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利用SSR分子标记分析玉米种质资源的遗传多样性
2025年
种质资源的遗传多样性是育种工作的重要物质基础,在玉米新品种选育和品种改良中发挥着十分重要的作用。为确保种质资源的合理利用,利用40对SSR引物对342份玉米新种质进行了遗传多样性分析。结果表明:共检测出205个等位基因位点,每对引物可检测到的等位基因数在2~8个之间,平均为5.125个;有效等位基因数为1.656~7.664,平均为4.658;多态性信息含量为0.318~0.855,平均为0.722。通过邻接法聚类分析,将342份玉米种质划分为6个类群,其中来源明确的玉米种质和标杆自交系的类群归属与系谱完全吻合。该批种质材料研究结果可以为玉米育种中种质创新、组合选配提供丰富的种质资源和有用的遗传信息。
闫雪纯马昕兰进好
关键词:玉米种质资源SSR分子标记
基于表型和分子标记分析24份巴戟天遗传多样性
2024年
【目的】广东省德庆县是道地药材巴戟天的产地,该文对广东德庆不同地区的24份巴戟天进行了种质资源的遗传多样性分析。【方法】以德庆县各地收集来的24份巴戟天资源为研究对象,使用主成分分析和SRAP、CDDP两种分子标记方法对24份巴戟天材料进行遗传多样性分析。【结果】在表型分析中,基于主成分分析的聚类图发现,官圩镇和高良镇、凤村镇和高良镇分别聚类至4个类群中。此外,18对SRAP引物组合和16条CDDP引物扩增后分别获得100条和98条总条带,其中SRAP多态性条带为50条,多态性比率达50%,平均遗传相似系数(GS)为0.87,遗传相似系数变化范围为0.71~0.97;CDDP多态性条带为80条,条带之间多态性比率达79.0%,各种质间遗传系数范围为0.71~0.96,平均遗传相似系数为0.86,且当系数为0.82时,两种分子标记结果均表明高良镇、官圩镇和凤村镇的种质之间具有一定的相似性。【结论】结合表型和分子标记聚类结果,高良镇和官圩镇、高良镇和凤村镇的亲缘关系最近,SRAP和CDDP两种分子标记方法对巴戟天遗传多样性的结果具有一定的差异,而联合分析可以更好地反映巴戟天遗传多样性研究及其资源的系统发育关系。
何磊刘风民冯月燕王梓鉴陈纪言张伟丽
关键词:巴戟天SRAP分子标记
一种奶山羊基因组分子标记分析系统
本发明涉及牲畜育种与生物技术领域,且公开了种奶山羊基因组分析系统,包括基因分子标记模块,所述基因分子标记模块的内部设有基因存储模块,所述基因存储模块的输出端与云计算数据中心的输入端之间电连接,所述云计算数据中心的输入端与...
王建光张蕾李淑文马环宇
基于SCoT分子标记分析白术种质资源遗传多样性及DNA指纹图谱构建
2024年
【目的】采用SCoT分子标记技术对17份白术种质资源进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建,为白术种质的鉴定、保存和新品种选育提供一定的理论依据。【方法】从92条SCoT引物中筛选得到13条核心引物用于白术分子标记,利用Popgene1.32软件和NTSYS-pc 2.10e软件进行白术种质资源多样性分析和聚类分析,以核心引物SCoT-9、SCoT-12和SCoT-41组合构建白术DNA分子指纹图谱。【结果】13条SCoT核心引物扩增17份白术样品共得到192条条带,其中,多态性条带165条,平均百分率85.94%;遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD)分别介于0.5781-0.8750和0.1335-0.5480,白术种质的观测等位基因数(Na)为1.8594,有效等位基因数(Ne)为1.4180,Nei's遗传多样性指数(He)为0.2563,Shannon信息指数(I)为0.3968,聚类分析得到白术栽培品一类,而大围山野生品被单独聚为一类;所构建的17份白术种质资源DNA指纹图谱,可以将样品区分并准确鉴定。【结论】白术种质资源具有较为丰富的遗传多样性,但不同产地白术栽培品之间遗传差异低,表明地理位置并不是判断白术亲缘关系远近的决定性因素。
李晴石雨荷朱珏李晓玲侯超文童巧珍
关键词:白术遗传多样性分析DNA指纹图谱
基于SSR分子标记分析石阡茶树资源遗传多样性
2024年
[目的]探明石阡茶树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为开发和保护石阡茶树资源提供理论依据。[方法]利用SSR分子标记技术,对贵州石阡7个茶树群体122份资源进行SSR位点多态性、遗传多样性及亲缘关系分析,并对不同地域来源的石阡茶树资源进行遗传距离分析。[结果]21对SSR引物共扩增出72个多态性位点,每对引物平均扩增3.43个位点,多态信息含量(PIC)为0.19~0.76,平均为0.51,等位基因在群体中分布均匀且多态性较高。7个茶树群体的Nei’s基因多样性指数(H)均值为0.22,Shannon信息指数(I)均值为0.33,多态位点百分率(PPB)均值为75%,遗传距离为0.0177~0.1036。122份石阡茶树资源的遗传距离为0.10~0.67,当遗传距离为0.21时,分为3个大类群:第I类群包含113份资源,第Ⅱ类群仅有1份茶树资源(SWXD009),第Ⅲ类群包含8份茶树资源,分别是SWXD-B、SWXD-F、SWXD-H、SWXD-M、SQT3、SQT4、SWX005和SWX006;在3个大类群中均有五德镇长兴村的茶树资源。[结论]贵州石阡茶树群体间的遗传差异较小,但群体内个体单株之间具有一定的遗传差异,尤其是五德长兴茶树群体内的遗传背景较丰富,筛选优异资源的基础较好。
林开勤李悦欣魏杰汪安然喻云春段长流王枫鄢东海
关键词:茶树种质资源SSR分子标记
小麦种质资源穗发芽抗性鉴定和分子标记分析
2024年
为了鉴定小麦种质资源的穗发芽抗性,筛选出有效的抗穗发芽分子标记,进而挖掘优异白粒小麦抗穗发芽种质资源,本研究通过整穗发芽试验对222份小麦种质资源进行穗发芽抗性鉴定,并利用myb10D、DFR-B、Vp1B3、PM19-A1、MFT-3A、MFT-A2、MKK3-A和QSD1等8个抗穗发芽基因的功能分子标记对供试材料进行基因型检测。表型鉴定结果表明,222份小麦种质资源材料的相对穗发芽率存在显著差异,相对穗发芽率变化范围为0~1.15,平均相对穗发芽率为0.73,鉴定出抗穗发芽小麦材料38份,其中包括白粒小麦9份、红粒小麦27份、黑粒小麦2份。等位基因类型与相对穗发芽率相关性分析表明,相对穗发芽率与功能标记myb10D、DFR-B、Vp1B3、MFT-3A和MFT-A2呈极显著相关,而与PM19-A1、MKK3-A和QSD1相关性不显著,说明myb10D、DFR-B、Vp1B3、MFT-3A和MFT-A2等分子标记可用作小麦抗穗发芽基因型检测和分子标记辅助育种。综合表现型和基因型结果,筛选出豫农914、豫农946、丰德存麦30、泛麦5号、徐麦029、连麦1901、保丰1903、郑麦829、13网27-8等9份抗穗发芽白粒小麦种质资源,可用于小麦抗穗发芽遗传育种和抗穗发芽品种布局。
龚承儒袁雨豪刘振郑继周田志成刘胜利沈庆花黄振朴董纯豪高艳李巧云唐建卫焦竹青殷贵鸿
关键词:小麦种质资源穗发芽分子标记
小麦主推品种‘百农207’和‘百旱207’表型比较与分子标记分析
2024年
‘百农207’是目前黄淮南部麦区及河南省大面积种植的小麦品种。本试验利用表型、品质性状及分布于小麦全基因组的SSR和STS分子标记对‘百农207’及其系选品种‘百旱207’进行比较分析,以期为小麦育种亲本选配及新品种培育提供参考。分析结果表明,‘百农207’的株高(70.33 cm)显著低于‘百旱207’(79.17 cm);‘百农207’的穗粒数(49.88粒)、可育小穗数(21.50个)和总小穗数(23.67个)均高于‘百旱207’,但后者的千粒重(44.48 g)高于前者(37.24 g);‘百农207’的籽粒粗蛋白含量、湿面筋含量、淀粉含量、沉降值、出粉率及硬度指数均显著高于‘百旱207’。分子标记检测结果表明,485对引物中仅有62(12.8%)对在‘百农207’和‘百旱207’间存在差异,其中基因组SSR、EST-SSR和STS引物分别有46、3和13对。2个品种在D基因组的多态引物比例最高(21.3%),A和B基因组的多态引物比例基本一致(分别为11.5%和11.4%)。进一步分析它们在7个部分同源群及染色体水平的遗传差异,发现二者在第1、3和5部分同源群多态引物比例相对较高,分别为16.0%、16.3%和16.9%,而二者在7D染色体的遗传差异最大,多态引物比例达到50.0%。‘百农207’和‘百旱207’差异的染色体位点可能与品种具有的优良特性密切相关。
徐鑫付庆云袁嘉微孙京京余海鋆孙国鹏李小军
关键词:农艺分子标记
基于ISSR分子标记分析葱属植物遗传多样性的方法
本发明提供了一种基于ISSR分子标记分析葱属植物遗传多样性的方法,属于植物多样性分析技术领域。本发明以西藏自治区22份葱属植物为材料,进行生物学性状的调查及ISSR分子标记遗传多样性的研究,通过对不同地区不同种类的葱属植...
王怀凤永毛王陆洲蒋兵涛王世彬许琳玉李焕秀唐懿
基于表型性状鉴定及SSR分子标记分析芜菁种质资源遗传多样性
2024年
【目的】分析新疆地方芜菁种质资源的遗传多样性,为芜菁新品种的研发及芜菁产品的开发应用提供依据。【方法】以74份新疆地方芜菁种质资源为材料,分别利用形态学性状和SSR分子标记分析营养生长期的表型性状鉴定和遗传多样性。【结果】74份芜菁种质资源的主要质量性状具有丰富的变异,其变异系数为14.1%~421.1%,数量性状的变异系数为7.9%~31.6%。株高、株幅与叶长、叶宽、叶柄长均成显著相关或极显著相关。肉质根纵径和肉质根横径与单根重呈极显著相关。在欧氏距离为15时可将供试材料分为4个类群,第一类主要特征为子叶大、基生叶数多,肉质根大,单根最重;第二类群小裂片对数较多,株高较高;第三类群叶片和株幅较大,单根重适中;第四类群子叶、叶片较小,株高较低,单根重较低。74份芜菁资源分为三大类,大部分同一来源地的资源聚在一个类群中。【结论】新疆地方芜菁种质资源具有较丰富的遗传多样性。
王帆李玉姗王威邓超宏邓超宏马越赵连佳庄红梅许红军
关键词:芜菁表型性状SSR
萝卜种质亲缘关系的分子标记分析被引量:3
2023年
本研究以118个分子标记在108份萝卜种质中进行筛选,得到56个带型清晰、多态性好的标记用于亲缘关系分析。用这56个标记共扩增出130条多态性条带,每个标记2~5条,平均2.3条;观测等位基因数的平均值为2.3214,有效等位基因数的平均值为1.8643,Nei基因多样性指数的平均值为0.4573,Shannon多态性指数的平均值为0.6766,PIC值介于0.29~0.55之间。UPGMA聚类和PCA分析结果较为一致,在遗传相似系数为0.61处可将108份种质分为4大类,黑皮白肉萝卜、樱桃萝卜、心里美类型萝卜种质各聚为一类,其余种质聚为一类,表明萝卜种质亲缘关系与肉质根皮色、肉质色、大小的联系较密切。
刘辰付卫民刘贤娴徐文玲郭栋王淑芬
关键词:萝卜亲缘关系分子标记聚类分析

相关作者

王燕
作品数:95被引量:273H指数:10
供职机构:南京农业大学
研究主题:萝卜 基因 疫霉菌 抗病性 植物抗病性
庄丽芳
作品数:50被引量:154H指数:8
供职机构:南京农业大学农学院作物遗传与种质创新国家重点实验室
研究主题:普通小麦 百萨偃麦草 小麦 染色体 分子标记
李晓慧
作品数:182被引量:617H指数:13
供职机构:河南省农业科学院
研究主题:西瓜 甜瓜 选育 SRAP 蔬菜生长
亓增军
作品数:99被引量:414H指数:12
供职机构:南京农业大学
研究主题:小麦 普通小麦 百萨偃麦草 染色体 黑麦
李建粤
作品数:83被引量:312H指数:11
供职机构:上海师范大学生命与环境科学学院
研究主题:水稻 分子标记 反义蜡质基因 基因 食味品质