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- 一种花生高含油量稳定相关的主效数量性状基因座及其应用
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- 杨永庆王瑾 胡朋举宋亚辉金欣欣 苏俏
- 大豆耐旱性数量性状基因座定位研究进展
- 2024年
- 目前,我国大豆产需差距过大,迫切需要提高大豆产量。现代分子育种技术是可以提高大豆产量的重要技术之一。干旱是制约大豆产量提高的重要因素之一,因此提升大豆耐旱性对提高大豆产量起到关键作用。在概述数量性状基因座定位技术和干旱胁迫对大豆生长的影响的基础上,对大豆耐旱性数量性状基因座定位研究进展进行总结,为选育出具有耐旱性的大豆品种提供参考。
- 庄妍汤敏慧王众拥程逸茹牛炳森于妍
- 关键词:大豆耐旱性QTL定位
- 全基因组关联分析在水禽主要数量性状基因座定位的应用现状被引量:2
- 2024年
- 水禽的经济性状多为数量性状,数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)是调控数量性状表达的遗传基础,因此QTL的定位是分子育种的基础。全基因组关联分析(genome wide association studies,GWAS)作为鉴定表型与基因型关系的一种分析策略,是挖掘畜禽QTL的重要手段,并已经成功应用于猪、牛、鸡等畜禽的遗传育种工作中。利用GWAS可以定位与水禽经济性状相关的QTL,确定影响水禽性状的功能基因或主效基因,从而实现对水禽重要性状的改良。文章综述了GWAS在水禽重要性状研究上的应用效果,并分析了不足之处,以期为完善水禽遗传育种与遗传改良方法提供参考。
- 许毛斗曹智张钰张扬徐琪陈国宏
- 关键词:水禽经济性状GWASQTL
- 基因组分析对猪乳头数相关数量性状基因座鉴定
- 2023年
- 【目的】分析乳头数的变异,挖掘与乳头数相关的数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)和候选基因,为猪乳头数的选育研究提供重要分子标记。【方法】准确测定了709头苏淮猪(335头育肥猪和374头种猪)的左、右和总乳头数。对苏淮育肥猪进行80K芯片分型,并使用芯片数据计算左、右、总乳头数的遗传力和基因组估计育种值(genomic estimated breeding value,GEBV)。基于乳头数GEBV和表型排名,选择前10%的个体以及后10%的个体进行群体分化指数分析(fixation Index,FST)检测高度分化的位点。接着,通过全基因组关联分析(genome wide association analysis,GWAS)鉴定与乳头数关联的位点,选择高度分化且与乳头数显著关联的位点作为候选位点,选择位于候选位点附近且功能注释后与乳头数相关的基因作为候选基因。最后,选择每个染色体上最显著的候选位点对709头苏淮猪进行乳头数关联分析,以验证上述位点的显著性。【结果】苏淮育肥猪左、右、总乳头数的变异系数分别为10.20%、9.26%、8.50%,遗传力分别为0.212、0.257、0.312。基于FST和GWAS分析,总共在7、13、16、18号染色体(Sus Scrofa Chromosome,SSC)上鉴定到20个乳头数的候选位点,这些候选位点可解释5.49%—8.03%的表型方差。其中,SSC7上与总乳头数关联的位点rs80894106与文献中报道的影响大白和杜洛克猪总乳头数的候选位点一致,但左乳头的候选位点rs81444134(26.51 Mb,SSC13)和rs81233299(8.13 Mb,SSC18)均为新发现的与乳头数相关的位点。左、右、总乳头的候选位点主要集中在SSC16上的6.36—10.66 Mb区间;连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析发现,区间内7.47—8.27 Mb的候选位点拟合成了一个795 kb的单倍型块,且该单倍型块是新发现的影响乳头数的候选区域;单倍型块内的rs337606862(7.47 Mb)与右乳头和总乳头最显著关联,单倍型块内的3个位点均位于cadherin 18(CDH18)基�
- 尹彦镇侯黎明刘航陶伟石传宗刘锴月张萍张萍李强李平华黄瑞华
- 关键词:FST苏淮猪乳头数
- 太行鸡开产日龄相关的数量性状基因座及其应用
- 本发明公开了一组太行鸡开产日龄相关的数量性状基因座,位于基因组的chr19:6 406 070‑chr19:6 412 735区间内,包括物理距离如下的显著SNP位点当中的一组或多组:19:6381462、19:6382...
- 褚素乔谢艳华桂蕴王宇哲牛旭达朱迪周荣艳倪慧勇邱伟姚慧敏
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- 大豆异黄酮和蛋白质含量相关的共定位数量性状基因座及其应用
- 本发明涉及分子生物学技术领域,公开了大豆异黄酮和蛋白质含量相关的共定位数量性状基因座,包括分别位于大豆6号、8号、9号染色体上的三对数量性状基因座及其任意组合,所述三对数量性状基因座分别为:在6号染色体上共定位的qISO...
- 杨春燕赵青松张孟臣闫龙史晓蕾秦君赵鑫刘路平刘兵强孟庆民陈强
- 甘蔗-甘蔗鞭黑粉菌互作研究及甘蔗黑穗病数量性状基因座定位
- 甘蔗(Saccharum officinarum L.)是全世界范围内重要的经济作物,可用于生产蔗糖、生物燃料和纤维等制品。由甘蔗鞭黑粉菌(Sporisorium scitamineum)引起的甘蔗黑穗病是甘蔗生产上发生...
- 刘宗灵
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