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阿拉伯海中层缺氧海域沉积物原核生物多样性与功能潜力研究: 最小含氧带(Oxygen Minimum Zone,OMZ)指海洋中溶解氧缺乏的水层,一般分布于200-1000 m,亦称中层缺氧带。OMZ是重要的活性氮汇区,导致全球海洋约30-50%的氮丢失。中层水体严重的氮丢失会降...; 莫晶; 关键词：原核生物多样性

葡萄根际原核生物多样性及其与土壤因子的相关性研究被引量：1: 2022年; 为探明云南主产区葡萄根际土壤原核生物多样性,更好地改善葡萄根际土壤环境,采集建水、宾川、弥勒和元谋葡萄种植区的27份葡萄根际土壤样品,通过16S rRNA基因扩增子测序技术对葡萄根际土壤原核生物群落结构进行分析,并探究云南主产区葡萄根际土壤主要原核生物种类与土壤因子的相关性。结果表明:云南主产区葡萄根际以变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为主要优势菌门;Bacillus、Acidibacter、Arthrobacter、Bryobacter、Conexibacter、Gaiella、Mycobacterium、Nitrolancea、Nocardioides、Paenibacillus、Phenylobacterium、Pseudaminobacter、Pseudolabrys、Streptomyces、Thermoactinomyces这15个原核生物属为葡萄根际土壤核心原核生物属。此外,还有12个未能明确鉴定出属名的原核生物在所有样本中均出现,可能是其核心原核生物,有待进一步研究证实。相关性分析表明,土壤pH值是显著影响葡萄根际土壤原核生物群落组成的关键因子。; 吴志浩赵鹏丽陈以杰夏运生张俊锋杞丽红张仕颖; 关键词：葡萄根际原核生物多样性土壤因子

高盐环境原核生物多样性及一株嗜盐古菌的多相分类学研究: 嗜盐微生物,包括嗜盐古菌和嗜盐细菌,是生活于高盐环境的极端微生物。由于其特殊的生理代谢特征,它们在生产生物可降解塑料和处理工业高盐有机废水等方面具有较高的应用前景。不同形态的高盐环境,因生境不同,嗜盐微生物的组成存在较大...; 许瑶; 关键词：嗜盐古菌克隆文库

杭州湾入海口沉积物原核生物多样性分析被引量：1: 2018年; 为了解杭州湾入海口沉积物中原核生物多样性特征及其与环境因子的关系,应用Illumina Miseq测序平台对原核微生物16S rRNA基因V3-V4区序列进行了高通量测序,分析了杭州湾入海口13个点位的沉积物原核生物多样性特征。结果表明:1)共有原核生物65个门、210个纲、419个目、688个科和1118个属,Shannon-Wiener指数平均值达9.72;主要优势菌有变形菌(Proteobacteria)、绿弯菌(Choloroflexi)和拟杆菌(Bacteroidetes)等,其中变形菌相对丰度最大;2)杭州湾南岸沉积物中厚壁菌(Firmicutes)的丰度比北岸高,对比上虞工业区和金山工业区排污口的样品可以发现,前者β变形菌相对丰度较高,而后者γ变形菌的相对丰度较高;3)绿菌(Chlorobi)、放线菌(Actinobacteria)、拟杆菌和β变形菌(β-Proteobacteria)等相对丰度与总有机碳(TOC)显著相关;拟杆菌、放线菌和酸杆菌(Acidobacteria)等相对丰度与p H值显著相关;Fe和As皆与α变形菌、GN04和绿菌丰度具有显著相关性,Mn和Cu也分别与GN04和螺旋体(Spirochaetes)显著相关。因此,应用高通量测序方法可用于杭州湾入海口原核生物群落多样性特征分析,进而了解该区域原核生物分布与环境之间的相关关系。; 李双彤张秋芳周阳靖唐方园程军蕊郑琦宏徐继荣; 关键词：沉积物原核生物多样性 RRNA基因高通量测序

不同窖龄窖泥原核生物多样性的高通量测序研究被引量：9: 2016年; 窖池环境和其中多样的微生物构成了浓香型大曲酒发酵的特殊生态系统,其中蕴藏着丰富的微生物资源。试验通过对两个酒厂的新老窖池的不同取样位置的窖泥样品进行基于Illumina Miseq平台对细菌V3可变区进行高通量测序并结合理化性质的测定,研究各窖泥样品原核生物的群落结构,以及窖泥理化性质和窖泥中所含放线菌丰度的联系。研究结果初步表明,窖池老熟过程本质上是窖泥理化性质与其中微生物群落多样性交互作用的过程。; 李克亚文章邓斌李周胡承; 关键词：窖泥丰度高通量测序原核生物

滇池沉积物中原核生物多样性及好氧反硝化菌的活性评价: 湖泊富营养化不仅严重影响水体的生态系统,同时对经济建设、社会发展和人类健康也造成威胁与损害。沉积物是湖泊生态系统的重要组成部分,是水体中营养物质的储存库且在水体中碳、氮、磷、钾、硫等元素的生物地球化学循环扮演着重要作用。...; 霍睛睛; 关键词：滇池原核生物非生物因子好氧反硝化

利用454测序技术分析云南3个代表性盐矿的原核生物多样性: 本研究采用454测序技术对来自云南不同位置的3个代表性盐矿样品的分析发现，其中都含有多样的微生物，且这些微生物与多种环境非生物因子具有相关性，其中对原核生物影响最大的因子是pH,Ca2+和HC03-,且盐度只与酸杆菌门显...; 肖炜段瞾王永霞李治滢赖泳红崔晓龙; 关键词：原核生物群落多样性测序技术盐矿

珠海市海-陆交错带水环境原核生物多样性被引量：7: 2010年; 采用16S rRNA基因PCR-RFLP分析技术,对珠海市海-陆交错带的海水和地下水进行原核生物多样性分析,并将所得数据与国际基因数据库Genbank进行相似性比较及聚类分析.结果表明:海水细菌以变形菌居多,其次是古菌和芽单胞菌,以及Candidate division OP3、OP8和浮霉菌等;海-陆交错带地下水细菌则以古菌居多,其次是变形菌和鞘脂杆菌,以及Candidate division OP3、放线菌和假单胞菌等.海-陆交错带地下水中大部分优势类群与源于海洋的不可培养细菌具有很高的相似性.地下水样中存在大量能降解有机质和具有净化水体潜力的细菌,说明在长期演化下,海-陆交错带兼备了海洋生态系统和陆地生态系统的特征.; 黄小兰陈建耀周世宁谢丽纯付丛生; 关键词：原核生物多样性 RRNA基因水环境

原核生物多样性研究的新工具被引量：2: 2010年; 原核生物在自然界中分布广泛、数量巨大,参与多种全球性的物质循环和能量传递。然而,长期以来对其多样性的测度受到研究技术的限制。随着高通量测序、生物芯片等新技术的不断更新,原核生物多样性研究途径也在不断变化。目前,用于环境中原核生物多样性研究的高通量测序技术主要有Genome Sequencer FLX(GS FLX)测序系统和Illu-mina Genome Analyzer测序系统;而高通量芯片则以GeoChip为代表。但这些新兴技术手段各自的特点不同,得到的大量序列信息如何用于原核生物多样性测度以及哪些多样性测度手段适用,是研究人员需要面对的问题。因此,本文总结和比较了目前最新的研究手段和程序工具,并归纳了适应目前技术条件的原核生物多样性的主要研究途径。; 魏博吴欣; 关键词：分子生态高通量测序技术

四川大英盐湖原核生物多样性初步研究: 四川大英盐湖是抽取地下3042米处的盐卤水形成的一个极端高盐环境，其地下盐卤水含盐量超过了22％。本研究首次对该环境下的原核生物多样性进行研究，寻找有利用价值的新类群。本研究从四川大英盐湖采集水样和土样，离子...; 杨益芬; 关键词：原核生物多样性系统发育苯酚降解

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