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一种天台鹅耳枥微卫星多态性引物及其应用
本发明公开了28对天台鹅耳枥微卫星多态性引物及其筛选方法和应用。本发明利用分子生态学和种群遗传学研究方法,通过分析天台鹅耳枥各个微卫星位点的基因多态性、杂合水平评估天台鹅耳枥的种群遗传多样,在此基础上,形成天台鹅耳枥...
杨丽媛顾翠花邹薇邵洁馨孙璐璐何昕晨季梦成刘志高
食管癌术后肺部感染病原学和TNF基因微卫星多态性及TGF-β1/Smads信号通路表达
2024年
目的探讨食管癌(EC)患者术后肺部感染血浆肿瘤坏死因子(TNF)基因微卫星多态性、转化生长因子-β1(TGF-β1)/Smads信号通路蛋白水平变化及其病原学特点。方法选取2020年8月-2023年7月衡水市人民医院收治的60例EC术后发生肺部感染患者(感染组)和70例EC术后未发生肺部感染患者(未感染组)。收集EC患者的临床资料并分析病原学特点,分析患者血浆TNF基因微卫星多态性,比较两组患者外周血TGF-β1、Smad2、Smad3、Smad7蛋白水平表达,分析TGF-β1、Smad2、Smad3、Smad7单独及联合检测对EC患者术后肺部感染的诊断价值。结果感染组60例EC患者共培养出61株病原菌,其中革兰阴菌(67.21%)中的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌与革兰阳菌(26.23%)中的金黄色葡萄球菌占比较高,真菌(6.56%)占比较少;与未感染组相比,感染组血浆中TNF基因微卫星分型TNFc 1/1基因型、TNFc1等位基因占比较高(P<0.05);与未感染组相比,感染组外周血TGF-β1、Smad2、Smad3和Smad7蛋白水平升高(P<0.05);TGF-β1、Smad2、Smad3和Smad7联合检测对EC患者术后肺部感染的诊断曲线下面积(AUC)值高于单独检测的AUC值(P<0.05),联合检测的特异度为87.14%,敏感度为86.67%。结论EC患者术后肺部感染病原菌主要为革兰阴菌中的肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌及革兰阳菌中的金黄色葡萄球菌。EC患者术后肺部感染与血浆中TNF基因微卫星分型TNFc1/1基因型、TNFc1等位基因占比及TGF-β1/Smads信号通路蛋白水平变化有关,TGF-β1、Smad2、Smad3和Smad7联合检测对EC患者术后肺部感染具有较高的诊断价值。
王志芳高薇张宁陈雨桐徐柯楠
关键词:食管癌肺部感染多态性
黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物及品种分子鉴定方法
本发明公开了黄秋葵叶绿体微卫星多态性标记引物及品种分子鉴定方法。本发明中多态性标记引物的序列为:SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.24。基于提供的多态性标记引物,通过常规PCR扩增、非变聚丙烯酰胺凝胶电泳和D...
俞晨良 孙晨栋 董文其
TNFc微卫星多态性与肝癌TACE介入术后感染易感的关联
2022年
目的 分析肿瘤坏死因子β基因内含子的微卫星多态性(TNFc)与肝癌经导管动脉化疗栓塞术(TACE)介入术后感染易感的关联。方法 选取2021年1月-2021年9月南通市第一人民医院TACE术后感染的肝癌患者61例为研究组,同期TACE术后未发生感染患者79例为对照组。分析术后感染部位及病原学特点,采用聚合酶链反应-限制片段长度多态性(PCR-RFLP)检测TNFc微卫星基因多态性及其与术后感染易感的关联。结果 TACE术后感染部位以胆道感染(42.62%)为主,革兰阴菌(76.39%)为主要病原菌;研究组患者TNFc基因C1C1基因型频率和C1等位基因频率高于对照组(P<0.05);C1C1型感染患者血清C-反应蛋白(CRP)和降钙素原(PCT)水平高于C1C2/C2C2型患者(P<0.05);TACE术后感染患者不同TNFc微卫星基因型术后住院时间和病死率比较差异无统计学意义。结论 肝癌TACE介入术后感染以胆道感染为主,TNFc微卫星C1C1基因型和C1等位基因可能增加患者术后感染易感
陆咏范本芳陈春霞周三连戚慧沈博然
关键词:肝癌微卫星多态性
食管癌术后肺部感染血浆TNF基因微卫星多态性及与其预后的关系被引量:2
2022年
目的探讨食管癌术后肺部感染患者血浆肿瘤坏死因子(TNF)基因微卫星多态性及与其预后的关系。方法将30例食管癌术后继发肺部感染患者设为观察组,同期食管癌术后未发生感染的120例患者设为对照组,并依据观察组患者预后情况(住院28 d是否死亡)分为生存组(n=25)与死亡组(n=5)。运用聚合酶链式反应行DNA扩增,以聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染技术施以微卫星分型。比较观察组与对照组、生存组与死亡组TNFc微卫星基因型与等位基因分布,并进行预后分析。结果观察组携带TNFc1/1基因型与TNFc1等位基因比例高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);肺部感染患者中死亡组携带TNFc1/1基因型与TNFc1等位基因比例高于生存组,差异有统计学意义(P<0.05);多因素分析显示:血液高凝状态、低蛋白血症以及携带TNFc1/1基因型为造成患者预后不良的危险因素(P<0.05)。结论TNF基因微卫星多态性与食管癌术后肺部感染及预后密切相关,TNFc1/1基因型会增加食管癌患者易感,导致不良预后,临床需予以高度重视。
师智勇张振世刘圣武
关键词:食管癌肺部感染肿瘤坏死因子预后
翘嘴鲌生长激素受体1基因内含子1、2中微卫星多态性及与生长状的关联分析被引量:2
2022年
本研究检测了120尾同批繁殖、同塘养殖的12月龄翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)生长激素受体1(Growth hormone receptor 1,ghr1)基因内含子1、2的8个微卫星位点的基因型,分析了ghr1基因内含子1、2微卫星多态性与生长能的相关,为进一步研究其生物学功能及分子标记辅助育种奠定基础。结果表明:7个微卫星位点具有多态性,微卫星标记平均等位基因数12.714,平均有效等位基因数5.839,平均期望杂合度0.625,平均观测杂合度0.535,平均多态信息含量0.608;除了ghr1-6和ghr1-7属于低度多态性位点(PIC<0.25),另有5个属于高度多态性位点(PIC>0.5)。关联分析结果显示:ghr1-3位点中257/259型个体的体长和体质量均高于其他基因型,其体质量与245/261和259/259差异不显著(P>0.05),但显著高于另外5种基因型(P<0.05)。翘嘴鲌ghr1-3多态性与生长状存在关联,可作为翘嘴鲌生长的候选辅助标记,有助于翘嘴鲌遗传资源的评价、鉴定和保护利用等分子生物学研究。
刘士力李飞贾永义郑建波迟美丽程顺卞玉玲顾志敏
关键词:翘嘴鲌微卫星生长性状
食管癌术后肺部感染血浆TNF基因微卫星多态性及与预后的关系被引量:2
2021年
目的探讨食管癌术后肺部感染患者血浆肿瘤坏死因子(TNF)基因微卫星多态性及其与预后的关系。方法选取2018年1月-2020年9月邢台市人民医院食管癌术后继发肺部感染患者115例为感染组,系统抽样选取同期食管癌根治术未发生感染患者148例为对照组。根据肺部感染患者预后情况分为生存组88例和病死组27例。采用聚合酶链式反应进行DNA扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染技术进行微卫星分型。结果感染组携带TNF c 1/1基因型的频率为39.13%高于对照组(P<0.05),携带TNF c 1等位基因的频率为63.04%高于对照组(P<0.05);肺部感染患者中病死组携带TNF c 1/1基因型的频率为59.26%高于生存组(P<0.05),携带TNF c 1等位基因的频率为75.93%高于生存组(P<0.05);低蛋白血症、血液高凝状态、携带TNF c 1/1基因型是导致患者预后不良的危险因素(P<0.05)。TNF c 1/1基因型患者住院时间长于TNF c 1/2基因型、TNF c 2/2基因型(P<0.05)。结论TNF基因微卫星多态性与食管癌术后肺部感染及其预后有关,TNF c 1/1基因型可能增加肺部感染易感,并且导致不良预后。
何莉莉国建飞姜玉芳尚静赵丽莎
关键词:食管癌肺部感染肿瘤坏死因子预后
雉鸡微卫星多态性分析被引量:1
2020年
利用高通量测序等手段开发了8个具有多态性微卫星标记(ZLL-12、ZLL-14、ZLL-30、ZLL-37、ZLL-55、ZLL-56、ZLL-61、ZLL-68),以期从分子水平上研究雉鸡的遗传多样,为雉鸡种质资源遗传多样研究、基因定位以及分子标记辅助育种提供分子水平上的有效工具。试验结果显示:RN群体中,观测等位基因数平均为5.38,每个位点从1(zll-12)到9(zll-30和zll-68)不等,有效等位基因数平均为3.64;MX群体中,观测等位基因数平均为5.75,每个位点从2(zll-12)到10(zll-68)不等,有效等位基因数平均为3.65;D群体中,观测等位基因数平均为5.13,每个位点从2(zll-12)到11(zll-30)不等。8个位点在RN、MX、D 3个群体中,除zll-12、zll-61的PIC小于0.5外,其余6个位点的PIC值均高于0.5。
邢磊赵乐乐袁红艳张春华陆雪林
关键词:微卫星多态性雉鸡高通量测序
三峡库区三个养殖鲟鱼物种微卫星多态性分析被引量:1
2020年
鲟鱼群体遗传多样对孵化场管理和人工繁育过程中保护鲟鱼多样及保持近交最小化至关重要。利用微卫星遗传标记研究了三峡库区人工养殖鲟鱼物种欧洲鳇(Huso huso)、达氏鲟(Huso dauricus)和杂交鲟(Acipenser schrencki♂×Huso dauricus♀)的遗传多态性。结果表明,3个人工养殖鲟鱼群体在5个微卫星位点均表现高度多态。在欧洲鳇、达氏鲟和杂交鲟3个群体中,5个微卫星位点分别共观察到42、38和29个等位基因。平均多态信息含量从低到高依次为杂交群体0.7099、欧洲鳇群体0.8056和达氏鲟群体0.8288;平均杂合度依次为杂交群体0.7563、欧洲鳇群体0.8280和达氏鲟群体0.8482.这些遗传指标说明三峡库区人工养殖的欧洲鳇、达氏鲟和杂交鲟具有高度遗传多态性
张润锋焦明静柯年峰
关键词:鲟鱼微卫星遗传多态性三峡库区
枣瘿蚊微卫星标记筛选及微卫星多态性分析被引量:1
2020年
【目的】研究枣瘿蚊基因遗传变异程度,分析基因多态性。【方法】从枣瘿蚊部分基因组序列中搜索SSR并设计相应引物,挑选引物48对进行有效筛选。枣瘿蚊样本来自新疆阿拉尔市、昆玉市、且末县等地区,以枣瘿蚊DNA为模板进行PCR扩增,筛选特异微卫星引物;通过琼脂糖凝胶电泳进行定检测,再以毛细管电泳检测其多态性。【结果】有42对引物能扩增出条带,选择其中20对特异较好的引物进行多态性分析。观测杂合度(Observed heterozygosity,Ho)、期望杂合度(Expected heterozygosity,He)和多态信息含量(PIC)平均值分别是0.358、0.649和0.635,其中18对引物PIC值>0.5,具有较高的多态性。【结论】开发的微卫星标记多态性较高,可用于枣瘿蚊种群遗传多样及遗传结构研究。
马光皇康淑媛李莉肖海兵熊仁次杨明禄
关键词:枣瘿蚊多态性

相关作者

袁青妍
作品数:39被引量:167H指数:7
供职机构:浙江省农业科学院
研究主题:牦牛 微卫星标记 屠宰性能 体尺 微卫星多态性
张政
作品数:62被引量:284H指数:9
供职机构:重庆医科大学
研究主题:糖尿病肾病 LET-7 肾小球系膜细胞 一氧化氮合酶 糖尿病
夏冰
作品数:271被引量:1,250H指数:19
供职机构:武汉大学中南医院
研究主题:炎症性肠病 溃疡性结肠炎 基因多态性 克罗恩病 胃癌
李慧敏
作品数:39被引量:113H指数:6
供职机构:南京医科大学第二附属医院
研究主题:肾上腺髓质素 糖尿病肾病 2型糖尿病 糖尿病 高糖培养
张珍祥
作品数:574被引量:3,696H指数:26
供职机构:华中科技大学同济医学院
研究主题:哮喘 蛋白激酶C 支气管哮喘 慢性阻塞性肺疾病 一氧化氮