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一种天台鹅耳枥微卫星多态性 引物及其应用 本发明公开了28对天台鹅耳枥微卫星多态性 引物及其筛选方法和应用。本发明利用分子生态学和种群遗传学研究方法,通过分析天台鹅耳枥各个微卫星 位点的基因多态性 、杂合水平评估天台鹅耳枥的种群遗传多样性 ,在此基础上,形成天台鹅耳枥微 ... 杨丽媛 顾翠花 邹薇 邵洁馨 孙璐璐 何昕晨 季梦成 刘志高食管癌术后肺部感染病原学和TNF基因微卫星多态性 及TGF-β1/Smads信号通路表达 2024年 目的探讨食管癌(EC)患者术后肺部感染血浆肿瘤坏死因子(TNF)基因微卫星多态性 、转化生长因子-β1(TGF-β1)/Smads信号通路蛋白水平变化及其病原学特点。方法选取2020年8月-2023年7月衡水市人民医院收治的60例EC术后发生肺部感染患者(感染组)和70例EC术后未发生肺部感染患者(未感染组)。收集EC患者的临床资料并分析病原学特点,分析患者血浆TNF基因微卫星多态性 ,比较两组患者外周血TGF-β1、Smad2、Smad3、Smad7蛋白水平表达,分析TGF-β1、Smad2、Smad3、Smad7单独及联合检测对EC患者术后肺部感染的诊断价值。结果感染组60例EC患者共培养出61株病原菌,其中革兰阴性 菌(67.21%)中的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌与革兰阳性 菌(26.23%)中的金黄色葡萄球菌占比较高,真菌(6.56%)占比较少;与未感染组相比,感染组血浆中TNF基因微卫星 分型TNFc 1/1基因型、TNFc1等位基因占比较高(P<0.05);与未感染组相比,感染组外周血TGF-β1、Smad2、Smad3和Smad7蛋白水平升高(P<0.05);TGF-β1、Smad2、Smad3和Smad7联合检测对EC患者术后肺部感染的诊断曲线下面积(AUC)值高于单独检测的AUC值(P<0.05),联合检测的特异度为87.14%,敏感度为86.67%。结论EC患者术后肺部感染病原菌主要为革兰阴性 菌中的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌及革兰阳性 菌中的金黄色葡萄球菌。EC患者术后肺部感染与血浆中TNF基因微卫星 分型TNFc1/1基因型、TNFc1等位基因占比及TGF-β1/Smads信号通路蛋白水平变化有关,TGF-β1、Smad2、Smad3和Smad7联合检测对EC患者术后肺部感染具有较高的诊断价值。 王志芳 高薇 张宁 陈雨桐 徐柯楠关键词:食管癌 肺部感染 多态性 黄秋葵叶绿体微卫星多态性 标记引物及品种分子鉴定方法 本发明公开了黄秋葵叶绿体微卫星多态性 标记引物及品种分子鉴定方法。本发明中多态性 标记引物的序列为:SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.24。基于提供的多态性 标记引物,通过常规PCR扩增、非变性 聚丙烯酰胺凝胶电泳和D... 俞晨良 孙晨栋 董文其TNFc微卫星多态性 与肝癌TACE介入术后感染易感性 的关联 2022年 目的 分析肿瘤坏死因子β基因内含子的微卫星多态性 (TNFc)与肝癌经导管动脉化疗栓塞术(TACE)介入术后感染易感性 的关联。方法 选取2021年1月-2021年9月南通市第一人民医院TACE术后感染的肝癌患者61例为研究组,同期TACE术后未发生感染患者79例为对照组。分析术后感染部位及病原学特点,采用聚合酶链反应-限制性 片段长度多态性 (PCR-RFLP)检测TNFc微卫星 基因多态性 及其与术后感染易感性 的关联。结果 TACE术后感染部位以胆道感染(42.62%)为主,革兰阴性 菌(76.39%)为主要病原菌;研究组患者TNFc基因C1C1基因型频率和C1等位基因频率高于对照组(P<0.05);C1C1型感染患者血清C-反应蛋白(CRP)和降钙素原(PCT)水平高于C1C2/C2C2型患者(P<0.05);TACE术后感染患者不同TNFc微卫星 基因型术后住院时间和病死率比较差异无统计学意义。结论 肝癌TACE介入术后感染以胆道感染为主,TNFc微卫星 C1C1基因型和C1等位基因可能增加患者术后感染易感性 。 陆咏 范本芳 陈春霞 周三连 戚慧 沈博然关键词:肝癌 微卫星多态性 食管癌术后肺部感染血浆TNF基因微卫星多态性 及与其预后的关系 被引量:2 2022年 目的探讨食管癌术后肺部感染患者血浆肿瘤坏死因子(TNF)基因微卫星多态性 及与其预后的关系。方法将30例食管癌术后继发肺部感染患者设为观察组,同期食管癌术后未发生感染的120例患者设为对照组,并依据观察组患者预后情况(住院28 d是否死亡)分为生存组(n=25)与死亡组(n=5)。运用聚合酶链式反应行DNA扩增,以聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染技术施以微卫星 分型。比较观察组与对照组、生存组与死亡组TNFc微卫星 基因型与等位基因分布,并进行预后分析。结果观察组携带TNFc1/1基因型与TNFc1等位基因比例高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);肺部感染患者中死亡组携带TNFc1/1基因型与TNFc1等位基因比例高于生存组,差异有统计学意义(P<0.05);多因素分析显示:血液高凝状态、低蛋白血症以及携带TNFc1/1基因型为造成患者预后不良的危险因素(P<0.05)。结论TNF基因微卫星多态性 与食管癌术后肺部感染及预后密切相关,TNFc1/1基因型会增加食管癌患者易感性 ,导致不良预后,临床需予以高度重视。 师智勇 张振世 刘圣武关键词:食管癌 肺部感染 肿瘤坏死因子 预后 翘嘴鲌生长激素受体1基因内含子1、2中微卫星多态性 及与生长性 状的关联分析 被引量:2 2022年 本研究检测了120尾同批繁殖、同塘养殖的12月龄翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)生长激素受体1(Growth hormone receptor 1,ghr1)基因内含子1、2的8个微卫星 位点的基因型,分析了ghr1基因内含子1、2微卫星多态性 与生长性 能的相关性 ,为进一步研究其生物学功能及分子标记辅助育种奠定基础。结果表明:7个微卫星 位点具有多态性 ,微卫星 标记平均等位基因数12.714,平均有效等位基因数5.839,平均期望杂合度0.625,平均观测杂合度0.535,平均多态 信息含量0.608;除了ghr1-6和ghr1-7属于低度多态性 位点(PIC<0.25),另有5个属于高度多态性 位点(PIC>0.5)。关联分析结果显示:ghr1-3位点中257/259型个体的体长和体质量均高于其他基因型,其体质量与245/261和259/259差异不显著(P>0.05),但显著高于另外5种基因型(P<0.05)。翘嘴鲌ghr1-3多态性 与生长性 状存在关联,可作为翘嘴鲌生长的候选辅助标记,有助于翘嘴鲌遗传资源的评价、鉴定和保护利用等分子生物学研究。 刘士力 李飞 贾永义 郑建波 迟美丽 程顺 卞玉玲 顾志敏关键词:翘嘴鲌 微卫星 生长性状 食管癌术后肺部感染血浆TNF基因微卫星多态性 及与预后的关系 被引量:2 2021年 目的探讨食管癌术后肺部感染患者血浆肿瘤坏死因子(TNF)基因微卫星多态性 及其与预后的关系。方法选取2018年1月-2020年9月邢台市人民医院食管癌术后继发肺部感染患者115例为感染组,系统抽样选取同期食管癌根治术未发生感染患者148例为对照组。根据肺部感染患者预后情况分为生存组88例和病死组27例。采用聚合酶链式反应进行DNA扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染技术进行微卫星 分型。结果感染组携带TNF c 1/1基因型的频率为39.13%高于对照组(P<0.05),携带TNF c 1等位基因的频率为63.04%高于对照组(P<0.05);肺部感染患者中病死组携带TNF c 1/1基因型的频率为59.26%高于生存组(P<0.05),携带TNF c 1等位基因的频率为75.93%高于生存组(P<0.05);低蛋白血症、血液高凝状态、携带TNF c 1/1基因型是导致患者预后不良的危险因素(P<0.05)。TNF c 1/1基因型患者住院时间长于TNF c 1/2基因型、TNF c 2/2基因型(P<0.05)。结论TNF基因微卫星多态性 与食管癌术后肺部感染及其预后有关,TNF c 1/1基因型可能增加肺部感染易感性 ,并且导致不良预后。 何莉莉 国建飞 姜玉芳 尚静 赵丽莎关键词:食管癌 肺部感染 肿瘤坏死因子 预后 雉鸡微卫星多态性 分析 被引量:1 2020年 利用高通量测序等手段开发了8个具有多态性 的微卫星 标记(ZLL-12、ZLL-14、ZLL-30、ZLL-37、ZLL-55、ZLL-56、ZLL-61、ZLL-68),以期从分子水平上研究雉鸡的遗传多样性 ,为雉鸡种质资源遗传多样性 研究、基因定位以及分子标记辅助育种提供分子水平上的有效工具。试验结果显示:RN群体中,观测等位基因数平均为5.38,每个位点从1(zll-12)到9(zll-30和zll-68)不等,有效等位基因数平均为3.64;MX群体中,观测等位基因数平均为5.75,每个位点从2(zll-12)到10(zll-68)不等,有效等位基因数平均为3.65;D群体中,观测等位基因数平均为5.13,每个位点从2(zll-12)到11(zll-30)不等。8个位点在RN、MX、D 3个群体中,除zll-12、zll-61的PIC小于0.5外,其余6个位点的PIC值均高于0.5。 邢磊 赵乐乐 袁红艳 张春华 陆雪林关键词:微卫星多态性 雉鸡 高通量测序 三峡库区三个养殖鲟鱼物种微卫星多态性 分析 被引量:1 2020年 鲟鱼群体遗传多样性 对孵化场管理和人工繁育过程中保护鲟鱼多样性 及保持近交最小化至关重要。利用微卫星 遗传标记研究了三峡库区人工养殖鲟鱼物种欧洲鳇(Huso huso)、达氏鲟(Huso dauricus)和杂交鲟(Acipenser schrencki♂×Huso dauricus♀)的遗传多态性 。结果表明,3个人工养殖鲟鱼群体在5个微卫星 位点均表现高度多态 。在欧洲鳇、达氏鲟和杂交鲟3个群体中,5个微卫星 位点分别共观察到42、38和29个等位基因。平均多态 信息含量从低到高依次为杂交群体0.7099、欧洲鳇群体0.8056和达氏鲟群体0.8288;平均杂合度依次为杂交群体0.7563、欧洲鳇群体0.8280和达氏鲟群体0.8482.这些遗传指标说明三峡库区人工养殖的欧洲鳇、达氏鲟和杂交鲟具有高度遗传多态性 。 张润锋 焦明静 柯年峰关键词:鲟鱼 微卫星 遗传多态性 三峡库区 枣瘿蚊微卫星 标记筛选及微卫星多态性 分析 被引量:1 2020年 【目的】研究枣瘿蚊基因遗传变异程度,分析基因多态性 。【方法】从枣瘿蚊部分基因组序列中搜索SSR并设计相应引物,挑选引物48对进行有效筛选。枣瘿蚊样本来自新疆阿拉尔市、昆玉市、且末县等地区,以枣瘿蚊DNA为模板进行PCR扩增,筛选特异性 微卫星 引物;通过琼脂糖凝胶电泳进行定性 检测,再以毛细管电泳检测其多态性 。【结果】有42对引物能扩增出条带,选择其中20对特异性 较好的引物进行多态性 分析。观测杂合度(Observed heterozygosity,Ho)、期望杂合度(Expected heterozygosity,He)和多态 信息含量(PIC)平均值分别是0.358、0.649和0.635,其中18对引物PIC值>0.5,具有较高的多态性 。【结论】开发的微卫星 标记多态性 较高,可用于枣瘿蚊种群遗传多样性 及遗传结构研究。 马光皇 康淑媛 李莉 肖海兵 熊仁次 杨明禄关键词:枣瘿蚊 多态性
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袁青妍 作品数:39 被引量:167 H指数:7 供职机构:浙江省农业科学院 研究主题:牦牛 微卫星标记 屠宰性能 体尺 微卫星多态性 张政 作品数:62 被引量:284 H指数:9 供职机构:重庆医科大学 研究主题:糖尿病肾病 LET-7 肾小球系膜细胞 一氧化氮合酶 糖尿病 夏冰 作品数:271 被引量:1,250 H指数:19 供职机构:武汉大学中南医院 研究主题:炎症性肠病 溃疡性结肠炎 基因多态性 克罗恩病 胃癌 李慧敏 作品数:39 被引量:113 H指数:6 供职机构:南京医科大学第二附属医院 研究主题:肾上腺髓质素 糖尿病肾病 2型糖尿病 糖尿病 高糖培养 张珍祥 作品数:574 被引量:3,696 H指数:26 供职机构:华中科技大学同济医学院 研究主题:哮喘 蛋白激酶C 支气管哮喘 慢性阻塞性肺疾病 一氧化氮