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一种用于猴痘病毒基因组扩增的引物及其应用
本发明属于基因检测领域,具体涉及一种用于猴痘病毒基因组扩增的引物及其应用。本发明提供了一种用于猴痘病毒基因组扩增的引物,所述引物包括:第一引物,其包括选自如SEQ ID NO:1‑178所示的序列中的至少两种...
宋玉凤刘燕霞田谷王雷张志强
在确定性限制性位点基因组扩增(DRS-WGA)之后分析杂合性缺失(LoH)的方法
公开了一种分析包含基因组DNA的至少一个样本中的杂合性缺失(LoH)的方法,该方法包括以下步骤:a.提供所述包含基因组DNA的至少一个样本;b.进行所述基因组DNA的确定性限制性位点基因组扩增(DRS‑WGA);c.由...
尼科洛·马纳雷西玛丽安娜·加龙齐阿尔贝托·费拉里尼克劳迪奥·福尔卡托
以细胞培养液为模板进行基因组扩增的方法
本发明提供了一种以细胞培养液为模板进行基因组扩增的方法,本发明通过模拟不同细胞培养液进行基因组扩增,确定了优化的基因组扩增试剂和程序,实现了对多种培养液细胞或者微量基因组模板的有效扩增。对基因组扩增产物质检、建库...
齐明霞何文龙庄志华王春香
一种单细胞基因组扩增产物的质控方法
本发明涉及对单细胞基因组扩增产物进行质控的方法和系统,包括对不同染色体片段进行检测。本发明还涉及所述方法中所用的试剂。
卢大儒杨敬敏糜利敏任丁顾金凤王婕
基于纳米孔测序的猪流行性腹泻病毒基因组扩增引物和方法
本发明提供了一种猪流行性腹泻病毒基因组扩增引物和方法。猪流行性腹泻病毒的检测引物包括60对扩增引物,具体序列如SEQ ID NO.1~120所示。本发明提供的检测引物可以实现对猪流行性腹泻病毒的较均匀覆盖,在纳米...
王连想李群辉林丽苗赵海参麦凯杰任柏桦申翰钦卢立康
一种靶向基因组扩增检测装置及其应用
本发明提供了一种靶向基因组扩增检测装置及其应用。本发明首先提供一种靶向基因组扩增检测用合物,其包括:针对待测样本中目标基因上下游2M区域设计的靶向引物;以及基因组扩增用试剂。本发明利用靶向基因组扩增技术结合高通...
高伟代玉环高芳芳任军
基因组扩增引物合物、试剂盒和方法
本发明涉及一种基因组扩增引物合物、试剂盒和方法,试剂盒中基因组扩增引物合物包括序列如SEQ ID No.1所示的预扩增引物和SEQ ID No.2所示的扩增引物。本发明采用特殊引物多重退火成环扩增技术,实现单个细...
杨超凡海峰朱波风宗果
不同单细胞基因组扩增体系扩增牛微量血液DNA效果评价
2024年
旨在通过二代测序技术评估不同单细胞基因组扩增(single cell whole genome amplification,scWGA)体系对牛微量血液基因组DNA的扩增效果,建立微量DNA基因组扩增体系。本研究分别采用MDA(multiple displacement amplification)和MALBAC(multiple annealing and looping-based amplification cycles)两种scWGA体系对华西牛1 ng血液基因组DNA进行基因组扩增,随后基于两种体系的扩增产物以及原始未稀释血液DNA构建测序文库,利用DNBSEQ-T7RS测序平台进行基因组测序(whole genome sequencing,WGS),通过比较扩增产物片段大小、浓度、总质量评估扩增效率,通过分析GC含量、测序覆盖度、基因分型一致率、基因型检出率等评估两种体系的扩增效果。结果显示,MDA体系的扩增产物片段大于MALBAC体系(8 kb vs.0.2~2 kb),产物浓度和总质量显著高于MALBAC体系(P<0.05)。基于测序数据,1×和5×测序深度下,MDA体系的基因组覆盖度显著高于MALBAC体系(P<0.05),此外,MDA体系的分型一致率、检出率显著高于MALBAC体系,而等位基因缺失率、假阳性率显著低于MALBAC体系(P<0.05)。综上,本研究揭示了MDA和MALBAC两种扩增体系基于华西牛1 ng血液基因组DNA扩增的体系特点,为改进现有华西牛胚胎基因组选择中的关键扩增技术提供理论依据,促进华西牛遗传育种进展。
牛一凡李崇阳杨柏高张培培张航冯肖艺曹建华余洲马友记赵学明
关键词:全基因组扩增MDA
基于纳米孔测序的猪流行性腹泻病毒基因组扩增引物和方法
本发明提供了一种猪流行性腹泻病毒基因组扩增引物和方法。猪流行性腹泻病毒的检测引物包括60对扩增引物,具体序列如SEQ ID NO.1~120所示。本发明提供的检测引物可以实现对猪流行性腹泻病毒的较均匀覆盖,在纳米...
王连想李群辉林丽苗赵海参麦凯杰任柏桦申翰钦卢立康
山东、广西地区新型鹅细小病毒基因组扩增及遗传进化分析被引量:1
2024年
为监测新型鹅细小病毒(Novel goose parvovirus,NGPV)的流行和变异情况,研究采集了山东和广西部分地区的鸭短喙综合征病料进行病原检测、基因组扩增及序列比对分析。结果显示:共分离两株NGPV,山东分离株命名为SD202304,广西分离株命名为GX202304,两株病毒与2021年NGPV分离株HNXY21亲缘关系最近,基因组序列相似性为99.1%;GX202304株末端重复序列(Inverted terminal repeat,ITR)有一段未见报道的51 bp基因插入;VP3编码氨基酸序列比对显示,在第290位GX202304株和SD202304株有一个苏氨酸到丙氨酸的突变,这是NGPV近年来发生的新变异位点。研究表明,从山东、广西地区分离到的两株NGPV存在51 bp新的基因插入片段和VP3新的突变位点,结果为我国NGPV感染的防控提供科学依据。
乔丹丹刘婷隽陈全刚李德宝周婕董淑红胡安康
关键词:全基因组序列

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陈玲
作品数:87被引量:294H指数:10
供职机构:南方医科大学
研究主题:法医物证学 STR STR基因座 法医学 全基因组扩增
王慧君
作品数:165被引量:805H指数:17
供职机构:南方医科大学
研究主题:甲基苯丙胺 法医病理学 法医学 司法鉴定 神经毒性
刘超
作品数:403被引量:1,130H指数:17
供职机构:南方医科大学
研究主题:法医物证学 法医学 STR基因座 法医病理学 复合扩增
沈晓婷
作品数:43被引量:112H指数:7
供职机构:南京中医药大学
研究主题:植入前遗传学诊断 多重置换扩增 体外受精-胚胎移植 短串联重复序列 单体型分析
杨电
作品数:66被引量:229H指数:10
供职机构:广州市公安局
研究主题:法医物证学 DNA STR基因座 遗传多态性 DNA检验