搜索到2678篇“ 单链构象多态性分析“的相关文章
- 聚合酶链式反应偶联单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术用于鹿鞭线粒体DNA指纹的研究被引量:11
- 2014年
- 目的建立一种快速、简便、准确的分子生物学方法,用来鉴别鹿鞭真伪及品种。方法应用柱色谱法提取梅花鹿鞭、马鹿鞭、牛鞭以及市售鹿鞭线粒体DNA;根据GenBank中鹿类动物线粒体细胞色素b基因序列,设计一对引物用于线粒体DNA的聚合酶链式反应(PCR)特异性扩增;应用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对聚合酶链式反应产物进行单链构象多态分析(single strand conformation polymorphism,SSCP)。结果梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭可显示清晰且迁移率不同的片段;对照组伪品鹿鞭及部分市售鹿鞭无特异性显示。结论柱色谱法提取线粒体DNA所需时间短,DNA纯度高,DNA分子的破坏性较小,为特异性聚合酶链式反应扩增提供一级结构保证;单链构象多态分析法可以清晰显示正品梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭单链片段,其一级结构中的碱基差别为正品梅花鹿鞭、马鹿鞭的不同迁移率提供依据,也为药源市场鹿鞭的鉴别提供一种可以直接进行亚种间鉴别的快速、简便、准确的可行性方法。
- 孙景昱张丽华傅桂莲李明成刘洋
- 关键词:鹿鞭
- 淡色库蚊乙酰胆碱酯酶Ι基因单链构象多态性分析被引量:1
- 2013年
- 为了解不同地区淡色库蚊样本乙酰胆碱酯酶Ι基因(ace1)多态性,探讨单链构象多态性分析(SS-CP)技术在蚊虫抗性分子监测中应用的可行性,本文采集浙江省杭州、舟山、湖州、金华等市区淡色库蚊样本,对其进行ace1基因PCR扩增及SSCP分析。结果显示,浙江省淡色库蚊现场品系以及敏感品系ace1基因片段共存在2个SSCP型,分别命名为ace1-A型(杭州、舟山、湖州现场品系以及敏感品系)和ace1-B型(金华现场品系)。经序列测定,SSCP型ace1-A和ace1-B之间存在两个碱基的差异。实验证明PCR-SSCP可快速高效分析淡色库蚊ace1基因的多态性,适于蚊虫抗性分子监测使用。
- 孔庆鑫邱丽华韦凌娅倪晓平
- 关键词:淡色库蚊乙酰胆碱酯酶单链构象多态性分析
- 应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析检测散发性乳腺癌EMSY基因的突变
- 2011年
- 目的了解EMSY基因在散发性乳腺癌组织中的突变情况,探讨EMSY基因突变与散发性乳腺癌的关系。方法收集72例散发性乳腺癌组织及18例乳腺良性肿瘤患者的肿瘤组织,常规酚-氯法抽提组织DNA,并应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR—SSCP)的方法,扩增其EMSY基因的20个外显子,然后根据构象改变来分析此基因突变情况。结果72例散发性乳腺癌组织以及18例乳腺良性肿瘤组织中,6例样本存在第9外显子SSCP条带的异常改变,测序结果为第9外显子区GCA(丙氨酸)中的A杂合性缺失,突变率为8.3%(6/72)。结论本课题研究提示广西散发性乳腺癌中存在着EMSY基因第9外显子的缺失突变,并且在乳腺癌患者中突变率高于乳腺良性肿瘤患者。
- 刘竞张海添陆云飞蒋建春
- 关键词:乳腺癌突变聚合酶链反应-单链构象多态性分析
- 毛细管电泳单链构象多态性分析检测胃癌p53基因282位密码子的突变
- p53基因点突变在胃癌的发生过程中起重要作用,基因点突变的检测将有助于临床准确诊断胃癌。本实验用PCR扩增包含282位密码子的胃癌及癌旁正常组织p53基因,扩增样品经95℃变性,以CE-SSCP对其突变情况进行检测。
- 张爱梅王荣
- 关键词:胃癌基因突变毛细管电泳单链构象多态性
- 毛细管电泳单链构象多态性分析检测胃癌p53基因282位密码子的突变
- p53基因点突变在胃癌的发生过程中起重要作用,基因点突变的检测将有助于临床准确诊断胃癌。本实验用PCR扩增包含282位密码子的胃癌及癌旁正常组织p53基因,扩增样品经95℃变性,以CE-SSCP对其突变情况进行检测。
- 张爱梅王荣
- 关键词:胃癌毛细管电泳单链构象多态性基因点突变
- 毛细管电泳-单链构象多态性分析技术
- 2009年
- 毛细管电泳-单链构象多态性分析技术(CE-SSCP)是进行基因突变分析、细菌鉴定、抗菌活性分析、单核苷酸多态性(SNP)分型和mRNA定量的强有力工具。近些年来,随着分子生物学技术的不断发展,其应用也愈加广泛。本文就该技术的基本原理及影响参数,如筛分介质、检测器、温度、缓冲液组成及pH值等进行了综述,并对其应用作了简要介绍。
- 刘春江夏涵黄君富府伟灵
- 关键词:毛细管电泳单链构象多态性分析基因突变分析细菌鉴定
- 26S rDNA单链构象多态性分析在临床酵母菌菌种鉴定中的应用被引量:12
- 2009年
- 【目的】探讨酵母菌临床分离株26S rDNA D1/D2区序列种内相似性和种间差异性的快速检测方法,为临床酵母菌菌种鉴定方法的改进奠定基础。调查北京地区临床酵母菌的种群多样性,为国内酵母菌感染的流行病学研究提供新的基础数据。【方法】用5种常见临床酵母菌种的模式和权威菌株作为标准参考菌株,从北京四家综合性医院收集临床酵母菌260余株,PCR扩增其26SrDNAD1/D2区,对扩增产物进行单链构象多态性(Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析和序列测定分析。【结果】常见病原酵母菌26SrDNAD1/D2区的SSCP图谱具有明显的种间差异性和种内相似性,可以通过该方法对菌株进行初步的菌种鉴定。D1/D2-SSCP和序列分析相结合,对260余株临床酵母菌进行了菌种鉴定,共鉴定有10个属20个种,优势属为念珠菌属(Candida),优势种及其所占比例分别是:C.albicans(57.7%),C.parapsilosis(10.0%),C.tropicalis(9.2%),C.glabrata(6.7%)和C.krusei(5.8%),并发现过去从未或很少报道致病的酵母菌种,愈来愈多地出现在临床分离菌株中。【结论】26S rDNA D1/D2区的SSCP图谱分析为临床酵母菌株的快速鉴定提供了新的方法;北京地区酵母菌临床分离株呈种群多样性分布,C.albicans虽然仍占优势,但其它念珠菌种的比例已达42%。
- 李娟白逢彦
- 关键词:菌种鉴定单链构象多态性
- 不同地理株旋毛虫细胞色素氧化酶Ⅰ基因多态性的PCR-单链构象多态性分析被引量:3
- 2009年
- 目的:观察不同地理株旋毛虫细胞色素氧化酶Ⅰ(COXⅠ)基因片段的多态性。方法:根据旋毛虫mtD-NACOXⅠ设计引物,应用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对我国7个猪源旋毛虫(Trichinella spiralis,T1)地理株(河南、湖北、云南、西安、天津、黑龙江同江及哈尔滨株)与1个波兰猪源旋毛虫(T1,编号ISS3)地理株进行COXⅠ基因片段多态性进行分析。结果:我国7个猪源旋毛虫地理株与波兰地理株COXⅠ基因均扩增出约400bp的片段,PCR扩增产物经SSCP检测发现有3种基因型(AA、AB和BB),波兰地理株为AA型,黑龙江同江、哈尔滨、西安、云南、湖北及河南株均为AB型,天津株为BB型,其中以AB基因型频率最高(0.75),AA与BB基因型均为0.125;A和B等位基因频率均为0.5;旋毛虫不同地理株COXⅠ基因的多态性信息含量为0.375,为中度多态性。结论:8个不同地理株猪源旋毛虫的COXⅠ基因为中度多态性。
- 姜鹏毛福荣崔晶李峰张玺王莉王中全
- 关键词:旋毛虫地理株
- 单链构象多态性分析和变性高效液相色谱分析技术检测hMLH1和hMSH2基因突变的比较被引量:6
- 2008年
- 目的比较单链构象多态性分析(SSCP)和变性高效液相色谱分析技术(DHPLC)应用于遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)分子遗传学诊断的灵敏性和特异性。方法应用PCR-SSCP和DHPLC方法分析经测序验证有序列变异的7个家系的所有成员的相应PCR扩增产物,分别计算SSCP和DHPLC的灵敏度和特异度。结果应用SSCP对hMLH1和hMSH2进行基因突变筛查的敏感性和特异性分别为51.6%和66.6%;而应用DHPLC进行基因突变筛查的敏感性和特异性则分别为100%和93.3%;两种方法进行基因突变筛查的结果差异有统计学意义(P〈0.05)。结论DHPLC进行基因突变筛查的敏感性和特异性均高于SSCP,是理想的分子遗传学检测方法。
- 魏广辉赵博王振军
- 关键词:变性高效液相色谱分析单链构象MLH1MSH2遗传性非息肉性
- 应用多重PCR-单链构象多态性分析同时检测耐异烟肼和利福平的结核分枝杆菌
- 2008年
- 目的探讨应用多重PCR-单链构象多态性分析(multiplex—polymerase chain reaction—single strand conformation polymorphism,multi—PCR—SSCP)方法快速、特异地同时快速检测结核分枝杆菌对异烟肼和利福平耐药性的效能。方法根据结核分枝杆菌的inhA序列、katG序列、rpoB序列,分别设计出3对特异性寡聚核苷酸引物,采用multi—PCR—SSCP技术,一次性检出耐异烟肼和利福平的结核分枝杆菌。新方法的有效性通过116株临床分离株(70株耐异烟肼,66株耐利福平)的验证。结果Multi—PCR—SSCP方法检测临床分离株基因突变的有效性,以细菌培养和药敏试验结果为金标准。116株临床分离株和H37Rv标准株中除了4株katG缺失突变,其余菌株3个基因katG、inhA和rpoB在单基因PCR中都扩增成功。与H37Rv标准株相比,46株katG基因突变,14株inhA基因突变,58株rpoB基因突变。38株katG和rpoB,4株inhA和rpoB,4株inhA和katG同时突变,还有2株3个基因都有突变。multi—PCR—SSCP对于耐异烟肼和利福平的结核分枝杆菌检出的敏感度分别为80%、82%,特异度分别为100%和92%。结论multi—PCR—SSCP方法敏感、特异,能同时快速有效地检测耐多药结核分枝杆菌,有望成为临床指导用药的好方法,为深入研究耐药基因检测奠定了良好的基础。
- 程晓东杨柳刘家云岳乔红徐修礼马越云彭道荣于文彬苏明权郝晓柯
- 关键词:聚合酶链反应