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微卫星重复序列敲除突变体的构建方法和应用
本发明公开了微卫星重复序列敲除突变体的构建方法和应用,利用CRISPR技术敲除基因组微卫星重复序列NGGN,包括设计gRNA位点‑PCR‑纯化‑体外转录和纯化‑显注射‑产生表型‑胚胎死亡‑表型分析的步骤。本发明首次利用...
祖尧武秀知杨小静王宏杰
微卫星重复序列敲除突变体的构建方法和应用
本发明公开了微卫星重复序列敲除突变体的构建方法和应用,利用CRISPR技术敲除基因组微卫星重复序列NGGN,包括设计gRNA位点‑PCR‑纯化‑体外转录和纯化‑显注射‑产生表型‑胚胎死亡‑表型分析的步骤。本发明首次利用...
祖尧武秀知杨小静王宏杰
翘嘴鲌微卫星重复序列特征及生长性状相关微卫星标记筛选
翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)是鲌亚科中体型最大的一种鱼类,具有重要的生态意义和经济价值,养殖产量在过去数十年中有了显著的增长,也是自然水体主要放流种类之一。翘嘴鲌怀卵量大,较少的亲本就能...
刘士力
关键词:翘嘴鲌磁珠富集法转录组生长性状
中国明对虾基因组微卫星重复单元类型与其多态性关系被引量:12
2009年
利用超声波粉碎中国明对虾Fenneropenaeus chinensis基因组后建立随机基因组文库,对其测序后获得了1996个克隆序列,经Seqm anⅡ(DNAstar)拼装后获得独立克隆数目为1900个,每个序列长度从400—700bp不等。利用重复序列分析软件对这些序列中含有微卫星重复序列的序列进行分析,共找到136个包含完整侧翼序列的重复序列。利用引物设计软件从以上重复序列中设计出34对引物,合成引物后,通过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法获得了各个微卫星位点的等位基因数目。34对引物中,除4个没有扩增出产物外,其他都有较好的扩增结果,可以分辨出多态性信息情况,并据此分析了不同微卫星重复序列类型与其对应的位点多态性之间的关系。结果表明,两碱基重复类型具有较高的遗传多态性,而三碱基和四碱基以及复合型重复类型的平均多态性不高;两碱基重复序列类型各拷贝类别间的多态性信息没有明显的差异。进一步对两碱基的重复拷贝数目与多态性信息(等位基因数目)的相关关系进行分析,以考察拷贝数多少与等位基因数目之间的关系。利用SPSS软件进行相关分析,结果表明重复拷贝数目和等位基因数目呈一定相关(相关系数0.121),但相关性不显著(P=0.621)。
高焕于飞栾生孟宪红蔡生力孔杰
关键词:中国明对虾微卫星多态性
染色体10q24区域微卫星重复序列多态性与阿尔茨海默病的相关性研究
2006年
目的 研究染色体10q24微卫星重复序列多态性与晚发型阿尔茨海默病(1ate—onset Alzheimer's disease,LOAD)的相关性。方法我们采用病例一对照方法研究染色体10q24区域微卫星重复序列的多态性、载脂蛋白E(APOE)基因多态性与LOAD相关性,病例组82人,健康对照组168人。结果在LOAD病例组和正常对照组中D10S583微卫星重复序列等位基因199bp携带者的频率分别是31.0%(53/171)和12.2%(10/82),其差别有显著性(x^2=10.8,P=0.001,RR=0.30,95%CI=0.15~0.64);APOEe4携带者的频率在LOAD组中是52.4%(43/82),对照组16.1%(27/168),其差别有显著性(x^2=36.2,P〈0.0001,RR=5.76,95%CI=3.17~10.47)。结论D10S583重复序列等位基因199bp的频率与LOAD呈负相关,而APOEe4携带者的频率与LOAD呈正相关,这个结果支持在10q24区域有LOAD候选相关基因的论点。
陈煜森许志恩赵斌山县英久三木哲郎
关键词:阿尔茨海默病载脂蛋白E
小鼠基因组中的微卫星重复序列的数量、分布和密度(英文)被引量:24
2006年
作者分析了老鼠基因组中各染色体及其内含子、外显子和基因间区上各种类型的微卫星(1-6个碱基的重复序列)的数量及其密度。SSR约占老鼠基因组的2.85%,其中46.2%存在于基因间区,4.75%存在于外显子,49.05%在内含子区域,即非编码区富含微卫星微卫星的数量与染色体或基因区域的大小有关,但密度与染色体或基因区域的大小的关系并不十分密切。第4染色体的外显子区域中6种类型的SSR含量都比其它区域少。A,T,AC,AG,AT,AAC,AAG,AGG,AAAC,AAAG,AAAT,AACC,AAAAC,AAAAG,AAAAT,AAACC,AAAGG,AAGAG,AAAAAC,AAAAAG,AAAAAT,AAAGAG,ACACAT,ACAGAG,ACAGGC,ACATAT是老鼠基因组中主要的SSR类型。
童晓玲代方银李斌余泉友夏庆友鲁成
关键词:老鼠微卫星基因组
IDE基因5’-端侧翼微卫星重复序列的多态性与阿尔茨海默病的相关性研究被引量:1
2006年
目的 研究人群中胰岛素降解酶基因(IDE)5’一端侧翼的微卫星重复序列多态性与阿尔茨海默病(AD)的相关性。方法采用病例一对照方法研究IDE基因5’—端侧翼的微卫星重复序列多态性、载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与AD相关性。选择IDE基因5’端侧翼4个微卫星重复序列位点(CA)n、(AC)nC(GT)n、(CA)n(CT)n、(CA)n,按其基因图谱上的顺序分别给予A、B、D10S583、C为其编号;微卫星片段重复序列多态性的分型是用荧光标记引物PCR法,APOE的基因分型是PCR—RFLP法。结果本研究人群中IDE基因5’端侧翼的4个位点的微卫星片段重复序都有多态性;LOAD病例组和正常对照组中等位基因的分布频率有显著性差别;A208bp与EOAD显著性相关(P=0.0138);APOEe4携带者的频率在LOAD组和对照组分别为52.5%、16.1%(x^2=36.2,P〈0.0001,RR=5.76,95%CI=3.17~10.47);APOEe4携带者的频率与EOAD呈显著性相关(P=0.0135);二项逻辑回归分析胰岛素降解酶基因的微卫星重复序列多态性与ApoE基因无显著性意义的相互作用。结论IDE基因5’—端侧翼的微卫星重复序列多态性与晚发型AD的呈显著性相关,支持在染色体10q23—25区域有LOAD候选相关基因的论点,对此区域进行深入研究很有价值。
赵斌陈煜森许志恩山県英久三木哲郎
关键词:阿尔茨海默病载脂蛋白E
胰岛素降解酶基因的微卫星重复序列多态性与阿尔茨海默病的相关性研究
目的 近年的连锁分析研究显示在第10号染色体长臂上有晚发型阿尔茨海默病(late-onset Alzheimer's disease,LOAD)和/或血浆β淀粉样(amyloid β)多肽42升高的易患基因位点,而且胰岛...
陈煜森
关键词:阿尔茨海默病载脂蛋白E
一种粉尘螨微卫星标记、其引物及应用和引物的获取方法
本发明公开了一种粉尘螨微卫星标记,所述微卫星标记选自Df01、Df02、Df03、Df04、Df05、Df06、Df07、Df08、Df09、Df10、Df11和Df12中的至少一种,Df01至Df12依次为SEQ ID...
孙恩涛刘艺方惟希李咏琪王慧慧李梦楠王铎黄庆宇
评估微卫星不稳定性的方法和系统
本文公开的发明通常涉及评估受试者中的微卫星不稳定性的方法。一方面,本公开提供一种评估受试者的微卫星不稳定性的计算机实现的方法,所述方法包括:从受试者的血液样品获得多个微卫星重复元件的量化量度;处理所述多个量化量度以获得所...
亚历山大·德·永·罗伯逊妮可·哈辛达·兰伯特哈鲁克·泰兹詹拉姆·耶拉曼奇里尼尔·皮泰曼罗希斯·卡纳潘·斯里瓦斯

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巴华杰
作品数:86被引量:157H指数:6
供职机构:常州市公安局
研究主题:短串联重复序列 法医物证学 遗传多态性 序列基因座 短串联重复
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作品数:4被引量:1H指数:1
供职机构:福建医科大学
研究主题:不典型增生 BARRETT食管 微卫星重复 微卫星改变 RNA干扰
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作品数:149被引量:654H指数:11
供职机构:北京协和医学院
研究主题:家系 孕前 IGG抗体 巨细胞病毒 先天性白内障
刘棣
作品数:8被引量:26H指数:3
供职机构:福建医科大学附属厦门第一医院
研究主题:表观遗传学 抑癌基因 胃肿瘤 肿瘤抑制基因 启动子区甲基化
孔杰
作品数:442被引量:2,297H指数:30
供职机构:中国水产科学研究院黄海水产研究所
研究主题:中国对虾 凡纳滨对虾 对虾 WSSV 中国明对虾