节炎(RA)与内质网应激(ERS)相关的疾病基因特征。方法从基因表达数据库(GEO)获得RA患者和健康人群的滑膜组织基因表达矩阵进行GSEA分析;运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和显著性表达差异基因(DEGs)分析识别RA与ERS相关的关键模块基因。运用不同机器学习算法,筛选与RA相关的ERS特征基因,并进行相关基因的药物靶点预测。结果共鉴定出109个DEGs,GSEA富集分析揭示了与RA病理损伤相关的生物学途径。基于WGCNA模块分析以及SVM/LASSO算法进一步筛选得到3个ERS相关的RA核心基因-SPP1、FABP4和ADIPOQ。ROC曲线分析发现3个核心基因均具有较高的诊断价值。基因药物表达网络预测分析表明,多种药物以核心靶基因SPP1、FABP4为有效靶点。结论内质网应激相关核心基因的筛选为RA的诊断以及相关治疗靶点的开发提供了新的线索。
- 孙大系魏鹏飞
- 关键词:内质网应激类风湿性关节炎药物靶点
- 提升计算机辅助诊断系统候选疾病基因识别性能的方法
- 本发明涉及一种提升计算机辅助诊断系统候选疾病基因识别性能的方法,属于计算机辅助诊断应用技术领域。针对现有的计算机辅助诊断系统在候选疾病基因识别性能存在准确率不高、可靠性不足等技术问题,本发明在计算机辅助诊断系统中,首先构...
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- 基于图神经网络的疾病基因的预测方法及装置
- 本发明提供了一种基于图神经网络的疾病基因的预测方法及装置,涉及疾病基因预测领域,该方法包括:构建疾病‑基因网络、基因‑疾病网络及基因‑GO节点网络,确定疾病‑基因特征矩阵、基因‑疾病特征矩阵及基因‑GO节点特征矩阵,并确...
- 胡芳金梦园陈慧马利肖瑞
- COVID-19与动脉粥样硬化不稳定斑块共同疾病基因的筛选及鉴定
- 2024年
- 目的筛选并鉴定COVID-19与动脉粥样硬化(AS)不稳定斑块的共同疾病基因。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE164805、GSE28829、GSE41571、GSE163154数据集,然后将GSE28829、GSE41571数据集作为AS训练集,GSE163154数据集作为AS验证集。筛选GSE164805数据集中COVID-19和健康对照者(HC)间的差异表达基因(DEGs)及AS训练集中AS不稳定斑块和AS稳定斑块间的DEGs。绘制COVID-19和HC间的DEGs与AS不稳定斑块和AS稳定斑块间的DEGs的韦恩图,筛选COVID-19与AS不稳定斑块的共同DEGs。将共同DEGs导入String数据库进行蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络分析,以最大相关准则(MCC)值排序前10位的基因作为共同核心DEGs。在GSE164805数据集和AS训练集中分析10个共同核心DEGs的表达水平。绘制ROC曲线以分析10个共同核心DEGs对AS验证集AS不稳定斑块的预测效能。结果在GSE164805数据集中,COVID-19和HC间的DEGs共5379个。在AS训练集中,AS不稳定斑块和AS稳定斑块间的DEGs共1615个。韦恩图分析结果显示,COVID-19与AS不稳定斑块的共同DEGs共210个。PPI网络分析结果显示,取MCC排序前10位的基因作为共同核心DEGs,分别为TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1。在GSE164805数据集中,COVID-19的TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1表达水平高于HC(P<0.05);在AS训练集中,AS不稳定斑块的TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1表达水平高于AS稳定斑块(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1预测AS验证集AS不稳定斑块的AUC分别为0.873〔95%CI(0.746~0.999)〕、0.565〔95%CI(0.385~0.746)〕、0.843〔95%CI(0.691~0.994)〕、0.953〔95%CI(0.898~1.000)〕、0.938〔95%CI(0.861~1.000)〕、0.831〔95%CI(0.694~0.968)〕、0.951〔95%CI(0.895~1.000)〕、0.981〔95%CI(0.931~1.000)〕、0.935〔95%CI(0.856~1.000)〕、0.984〔95%CI(0.958~1
- 尤红俊苟棋玲董梦雅常凤军
- 关键词:动脉粥样硬化粥样斑块基因
- 基于分子对接技术探究余甘子多酚与衰老相关神经退行性疾病基因的潜在作用
- 2024年
- 目的利用分子对接技术探究余甘子多酚与衰老相关神经退行性疾病基因的相互作用。方法从PDB数据库获取乙酰胆碱酯酶(AchE)、丁酰胆碱酯酶(BchE)和单胺氧化酶(MAO)受体结构文件,以及从pubchem数据库获取余甘子中11种多酚物质的结构文件,并使用Openbabel进行文件格式的转换,通过Autodock软件将所选受体与配体进行对接,用Pymol将其对接能、对接位点和对接方式进行可视化分析。结果11种余甘子多酚中,肉桂酸、没食子儿茶素、山奈酚、鞣花酸和槲皮素与AchE,BchE和MAO均具有较为突出的结合活性,并通过形成氢键的方式结合。山奈酚与3个蛋白受体的结合最为紧密,其与AchE的对接键能是-6.53 kcal·mol^(-1),与BchE的对接键能是-5.14 kcal·mol^(-1),与MAO的对接键能是-5.48 kcal·mol^(-1);没食子儿茶素与3个蛋白受体形成的氢键数都较多,其与AChE形成8个氢键,与BChE形成5个氢键,与MAO形成5个氢键。结论余甘子多酚治疗神经退行性疾病的生物活性可能来自于其与AchE,BchE和MAO的氢键结合。
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- 亮亮小朋友出生的时候一切都很正常,他在3个月的时候可以抬头,4个月的时候可以翻身,7个月可自己坐,9个月会自己站。但是,从11个月开始,父母发现亮亮不会自己扶着物品站立了,坐的时候腰背也不挺直了。
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