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一种拟合非加性效应的基因组估计育种值的方法
本发明公开了一种拟合非加性效应的基因组选择新方法。该方法是将基因组选择中的加性效应预测模型和非加性效应预测模型组合成一个预测模型的元算法,这种方法相较于仅拟合加性效应的预测模型通常能够获得更好的预测效果。具体步骤为:获取...
顾林林姜丹方铭王志勇
针对和非加性效应的机器学习的基因组选择方法
本发明公开了一种针对和非加性效应的机器学习的基因组选择方法,通过将非加性效应到GBLUP模型中,使得GBLUP模型的预测准确得到了大幅提升。通过在GBLUP中应用核函数,模型可以更好地模拟基因间的复杂遗传关系和...
赵福平李棉燕王立贤张龙超
阿拉善绒山羊繁殖加性效应和母体效应的方差分量估计
2024年
为了运用ASreml软件结合约束最大似然法(REML)估计阿拉善绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传参数,本研究收集了阿拉善绒山羊种羊场2017-2022年繁殖状记录6517条,拟合了8种不同的单状动物模型,通过LRT检验挑选出最佳模型,使用单状模型对繁殖状进行方差组分和遗传力估计,利用双状模型分析繁殖状之间的表型相关和遗传相关。结果显示:阿拉善白绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传力估计值分别为0.15±0.04、0.16±0.02、0.20±0.06、0.12±0.03、0.14±0.03和0.32±0.05。遗传相关系数的范围为-0.49~0.73,其中产羔数与出生窝重的遗传相关系数最高为0.73,与初生重遗传相关系数最低为-0.49。表型相关的范围为-0.50~0.65,其中断乳窝重与出生窝重的表型相关系数最高0.65,产羔数和初生重的表型相关系数最小-0.50。研究发现,阿拉善绒山羊繁殖状属于低遗传力状且不仅受群别、胎次等非遗传因素的影响,而且所有的状均受到母体效应的影响;产羔数与其他繁殖状之间具有较高的相关表明基于产羔数的选择是有效的,可以提高母羊的整体繁殖能,因此在实际生产过程中可通过提高饲养管理及营养水平来改善阿拉善绒山羊的繁殖能。
李宁吴铁成赵术明王涛朱莉仙赵生国刘斌
关键词:繁殖性状动物模型
玉米马铃薯秸秆混合腐解的非加性效应被引量:1
2023年
有机残体混合分解对陆地生态系统物质循环至关重要,但关于农田生态系统中混合秸秆分解过程的研究仍较缺乏。该研究在玉米(Zea mays)单作、马铃薯(Solanum tuberosum)单作和玉米马铃薯间作小区实验中,设置了为期6个月的玉米秸秆、马铃薯秸秆和玉米马铃薯混合秸秆分解袋填埋实验,通过Biolog-Eco微平板法分析秸秆类型和分解环境对秸秆微生物碳代谢活的影响。结果表明,马铃薯秸秆和玉米秸秆混合对分解过程产生了协同效应,混合秸秆的分解率和微生物代谢活高于单一秸秆,增了微生物对碳水化合物和羧酸类底物的利用。这种协同效应随时间延长而削弱。随机森林模型和结构方程模型分析表明,土壤中溶解有机碳、硝态氮、铵态氮含量以及秸秆碳氮比是驱动秸秆分解的重要因素。总之,秸秆混合促进秸秆分解。
陈林康赵平王顶向蕊龙光强
关键词:间作
一种拟合非加性效应的基因组估计育种值的方法
本发明公开了一种拟合非加性效应的基因组选择新方法。该方法是将基因组选择中的加性效应预测模型和非加性效应预测模型组合成一个预测模型的元算法,这种方法相较于仅拟合加性效应的预测模型通常能够获得更好的预测效果。具体步骤为:获取...
顾林林姜丹方铭王志勇
全基因组关联研究和条件分析揭示非加性效应和族系互作对冠心病的重要(英文)被引量:1
2017年
冠心病(coronary heart disease,CHD)是一个复杂的遗传疾病,其发病率也受生活方式的影响,如吸烟和人体活动。全基因组关联研究已经检测到多个风险基因与冠心病相关联。然而报道的遗传变异仅占表现型变异的一小部分。生活方式对冠心病的影响机制仍然不清。本研究通过引入非加性效应的遗传分析,揭示非遗传的重要,并用条件分析的方法研究了不同生活方式对种族人群遗传变异的影响。使用多族群研究动脉粥样硬化(Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis,MESA)的数据,应用混合线模型分析单核苷酸多态(single nucleotidepolymorphisms,SNPs)变异与冠心病的关联。采用包括、显、上位及族群互作的遗传模型,研究了冠心病的复杂遗传体系。采用6种不同行为(步行,阅读、运输、运动、电视、吸烟)作为条件分析的协变量,探索了人类行为对冠心病的遗传影响。为实现个化治疗的精准诊断,预测了人类不同行为对基因位点的特异遗传效应。总共检测到61个数量状位点(quantitative trait SNPs,QTSs)和23对上位位点,与表现型变异存在显著的相关。采用不同模型估算的遗传率达64.58%~74.94%。我们观察到加性效应贡献只占总遗传率的一小部分(3.45%~5.72%)。相比之下,非加性效应占总遗传率的主要部分。基于不同生活方式的条件分析揭示,不同生活方式对冠心病遗传结构会产生较大影响。4个族群基于7个不同模型的遗传分析揭示,不同种群的冠心病具有显著的遗传特异
丁艺朱军
关键词:冠心病个体化医疗
加性效应增强的过氧化氢消毒方法和装置
一种通过从分解过程的能量和副产物获得加性效应来增强消毒过程的方法。也公开了隐形眼镜消毒系统,其中系统被配置成在隐形眼镜保持和反应室内创建所需提升压强、氧饱和度以及持续过氧化物浓度条件以便通过加性效应来增强消毒。系统被配置...
罗兰兹·W·坎纳
高寒草甸混合凋落物分解及氮、磷释放的和非加性效应研究
凋落物分解是连接着群落地上与地下之间的环节,是生态系统中物质循环和能量流动的重要过程。分解过程中的养分动态影响着土壤营养循环以及土壤质量,进一步影响到地上部分的群落结构等生态系统功能。生态系统是多物种的共存体,所以混合凋...
梁德飞
关键词:凋落物分解物种丰富度物种组成高寒草甸
加性效应增强的过氧化氢消毒方法和装置
一种通过从分解过程的能量和副产物获得加性效应来增强消毒过程的方法。也公开了隐形眼镜消毒系统,其中系统被配置成在隐形眼镜保持和反应室内创建所需提升压强、氧饱和度以及持续过氧化物浓度条件以便通过加性效应来增强消毒。系统被配置...
罗兰兹·W·坎纳
包含非加性效应的多状GBLUP方法及其应用研究
分子辅助育种技术的发展,降低了育种盲目,并提高了作物品种选育的效率。研究表明,用高密度分子标记预测遗传效应具有很高的精度。全基因组选择也是一种标记辅助选择,因为同时使用覆盖全基因组的标记进行预测,所以可以达到更好的预测...
林德周王欣杨泽峰徐辰武
关键词:配合力

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师家勤
作品数:79被引量:9H指数:2
供职机构:中国农业科学院油料作物研究所
研究主题:油菜 分子标记 加性效应 千粒重 甘蓝型油菜
王汉中
作品数:286被引量:2,585H指数:28
供职机构:中国农业科学院油料作物研究所
研究主题:油菜 分子标记 甘蓝型油菜 性状 遗传育种技术
王新发
作品数:232被引量:575H指数:15
供职机构:中国农业科学院油料作物研究所
研究主题:油菜 分子标记 甘蓝型油菜 性状 遗传育种技术
詹杰鹏
作品数:54被引量:11H指数:2
供职机构:中国农业科学院油料作物研究所
研究主题:油菜 分子标记 千粒重 甘蓝型油菜 碱基
刘贵华
作品数:178被引量:648H指数:15
供职机构:中国农业科学院油料作物研究所
研究主题:油菜 分子标记 甘蓝型油菜 性状 主效基因