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利用帕累托原理推断细胞为适应特定环境代谢的权衡与代谢途径的调控
2025年
探讨在资源有限的情况下细胞体内代谢在多种反应中的权衡关系,以及不同细胞对这些代谢途径的依赖程度。为达成上述目的,采用了帕累托前沿概念,利用多边形或多面体来表征性状空间中的最佳权衡表型。利用帕累托任务推理方法(ParTI方法)分析实验得到的437个细胞样本的代谢量数据,重点关注了5种不同的反应。分析过程揭示了生物体细胞内代谢在这5种不同反应中的代谢量分布存在权衡关系。此外,还通过富集分析,进一步揭示了436个菌株和1个人类细胞对这5种代谢途径的依赖程度。结果表明,在资源有限的环境中,生物细胞为了存活和繁殖,其代谢在多种反应中需要作出权衡。这种权衡关系对于理解生物如何适应特定环境,以及如何通过调控代谢来优化生物性能具有重要的指导意义。
郑俊申铁
关键词:代谢途径富集度
一种用于空间代谢分析的植物质谱数据图像配准方法
本发明公开了一种用于空间代谢分析的植物质谱数据图像配准方法,包括:获取待分析的质谱数据图像组,质谱数据图像组由时间段内不同时间点的质谱数据图像构成;确定fixed图像和moving图像;对fixed图像和moving图...
申铁许余云徐云飞
一种检测肌肉生长抑制素基因在α-亚麻酸代谢中作用的方法
本发明提供了一种检测肌肉生长抑制素基因在α‑亚麻酸代谢中作用的方法,属于基因检测技术领域。本发明提供了一种检测肌肉生长抑制素基因在α‑亚麻酸代谢中作用的方法,将基因编辑和非靶向代谢检测方法结合起来,用来验证Mstn...
李奎黄雷卫孟瑶
饲粮NFC/NDF比例对奶牛瘤胃中微生物尿素氮代谢的影响
2025年
旨在探究改变饲粮NFC/NDF比例模拟不同能量供应速度,阐明能量供应对瘤胃微生物尿素氮利用效率和尿素氮代谢向的调控作用,为尿素高效利用提供参考。通过体外发酵技术,将40个发酵瓶随机分为4组(n=10),为扣除15 N本底值,每组添加常规尿素(n=5)和15 N-尿素(n=5,15 N 15 N-尿素丰度:99.08 atom%),每组NFC/NDF比例分别为0.89、1.10、1.33和1.66。进行24 h体外发酵,并采集发酵液分析发酵参数、微生物15 N丰度以及15 N代谢。结果表明,随着饲粮中NFC/NDF比例的增加,微生物蛋白质产量和尿素氮利用率呈线性增加(P<0.05)。代谢组分析表明,饲粮中NFC/NDF比例改变了瘤胃微生物的嘌呤代谢、氨循环、谷氨酸代谢代谢途径。15 N标记代谢分析表明,尿素氮向34种含氮化合物,涉及氨基酸、核苷酸和能量代谢。随着饲粮NFC/NDF比例上升,尿素氮更多向脱氧胸苷酸、UDP-葡萄糖和氨基酸等代谢物,从而活化了氨基酸和核苷酸代谢途径。在本试验的体外条件下,饲粮快速发酵碳水化合物比例的增加能促进尿素氮向微生物氨基酸和核苷酸转化,进而提高尿素氮利用率和微生物蛋白产量。
张仕琦郑楠王加启赵圣国
关键词:奶牛瘤胃微生物尿素氮同位素标记
空间分辨代谢组学分析方法揭示肿瘤宿主代谢相互作用
代谢重编程是恶性肿瘤的重要标志,肿瘤代谢重编程对宿主全身代谢产生广泛影响。了解肿瘤与宿主之间的代谢相互作用对于深入理解肿瘤发展机制、发现新的治疗靶点、制定个体化治疗策略具有重要意义。目前,肿瘤对全身代谢的影响仍然知之甚少...
王相宜
关键词:代谢组学
应用代谢组学及代谢技术探究IPF小鼠肺组织代谢变化规律
第一部分建立非靶向代谢组学数据库探究肺组织生理状态节律变化规律研究背景及目的生物节律自20世纪初被发现以来受到广泛关注。生理状态下,光照、饮食、睡眠等可以通过调节节律基因的转录翻译及激素的分泌使得机体发生24小时昼夜节律...
孙维
关键词:IPF节律变化
基于代谢和转录组研究陆生伊萨酵母降解柠檬酸途径
高含量柠檬酸水果的加工产品酸感尖锐,很难被消费者喜爱,所以在生产加工过程中常需进行降酸操作。酵母是典型的生物降酸剂之一,近年来,关于酵母降酸的研究也越来越多。本实验室前期筛选分离出一株降解柠檬酸能力良好的非酿酒酵母菌株,...
梅佳佳
关键词:转录组学基因表达量
高产熊果酸酿酒酵母菌株构建及代谢优化
梁志鹏
一种基于代谢调控的肠道菌群定向扩增的方法
本发明提供了一种基于代谢调控的肠道菌群定向扩增的方法,该方法利用代谢组学和功能基因组学方法评估肠道菌群的代谢功能和代谢途径,结合代谢调控策略,实现对目标菌群的有针对性的扩增和定向定殖,用于调控因子的筛选,和解决粪菌移...
向沙沙朱炫陈杰苏晓明石丽华张亚林
一种覆盖多种代谢物的代谢组和代谢分析方法和试剂盒
本发明公开了一种针对生物样品中含有羰基、含有羧基和含有磷酸基的多种代谢物的代谢组和代谢分析方法及用于该方法的试剂盒。所述方法采用3‑硝基苯肼对代谢物进行衍生化后通过液相色谱质谱联用技术检测羰基、羧基和磷酸基代谢物。本发...
胡泽平孟祥骏庞欢欢

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陈宁
作品数:439被引量:1,368H指数:17
供职机构:天津科技大学生物工程学院
研究主题:发酵 谷氨酸棒杆菌 黄色短杆菌 大肠杆菌 发酵条件
徐庆阳
作品数:599被引量:687H指数:13
供职机构:天津科技大学
研究主题:发酵 基因工程菌 生产菌株 大肠杆菌 谷氨酸棒杆菌
谢希贤
作品数:409被引量:410H指数:11
供职机构:天津科技大学
研究主题:基因工程菌 发酵 大肠杆菌 谷氨酸棒杆菌 发酵液
庄英萍
作品数:491被引量:1,299H指数:17
供职机构:华东理工大学
研究主题:发酵 发酵过程 毕赤酵母 红霉素 发酵生产
储炬
作品数:520被引量:1,354H指数:16
供职机构:华东理工大学
研究主题:发酵 发酵过程 毕赤酵母 红霉素 生物合成