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微卫星SM7多态 信息 含量 的测定与应用 被引量:3 1999年 Ⅰ型常染色体显性遗传多囊肾病(autosomaldominantpolycystickidneydiseascⅠ,ADPKDⅠ)发病率约为1.1/1000[1],在需肾替代治疗的患者中约占10%,目前没有理想的早期诊治方法。我们应用微卫星SM7标记,... 王立明 闵志廉 朱有华 齐隽 缪为民 陈建鹤 焦炳华关键词:微卫星 囊性肾 基因诊断 微卫星标记分析勒通绵羊的遗传多样性 2024年 为了对勒通绵羊这一资源群体的遗传多样性进行评价,本试验选择位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,采用毛细管凝胶电泳的方法进行等位基因的分型。结果表明,30个微卫星标记共有262个等位基因,每个标记的等位基因数在3~18个之间,平均为8.73个;有效等位基因数为1.5636~9.5163个,平均为4.2384个;观察杂合度为0.3276~0.9138,平均为0.6563;期望杂合度为0.3636~0.9027,平均为0.7170;多态 信息 含量 为0.330~0.886,平均为0.6764,属于高度多态 性。揭示勒通绵羊具有丰富的多样性,有进一步挖掘利用的价值。 周明亮 庞倩 陈明华 曾洁 毛进彬 杨平贵关键词:微卫星标记 多态信息含量 杂合度 也迷里鸡微卫星遗传多样性分析 被引量:1 2023年 【目的】研究也迷里鸡遗传多样性变化及世代间遗传分化,为也迷里鸡品种选育提供理论依据。【方法】利用15个微卫星位点对也迷里鸡2个世代共4个群体(G_(1):1世代公鸡、G_(2):2世代公鸡、M _(1):1世代母鸡、M _(2):2世代母鸡)进行遗传多样性分析。【结果】15个微卫星位点在120个个体中共检测到102个等位基因,每个位点平均等位基因数(Na)为6.8个。各位点的期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)平均值分别为0.708和0.660。平均多态 信息 含量 (PIC)较高(0.661),表现为高度多态 性。F-统计量中群体内近交系数(Fis)、总群体近交系数(Fit)和群体间遗传分化系数(Fst)平均值分别为0.051、0.070和0.020,也迷里鸡群体的近交程度低、遗传分化不明显。群体基因流MCW0216位点最大(29.689),LEI0166位点最小(6.192),各位点平均基因流(Nm)为15.091,4个群体间存在高度的基因交流。也迷里鸡4个群体按遗传距离被分为2类。【结论】也迷里鸡具有较大的选择潜力,拥有丰富的遗传多样性。 姚莹莹 李家辉 李海英 吴盈萍 赵晓钰 周军 赵全庄 李宗福关键词:微卫星标记 多态信息含量 玛格绵羊资源群体的遗传多样性研究 被引量:2 2022年 为了评价四川省得荣县玛格绵羊资源群体的遗传多样性,选择位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,采用毛细管电泳进行等位基因分型,分析并评价玛格绵羊群体的遗传多样性。结果显示:玛格绵羊群体30个微卫星标记具有4~14个等位基因,平均为8.37个等位基因;观察杂合度(Ho)为0.217~0.850,平均为0.6055,期望杂合度(He)为0.333~0.897,平均为0.7018;多态 信息 含量 (PIC)为0.310~0.879,平均为0.664。揭示玛格绵羊资源群体的遗传多样性丰富,为下一步开发利用奠定了基础。 吴亚姗 杨平贵 付华龙 阿龙呷 陈明华 毛进彬 庞倩 周明亮关键词:微卫星标记 多态信息含量 杂合度 基于二代测序平台的微单倍型位点的分型研究 被引量:1 2021年 目的建立基于二代测序平台的微单倍型分型方案,调查其在中国南方汉族人群中的多态 性,探讨其法医学应用价值。方法以20个微单倍型位点为研究对象,利用多重PCR构建靶向扩增子文库,以二代测序为检测手段,采用生物信息 学方法构建个体微单倍型,最后进行多态 性分析。结果总体测序量为2.12G,覆盖所有片段,平均覆盖深度为3353×。微单倍型内含72个SNP位点的观测杂合度范围为0.109~0.587,平均值为0.364;而20个微单倍型位点本身的观测杂合度范围为0.198~0.837,平均值为0.726,均高于SNP位点。20个微单倍型位点中仅一个位点未通过Hardy-Weinberg平衡检验,剩余19个位点的有效等位基因数值为3.119~7.170,多态 信息 含量 为0.620~0.845,平均多态 信息 含量 为0.711。19个有效微单倍型位点的匹配概率为0.044~0.181,累积匹配概率为3.132×10^(-19)。结论本次研究证实了19个微单倍型的参数效能与常用15个STR基因座相当,可独立应用于法医个体识别并具潜在混合物分析价值,该结果为法医遗传学实践提供更多选择。 陈肯 武建楠 王欢 庞铂实 周宇荀 肖君华 李凯关键词:法医遗传学 高通量测序 单核苷酸多态性 多态信息含量 鹌鹑GNAS基因的多态 性与产蛋性能和蛋品质的关联分析 被引量:1 2021年 为了分析GNAS基因与鹌鹑产蛋性能和蛋品质的关联性,试验采用限制性片段长度多态 性聚合酶链反应(PCR-RFLP)方法对不同羽色鹌鹑的GNAS基因进行多态 性检测,并分析了GNAS基因与鹌鹑产蛋性能和蛋品质的关联性。结果表明:在GNAS基因中分别检测到TT、CT、CC这3种基因型。GNAS基因在中国黄羽鹌鹑、北京白羽鹌鹑、朝鲜鹌鹑中的TT基因型频率分别为0.7778,0.7755,0.8571;CT基因型频率分别为0.2222,0.1633,0.1429;GNAS基因在北京白羽鹌鹑中的CC基因型频率为0.0612,在另外两个鹌鹑品种中未检测到CC基因型个体。GNAS基因TT基因型和CT基因型的产蛋总重、产蛋率和开产体重显著高于CC基因型(P<0.05)。GNAS基因CC基因型的蛋黄指数显著高于CT基因型(P<0.05),TT和CT基因型的蛋壳厚度显著高于CC基因型(P<0.05)。说明GNAS基因与鹌鹑的产蛋总重、产蛋率、开产体重、蛋黄指数和蛋壳厚度有显著关联性。 陈宇 白俊艳 王亮 陈梦柯 范征宇 李淦 雷莹 王新乐 李静云 董智豪 王龙威 冀祥 贾小平 贾小平 庞有志 王纪远 任旭鸽 张溢满 赵郑歌关键词:鹌鹑 多态性检测 多态信息含量 产蛋性能 小尾寒羊生长激素(GH)基因的多态 性分析 2020年 本研究利用PCR-SSCP与测序相结合的方法,分析了小尾寒羊GH基因第2外显子的多态 性。为河南小尾寒羊分子标记辅助育种的开展和生产性能、生产效益和经济效益的提高提供基础资料和科学依据。结果表明,GH外显子2在小尾寒羊群体中检测到的3种基因型分别为AA、AB、BB,3种基因型频率分别为:0.2813、0.1875和0.5312,A、B等位基因频率分别为0.5469和0.4531。GH外显子2的杂合度为0.5312,有效等位基因数为2.1331,多态 性信息 含量 为0.3728,该位点表现为中度多态 。AA和BB基因型测序结果发现,在第101位点和第145位点上,AA基因型为G和R(AG套峰),BB基因型为S(GC套峰)和A。 范征宇 胡琦杭 黄高想 邵俊红 时坤鹏 张佳庆 胡陆星 白俊艳 赵淑娟 郑立 毛世豪 王亮 张溢满 任旭鸽 郭泊瑶关键词:小尾寒羊 生长激素基因 多态信息含量 杂合度 布拖黑绵羊微卫星标记遗传多样性研究 被引量:7 2018年 本文旨在研究布拖黑绵羊群体的遗传特性,选择了位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,统计等位基因、多态 信息 含量 、杂合度等,分析布拖黑绵羊群体的遗传多样性。结果表明,布拖黑绵羊群体30个微卫星标记具有4~13个等位基因,平均为7.27个等位基因;30个微卫星标记的观察杂合度为0.3269~0.8846,平均为0.6269;期望杂合度为0.3620~0.8865,平均为0.6769;多态 信息 含量 为0.3338~0.8660,平均为0.6257,显示布拖黑绵羊群体具有丰富的遗传多样性。 周明亮 陈明华 庞倩 杨平贵 李燕关键词:微卫星标记 等位基因 多态信息含量 杂合度 惠阳胡须鸡微卫星多态 性研究 被引量:2 2017年 为进一步保护和利用惠阳胡须鸡遗传资源,监测保种场保种效果,随机采集96只惠阳胡须公鸡血样,提取总DNA,选用18对微卫星标记进行PCR扩增,并对其基因片段进行扫描,利用Pop Gen 32软件分析扫描结果,结果表明,18个微卫星标记在惠阳胡须鸡群中均表现出较高的多态 性,平均等位基因数为10.61个,平均杂合度H为0.5963,平均多态 信息 含量 PIC为0.74。说明惠阳胡须鸡保种群体具有丰富的遗传多样性,具有较大的选育潜力。 李红伟 陈圆 邓丹青 刘家玲 钟淡龙关键词:微卫星标记 等位基因 杂合度 多态信息含量 白花草木樨EST-SSR标记的开发与筛选 被引量:7 2017年 草木樨(Melilotus)是重要的豆科牧草之一,然而草木樨分子标记匮乏,限制了草木樨种质资源的开发与利用。本研究以白花草木樨(M.albus)转录组数据为基础,设计了18 182对草木樨EST-SSR引物,并对所开发的EST-SSR引物进行筛选。通过PCR扩增从550对EST-SSR引物中筛选得到206对白花草木樨多态 性引物,共检测出679个等位基因,平均每对引物检测出2.888个基因位点。多态 信息 含量 PIC的分布范围为0.239~0.855,平均值为0.468。206对多态 性引物Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息 指数(I)的平均值分别为0.169和0.239。本研究开发的EST-SSR丰富了草木樨属的分子标记,为研究种质资源的遗传多样性和分子辅助育种奠定了基础。 剡转转 任艳 吴凡 骆凯 张代玉 闫启 张宇飞 赵玉凤 张吉宇关键词:草木樨 EST-SSR 多态信息含量
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苗永旺 作品数:261 被引量:746 H指数:15 供职机构:云南农业大学动物科学技术学院 研究主题:槟榔江水牛 水牛 奶水 微卫星标记 杂合度 霍金龙 作品数:246 被引量:531 H指数:13 供职机构:云南农业大学动物科学技术学院 研究主题:生物信息学分析 生物信息学 基因克隆 近交系 微卫星标记 陈涛 作品数:17 被引量:113 H指数:8 供职机构:云南农业大学 研究主题:微卫星标记 多态信息含量 杂合度 微卫星标记分析 群体遗传变异 刘丽仙 作品数:173 被引量:486 H指数:12 供职机构:云南农业大学 研究主题:武定鸡 地方鸡 肉品质 生化标记 屠宰性能 高玉时 作品数:508 被引量:1,706 H指数:20 供职机构:中国农业科学院家禽研究所 研究主题:鸡蛋 蛋鸡 线粒体DNA 引物 鸡肉