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分子流行病学: 徐德忠主编; 关键词：流行病学

分子流行病学被引量：1: 1995年; 分子流行病学莫美仪分子流行病学（ＭｏｌｅｃｕｌａｒＥｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ）是应用分子生物学的原理和技术，从分子乃至基因水平上去研究疾病的群体现象及其规律，探索病因，预防疾病的科学。它是近十年来逐步发展形成的流行病学一门新的分支学科。分子流行病学的研...; 莫美仪; 关键词：分子流行病学质粒图谱分析聚合酶链反应

分子流行病学被引量：1: 1992年; 1972年Laver 和Weostel 等用分子病毒学方法,把1968年出现的甲_3 型流感病毒的血凝素H_3 与以往甲_2 型的血凝素H_2 进行比较,与鸭、马的流感病毒血凝素比较,从而提出甲_3 流感病毒可能是甲_2 型病毒和动物流感病毒重组株的设想。1973年在此研究基础上Kilbourne 首先提出“分子流行病学(Molecular epidemiology)”这个名词,迄今已广泛应用。分子流行病学是把分子生物学理论和技术应用于流行病学研究的边缘学科,是对病原学在基因水平上分析其蛋白质和核酸分子结构上的差异。; 刘佩莉; 关键词：分子生物学流行病学

云南大理白族聚集区居民贾第虫分子流行病学调查: 2025年; 目的:了解云南省大理地区白族聚集区居民贾第虫的感染情况及基因型。方法:采集大理白族聚居村村民的粪便标本,设计以贾第虫BG基因序列为基础的引物,将粪便样本中提取的DNA进行巢式聚合酶链反应(PCR)扩增,对扩增后产物进行测序,并对其序列进行同源性比较和基因型分析。结果:596份粪便标本中阳性4份,感染率为0.67%(4/596)。不同性别、民族、年龄分段、职业的贾第鞭毛虫感染率比较,差异均无统计学意义(P=0.938、0.380、0.327、0.113)。序列对比显示有B型和E型2种贾第虫基因型。结论:云南省大理地区白族聚集区居民贾第虫感染率较低,基因型包括B型和E型。; 王秋婷刘晴陈远腾李海龙董玲; 关键词：贾第虫分子流行病学

乙型病毒性肝炎分子流行病学特征及特异性防控策略研究: 2025年; 目前,全球有2.57亿乙型病毒性肝炎(简称乙肝)病毒(hepatitis B virus,HBV)感染者,中国内地地区约有7500万HBV感染者,>30岁人群HBV感染率为7.54%。HBV感染在中国,农村地区高于城市,中部和南部地区感染率最高。HBV在全球有10个基因型,中国以B和C基因型为主。B型易在年轻人群横向传播,造成急性乙肝;C型易在家庭内传播,导致肝硬化和肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)。乙肝疫苗可有效预防HBV慢性感染、肝硬化和HCC。HBV慢性感染约占中国HCC病因的84.4%。HBV通过病毒复制、变异和基因组整合发挥促癌作用。HBV的复制激活并维持了炎症微环境,后者诱导并选择了体细胞变异和病毒变异。与野生型HBV相比,变异型促癌能力更强,主要通过激活关键信号通路促使炎症微环境中的变异细胞逆向分化;HBV整合失活肿瘤抑制基因,激活端粒酶逆转录酶使肝细胞具有选择性生长优势。HCC高危HBV变异能够预测HCC发生、预后以及抗病毒的预防效果。抗病毒治疗降低了HCC的发生和术后复发,特别是通过抑制HBV核心启动子区变异发挥促癌作用,实现对HBV相关HCC的特异性防控。; 陈一凡曹广文; 关键词：乙型肝炎病毒肝细胞癌

2022—2023年我国GII.3[P12]诺如病毒暴发分子流行病学特征: 2025年; 目的了解2022—2023年我国诺如病毒急性胃肠炎暴发及聚集性疫情GII.3[P12]重组株的分子进化特征。方法收集2022年至2023年诺如病毒暴发及聚集性疫情流行病学信息、病例信息、临床样本以及检测和基因分型信息;对GII.3[P12]重组株阳性样本进行核酸提取、全基因组扩增及序列分析;利用同源模拟方法,构建三维结构并预测抗原表位。结果2022年1月至2023年12月,我国诺如病毒暴发监测网络共报告1136起诺如病毒暴发及聚集性疫情,942起疫情成功获得基因型分型结果,以GII为主,占76.0%(716/942),GI和混合基因型占比分别为15.8%(149/942)和8.2%(77/942)。GII引起的诺如病毒疫情以GII.3[P12]为主(22.5%,161/716),其他主要基因型包括GII.17[P17](18.7%,134/716)、GII.4_Sydney 2012[P16](11.6%,83/716)和GII.6[P7](11.3%,81/716)。2022—2023年GII.3[P12]引起的疫情集中发生在2~3月份(54.0%,87/161),主要暴发场所为托幼机构和小学(87.5%),传播途径以人传人为主(68.9%),3~7岁儿童为主要易感人群(93.3%)。本研究获得25株GII.3[P12]重组株基因组序列,根据系统进化分析表明,我国2022—2023年GII.3[P12]重组株属于Cluster IV簇的sublineage b(7株)和sublineage c(18株)。通过表位预测分析,共预测得到11个线性表位和8个构象性表位,预测得到的线性表位与构象性表位存在重合位置,每一个构象性表位都是预测的线性表位的一部分,其潜在的抗原结合位点与受体结合位点均保守。结论GII.3[P12]重组株是2022—2023年引起我国诺如病毒暴发及聚集性疫情的流行株之一,其基因组未发生明显变异。; 曹丽娇杨艳辉杨舒婷章青孔翔羽王宏靳淼段招军; 关键词：诺如病毒基因型分子进化表位预测

头孢他啶/阿维巴坦耐药CRKP临床分离菌株的分子流行病学特征: 2025年; 目的分析头孢他啶/阿维巴坦耐药(简称CZA)的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)临床分离菌株分子流行病学特征。方法选取2022年1月-2023年12月南昌大学第一附属医院住院患者首次分离的非重复CZA耐药的CRKP 63株和随机选取CZA敏感的CRKP 50株,对药物敏感性进行分析。同时,采用聚合酶链反应(PCR)检测细菌耐药基因、毒力基因及荚膜血清型。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)等分子生物学技术,分析以上菌株分子流行病学特性。结果 CZA耐药的CRKP菌株主要分离于痰液(n=45,71.43%)。药敏结果显示CZA耐药菌株对阿米卡星、氨曲南及米诺环素的耐药率低于CZA敏感菌株(P<0.05),CZA耐药菌株对替加环素的耐药率高于敏感菌株(P<0.05)。CZA耐药CRKP菌株中bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(SHV-1)、bla_(TEM-1)、bla_(CTX-M)、bla_(qnrS)、bla_(acc(6′)-Ib)、bla_(rmtB)基因携带率较高。荚膜血清型K64型(n=18,28.57%)检出最多,CZA耐药CRKP菌株中ST11(n=25,39.68%)为优势流行菌株。结论 CZA耐药CRKP菌株以ST11型为主,均携带多种耐药基因及毒力基因,应加强防控。CZA耐药菌株对替加环素的耐药率较敏感组高,因此临床治疗时需要格外注意。; 张文震邓雅杰胡火利曾凌刘蓬魏丹丹徐新平黎萍康秀华; 关键词：分子流行病学

2020—2022年郑州市食源性疾病致泻大肠埃希菌分子流行病学特征被引量：1: 2025年; 目的调查2020—2022年郑州市食源性疾病监测哨点医院分离到的致泻大肠埃希菌(DEC)的分子流行病学特征。方法收集来自郑州市5家哨点医院60818份腹泻患者粪便标本,通过生化试验和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对可疑DEC菌株进行鉴定,采用微量肉汤最低抑菌浓度法、多重PCR技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对DEC分别进行药敏试验、毒力基因检测和分子分型,通过聚类分析比对DEC之间的相关性。结果共检出73株DEC阳性菌株,阳性率0.12%。DEC阳性病例男、女比例为1.52∶1(44/29),以21~<31岁为主(22例,30.14%);发病时间集中在6—8月。可疑暴露食品中肉与肉制品占比最高(21.92%)。共检出3种致病型,分别为肠道集聚性大肠埃希菌(EAEC)45株(61.64%)、产肠毒素大肠埃希菌(ETEC)20株(27.40%)和肠道致病性大肠埃希菌(EPEC)8株(10.96%)。73株菌株对氨苄西林、萘啶酸、四环素的耐药性较高,耐药率分别为79.45%、57.53%、54.79%,对亚胺硫霉素100.00%敏感。45株EAEC分为43个PFGE带型,相似度20.17%~94.29%。结论2020—2022年郑州市食源性致泻大肠埃希菌致病型以EAEC为主,PFGE带型分散,未发现聚集,耐药性严重。; 兰培利赵瑞臻戴蕾程春荣周鹏炊慧霞; 关键词：食源性疾病致泻大肠埃希菌分子流行病学

湖州市某三甲医院住院患者艰难梭菌毒素基因检测及其分子流行病学分析: 2025年; 目的研究地市级医院住院患者艰难梭菌感染的发生情况,并分析艰难梭菌的分子流行病学特征。方法收集湖州市第一人民医院2023年11月—2023年12月住院腹泻患者粪便标本,培养分离艰难梭菌后,采用核酸扩增技术检测毒素基因,菌株经全基因测序后(Whole Genome Sequencing,WGS)进行分子流行病学分析。结果从500份住院患者腹泻样本中分离得到49株艰难梭菌,其中产毒型艰难梭菌40株,艰难梭菌感染(Clostridium difficile infections,CDI)阳性率为8.00%;PCR检测的毒素基因主要为tcdA(+)/tcdB(+),双毒素基因阴性(A+B+CDT-),占97.50%(39/40),1株携带双毒素基因(A+B+CDT+);CDI阳性率最高的科室是消化内科,其次为ICU;MLST分型中,共有13种ST型别,其中ST2型为优势型别,占30.00%;结合WGS数据分析,未发现艰难梭菌菌株在研究期间发生流行和传播。结论本院CDI在住院腹泻患者中的发生率较低,未发生院内感染传播和暴发流行现象,但不排除存在未知感染源可能性,应重点关注重点科室,如ICU患者发生CDI情况。; 郑莉莉强鑫华嵇龙飞; 关键词：住院患者艰难梭菌毒素基因分子分型

佛山地区女性人乳头状瘤病毒感染的分子流行病学研究: 2025年; 目的了解广东佛山市女性群体人乳头瘤病毒(HPV)感染类型情况。方法收集佛山复星禅诚医院2019—2021年进行HPV分型检测的21752例女性健康体检者及门诊人群,利用聚合酶链反应(PCR)-反向斑点杂交法进行HPV感染检测,记录HPV亚型感染情况、年龄及临床诊断。结果2019—2021年佛山地区女性群体HPV总体感染为20.86%,HPV 52、58、16、51、68、53亚型感染最为常见,以单一感染为主。体检和门诊人群中感染率分别为14.68%和23.47%。2019、2020及2021年体检及门诊女性人群HPV的总体感染率分别为25.16%、19.59%和18.51%。不同年龄HPV感染率均呈“U”型。阴道炎和宫颈炎女性患者年龄段大多在25~36岁,以HPV 52、16、58和51亚型引起的单一感染为主。宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)好发于46~55年龄段,以单一感染HPV为主。结论2019—2021年佛山市女性HPV感染模式具有明显的年龄差异,3年感染率逐年下降,HPV 52、58、16、51、68、53亚型感染及单一感染较为常见。HPV 16、18、52、53、L6亚型与宫颈疾病之间呈正相关。; 刘建雷何春梅薛家权林爱萍余俊健杨康; 关键词：基因分型流行病宫颈疾病

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