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多色熔解曲线快速检测5种小鼠病原体
2025年
借助多色熔解曲线分析技术(multicolor melting curve analysis,MMCA),建立起一套高效、低成本的同时检测5种小鼠病原体(金黄色葡萄球、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、嗜肺巴斯德杆菌、变形杆菌)的多重检测方案,用于快速检测实验动物感染情况。同时添加辣椒基因组作为内参,排除假阴性干扰,使结果更准确可靠。通过对探针进行设计,使不同病原菌在不同荧光通道的不同的Tm值处出现熔解峰:在FAM荧光通道,金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌的熔解峰Tm值分别为(53.51±0.94)℃、(61.23±0.34)℃;在ROX通道,铜绿假单胞菌和嗜肺巴斯德杆菌的熔解峰Tm值分别为(61.70±0.66)℃、(55.98±0.10)℃;在CY5通道,变形杆菌和辣椒内参的熔解峰Tm值分别为(63.91±0.19)℃、(57.43±0.31)℃。经验证,该方对不同病原体具有不同的检测限,分别为金黄色葡萄球菌102 copies/μL、肺炎克雷伯菌101 copies/μL、铜绿假单胞菌102 copies/μL、嗜肺巴斯德杆菌102 copies/μL、变形杆菌102 copies/μL。综上,研究建立的多色熔解曲线能够对多种小鼠常见病原体在单管内进行快速有效的检测。
徐逸梦刘欣怡胡珊珊周宇荀李凯肖君华
关键词:分子检测
一种基于熔解曲线检测核酸变异的探针和引物、方
本发明涉及生物技术领域,具体公开了一种基于熔解曲线检测核酸变异的探针和引物、方。一种基于熔解曲线检测核酸变异的探针和引物,引物由上游引物和下游引物组成;探针为发夹型结构探针,从5'端到3'端依次为茎、环和茎,两条茎...
陈敬臣陶梦圆李尚泉蔡兴盛李梦真邓泱泱杨冬成
一种荧光PCR熔解曲线检测HLA基因型的试剂盒
本发明提供一种用荧光PCR熔解曲线检测HLA基因型的试剂盒,包含HLA‑A、HLA‑B、HLA‑DRB1、HLA‑DQB1的基因分型,以含引物的96孔光学反应板进行扩增,藉由SYBR Green I对扩增的双股DNA产...
许雅筑郑毓仁邱一帆何佩勳
一种基于熔解曲线检测核酸变异的探针和引物、方
本发明涉及生物技术领域,具体公开了一种基于熔解曲线检测核酸变异的探针和引物、方。一种基于熔解曲线检测核酸变异的探针和引物,引物由上游引物和下游引物组成;探针为发夹型结构探针,从5'端到3'端依次为茎、环和茎,两条茎...
陈敬臣陶梦圆李尚泉蔡兴盛李梦真邓泱泱杨冬成
高胆红素血症基因荧光PCR熔解曲线检测试剂盒及方
本发明公开了高胆红素血症基因荧光PCR熔解曲线检测试剂盒,包括包括核酸反应液、DNA聚合酶混合液、W1引物探针试剂、W2引物探针试剂、W3引物探针试剂、W4引物探针试剂、W5引物探针试剂、野生型质控品A、野生型质控品B...
请求不公布姓名请求不公布姓名
一种利用四通道荧光标记的熔解曲线检测人乳头瘤病毒基因分型的试剂、试剂盒和应用
本发明创造涉及基因检测技术领域,尤其是一种利用四通道荧光标记的熔解曲线检测人乳头瘤病毒基因分型的试剂、试剂盒和应用,采用4X Lyo‑PCR buffer可冻干扩增试剂搭配设计的特异性引物和探针组合,使用独特的全组分冻...
操利超陈莹莹张核子巴颖郑志慧李飞飞卢晓萍
荧光PCR熔解曲线联合Sanger测序技术在新生儿耳聋基因筛查中的应用
2025年
目的分析荧光PCR熔解曲线在新生儿耳聋基因筛查中的准确性,了解本地区常见耳聋基因的变异类型及频率,为今后耳聋基因筛查和耳聋防控提供参考。方回顾性选取2022年11月-2023年10月于宁波大学附属妇女儿童医院分娩,并进行耳聋基因检测的5563例新生儿。采用荧光PCR熔解曲线检测4个常见耳聋基因(GJB 2、SLC 26 A 4、线粒体12 S rRNA和GJB 3)的15个变异位点,再采用Sanger测序验证阳性样本。结果5563例新生儿中,检出耳聋基因变异256例,总检出率为4.60%,其中GJB 2基因变异156例,检出率为2.80%;SLC 26 A 4基因变异73例,检出率为1.31%;线粒体12S rRNA基因变异10例,检出率为0.18%;GJB 3基因变异16例,检出率为0.29%;同时检出1例复合杂合变异,检出率为0.02%。阳性样本经Sanger测序验证,发现9例结果不相符,因此,荧光PCR熔解曲线的准确率为96.48%。结论本地区新生儿耳聋基因变异以GJB 2和SLC 26 A 4基因为主;荧光PCR熔解曲线联合Sanger测序可准确检出耳聋基因变异情况,有助于及早发现先天性、药物性和迟发性耳聋,对早期预防和早期治疗耳聋具有重要意义。
潘澍青潘婕文鲍幼维潘小莉庄丹燕
关键词:耳聋基因基因变异新生儿
基于多重探针熔解曲线的八种食源性致病菌联检试剂盒
本发明提供了基于多重探针熔解曲线的八种食源性致病菌联检试剂盒,属于微生物检测技术领域。本发明提供的试剂盒中的引物探针Mix包括SEQ ID NO.1‑16所示的引物、SEQ ID NO.17‑24所示的探针和SEQ I...
李彩云 宗华 罗琴梅 彭翠嘉 白燕丹 杨海英 王雷 张志强
一种基于FRET探针熔解曲线检测微卫星位点PentaC的试剂盒及方
本发明公开了一种基于FRET探针熔解曲线检测微卫星位点PentaC的试剂盒及方,试剂盒包括特异扩增PentaC位点的限制性引物SEQ ID NO.1和过量引物SEQ ID NO.2,一对特异检测PentaC位点状态的...
丁玲丽王稳占焦海涛沈伟强
荧光PCR熔解曲线在耐多药结核病诊治中的应用及分析
2024年
目的 探讨荧光聚合酶链反应(PCR)熔解曲线在耐多药结核病(MDR-TB)的快速诊断和有效药物快速筛选中的应用价值。方 以利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、氟喹诺酮类(FQs)为检测药物,应用熔解曲线和微孔板药敏,对比检测2021年1~7月贵阳市公共卫生救治中心罗氏固体培养阳性的84株菌株。两种方药敏结果不一致的菌株用基因测序作验证。结果 以微孔板为标准,熔解曲线对MDR-TB(微孔板诊断)的检出符合率、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值依次为89.3%(75/84)、91.5%(43/47)、86.5%(32/37)、89.6%(43/48)、88.9%(32/36)、0.78。溶解曲线对RFP、INH、EMB、FQs的检出符合率、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值分别为76.2%~97.6%、86.7%~95.7%、73.9%~100%、41.9%~100%、94.1%~98.6%和0.45~0.95。对22份(26.19%,22/84)微孔板敏感、熔解曲线耐药的菌株进行测序验证,结果均显示含有耐药突变;而微孔板耐药、熔解曲线敏感的6份(0.71%,6/84)菌株在测序区域均为野生型。结论 荧光PCR熔解曲线对微孔板药敏检测结果的灵敏度、特异度、符合率、一致性均较高,可为耐多药结核病的初筛诊断及治疗方案制定提供实验室依据。
秦万王明栋欧维正徐勇
关键词:熔解曲线法耐多药结核病耐药基因检测药物筛选

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作品数:188被引量:400H指数:11
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研究主题:试剂盒 实时PCR 探针 结核分枝杆菌 核酸分子
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作品数:167被引量:660H指数:14
供职机构:深圳市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 副溶血弧菌 分子分型 荧光PCR 沙门菌
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供职机构:深圳市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 试剂盒 副溶血弧菌 分子分型 金黄色葡萄球菌
石晓路
作品数:151被引量:633H指数:13
供职机构:深圳市疾病预防控制中心
研究主题:脉冲场凝胶电泳 副溶血弧菌 分子分型 荧光PCR 沙门菌
李辉
作品数:197被引量:789H指数:15
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